vault backup: 2025-12-14 22:41:11

content/Biokemi/Cellulära processer/DNA replikation/Instuderingsfrågor.md

@@ -5,7 +5,60 @@
 #### Vad är processivitet? Hur kan en sliding clamp stimulera processivitet?
 #### Vad är ett primas? När behövs ett sådant enzym?
 #### Hur går “Okazaki fragment maturation” till i våra celler?
-#### Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?
+#### Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?### Förklara begreppen replikationsbubbla och replikationsgaffel
+```spoiler-block:
+Replikationsbubbla är området där DNA öppnats kring ett origin; replikationsgaffel är varje Y-formad ände där DNA syntetiseras.
+```
+
+### Var är ett origin of replication?
+```spoiler-block:
+En specifik DNA-sekvens där replikation initieras och DNA öppnas.
+```
+
+### Hur skiljer sig DNA-syntes på leading och lagging strand?
+```spoiler-block:
+Leading strand syntetiseras kontinuerligt; lagging strand syntetiseras diskontinuerligt som Okazaki-fragment.
+```
+
+### Vilken funktion har 3’→5’-exonukleasaktiviteten hos DNA-polymeraser?
+```spoiler-block:
+Proofreading; avlägsnar felinkorporerade nukleotider och ökar noggrannheten.
+```
+
+### Vad är processivitet och hur stimulerar sliding clamp detta?
+```spoiler-block:
+Processivitet är hur många nukleotider som adderas per bindning; sliding clamp håller polymeraset kvar på DNA.
+```
+
+### Vad är ett primas och när behövs det?
+```spoiler-block:
+Ett RNA-polymeras som syntetiserar primers; behövs för att starta DNA-syntes.
+```
+
+### Hur går Okazaki fragment maturation till?
+```spoiler-block:
+RNA-primer tas bort, gap fylls med DNA och fragmenten ligeras ihop.
+```
+
+### Vilka aktiviteter har exonukleas respektive endonukleas?
+```spoiler-block:
+Exonukleas tar bort nukleotider från ändar; endonukleas klyver inom en nukleotidkedja.
+```
+
+### Hur fungerar helikas?
+```spoiler-block:
+Använder ATP för att separera DNA-strängarna genom att bryta vätebindningar.
+```
+
+### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner och vad heter de i våra celler?
+```spoiler-block:
+Stabiliserar ssDNA och förhindrar återparning; i eukaryoter heter de RPA.
+```
+
+### Varför bildas positiva supercoils och hur tas de bort?
+```spoiler-block:
+De bildas framför replikationsgaffeln vid uppvridning; topoisomeraser avlägsnar dem genom att klyva och återligera DNA.
+```
 #### Hur fungerar helikas?
 #### Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner? Vad heter detta protein i våra celler?
 #### Varför bildas positiva supercoils? Vilka enzymer kan ta bort supercoils och hur?

content/Biokemi/Cellulära processer/Initiering och terminering av DNA replikation/Instuderingsfrågor.md

@@ -5,12 +5,37 @@ tags:
   - instuderingsuppgifter
 föreläsare: Claes Gustavsson
 ---
+### Initiering och terminering av eukaryot DNA-replikation
+```spoiler-block:
+Initiering sker vid origins med ORC och licensiering; terminering när replikationsgafflar möts och kromatinet återställs.
+```
 
-#### Initiering och terminering av eukaryot DNA replikation.  
-#### Vad är PCNA?  
-#### Beskriv den roll ORC spelar vid initiering av eukaryot DNA-replikation. Vilken roll spelar Cdc6, Cdt1, och MCM-helikaset i denna process.  
-#### När i cell-cykeln och hur aktiveras MCM-helikaset?  
-#### Vilka DNA-polymeraser är verksamma vid den eukaryota replikationsgaffeln? Vilka aktiviteter har dessa?  
-#### Beskriv den eukaryota replikationsgaffeln och de enzymer som finns där!  
-#### Hur fungerar enzymet telomeras? Hur kan detta enzym se till att kromosomändar replikeras  korrekt?
+### Vad är PCNA?
+```spoiler-block:
+En ringformad sliding clamp som ökar DNA-polymerasets processivitet.
+```
 
+### ORC, Cdc6, Cdt1 och MCM-helikasets roller vid initiering
+```spoiler-block:
+ORC binder origins; Cdc6 och Cdt1 laddar MCM-helikaset som licensierar replikation.
+```
+
+### När och hur aktiveras MCM-helikaset?
+```spoiler-block:
+Aktiveras i S-fas via fosforylering av CDK och DDK.
+```
+
+### Vilka DNA-polymeraser verkar vid replikationsgaffeln och deras aktiviteter?
+```spoiler-block:
+Pol α (primase/initiator), Pol δ (lagging strand), Pol ε (leading strand).
+```
+
+### Beskriv den eukaryota replikationsgaffeln
+```spoiler-block:
+Innehåller MCM-helikas, primase/Pol α, Pol δ/ε, PCNA, RFC, RPA och topoisomeras.
+```
+
+### Hur fungerar telomeras och säkerställer korrekt replikation av kromosomändar?
+```spoiler-block:
+Ett RNA-beroende DNA-polymeras som förlänger telomerer med repetitiva sekvenser.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/Kontroll av genuttryck i prokaryoter/Instuderingsfrågor.md

@@ -5,3 +5,68 @@ tags:
   - kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
 föreläsare: Claes Gustavsson
 ---
+### 1. Vad är en gen?
+```spoiler-block:
+En DNA-sekvens som innehåller information för att syntetisera ett funktionellt RNA eller protein.
+```
+
+### 2. Vilken sträng i DNA skrivs av till RNA – vad styr detta?
+```spoiler-block:
+Templatsträngen skrivs av; promotorns orientering avgör vilken sträng som används.
+```
+
+### 3. Vad är ett operon?
+```spoiler-block:
+En grupp gener med gemensam promotor som transkriberas tillsammans till ett polycistroniskt mRNA.
+```
+
+### 4. Vad är en Shine–Dalgarno-sekvens?
+```spoiler-block:
+En ribosombindningssekvens i bakteriellt mRNA som basparar med 16S rRNA.
+```
+
+### 5. Hur är RNA-polymeras uppbyggt i E. coli?
+```spoiler-block:
+Kärnenzym: α₂ββ′ω (katalytiskt aktivt).  
+Holoenzym: kärnenzym + σ-faktor (kan initiera transkription).
+```
+
+### 6. Vilken roll spelar sigma-faktorn?
+```spoiler-block:
+Känner igen promotorn och positionerar RNA-polymeraset korrekt för initiering.
+```
+
+### 7. Hur hittar RNA-polymeraset till promotorn i E. coli?
+```spoiler-block:
+Via sigma-faktorns specifika bindning till promotorelement (-10 och -35).
+```
+
+### 8. Vad menas med att gener i ett operon regleras gemensamt?
+```spoiler-block:
+Alla gener påverkas samtidigt av samma regulatoriska element.
+```
+
+### 9. Vad är en repressor? Hur regleras Trp-operonet?
+```spoiler-block:
+En repressor är ett protein som blockerar transkription; i Trp-operonet aktiveras repressorn av tryptofan och stänger operonet.
+```
+
+### 10. CAP är en aktivator – hur fungerar den?
+```spoiler-block:
+CAP binder cAMP och fäster vid DNA för att öka RNA-polymerasets inbindning.
+```
+
+### 11. Förklara hur lac-operonet fungerar.
+```spoiler-block:
+Inducerbart operon; laktos inaktiverar repressorn och låg glukos → cAMP–CAP aktiverar transkription.
+```
+
+### 12. Vad är en bakteriofag och hur har den bidragit till vaccinproduktion?
+```spoiler-block:
+Ett virus som infekterar bakterier; används som vektor för antigenproduktion.
+```
+
+### 14. Hur fungerar Rifampicin respektive Actinomycin?
+```spoiler-block:
+Rifampicin hämmar bakteriellt RNA-polymeras; Actinomycin binder DNA och blockerar transkription.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,41 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - kromatin
+  - instuderingsuppgifter
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+### Definiera begreppen kromosom respektive kromatin
+```spoiler-block:
+Kromatin är DNA bundet till histoner; kromosom är den starkt kondenserade formen av kromatin vid celldelning.
+```
+
+### Beskriv nukleosomens uppbyggnad
+```spoiler-block:
+~147 bp DNA lindat runt en histonoktamer (2×H2A, H2B, H3, H4).
+```
+
+### Vilken roll spelar histon H1?
+```spoiler-block:
+Binder linker-DNA och stabiliserar högre ordningens kromatinstruktur.
+```
+
+### Vilken roll spelar histonsvansar?
+```spoiler-block:
+Reglerar kromatinstruktur via kovalenta modifieringar som påverkar genuttryck.
+```
+
+### Vad händer med nukleosomer under DNA-replikation?
+```spoiler-block:
+Histoner återfördelas till dottersträngar och kompletteras med nybildade histoner.
+```
+
+### Hur packas DNA till en kromosom? Vilken roll spelar protein scaffold?
+```spoiler-block:
+DNA bildar loopar fästa till ett protein scaffold som organiserar och kondenserar kromatinet.
+```
+
+### Hur kan aktiviteten i kromatin-loopar regleras?
+```spoiler-block:
+Via histonmodifieringar, kromatinremodellering och bindning av regulatoriska proteiner.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/Kromatin/Kromatin Instuderingsfrågor.md

@@ -1,15 +0,0 @@
----
-tags:
-  - biokemi
-  - kromatin
-  - instuderingsuppgifter
-föreläsare: Claes Gustavsson
----
-
-#### Definiera begreppen kromosom resp. kromatin!
-#### Beskriv nukleosomens uppbyggnad!
-#### Vilken roll spelar histon H1?
-#### Vilken roll spelar histonsvansar?
-#### Vad händer med nukleosomer under DNA replikation?
-#### Hur packas DNA till en kromosom? Vilken roll spelar ”protein scaffold” i denna process?
-#### Hur kan aktiviteten i kromatin-loopar regleras?

content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/Instuderingsfrågor.md

@@ -0,0 +1,73 @@
+---
+tags:
+  - biokemi
+  - anteckningar
+  - rna-syntes
+föreläsare: Claes Gustavsson
+---
+#### 1. Hur ser en transkriptionsbubbla ut?
+```spoiler-block:
+Ett lokalt uppsmält DNA-område (~12–17 bp) där strängarna separeras så RNA-polymeras kan läsa templatsträngen.
+```
+
+#### 2. Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?
+```spoiler-block:
+RNA-pol I: rRNA (28S, 18S, 5.8S).  
+RNA-pol II: mRNA och vissa snRNA.  
+RNA-pol III: tRNA, 5S rRNA och små RNA.
+```
+
+#### 3. Vad är alfa-amanitin?
+```spoiler-block:
+Ett toxin från flugsvamp som hämmar RNA-polymeras II (och svagt III).
+```
+
+#### 4. Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?
+```spoiler-block:
+TATA-box, Inr (initiator), BRE och ibland CAAT- och GC-boxar.
+```
+
+#### 5. Hur bildas preinitieringskomplexet?
+```spoiler-block:
+Generella transkriptionsfaktorer och RNA-pol II binds stegvis till promotorn.
+```
+
+#### 6. Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?
+```spoiler-block:
+Helikasaktivitet som öppnar DNA och kinasaktivitet som fosforylerar CTD.
+```
+
+#### 7. Vilken roll spelar CTD vid transkription och mRNA-processning?
+```spoiler-block:
+CTD fosforyleras och rekryterar faktorer för capping, splicing och polyadenylering.
+```
+
+#### 8. Hur processas den primära RNA-molekylen till moget mRNA?
+```spoiler-block:
+5’-capping, borttagning av introner (splicing) och poly(A)-svans.
+```
+
+#### 9. Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?
+```spoiler-block:
+En 7-metylguanosin-kap som skyddar mRNA, krävs för export och translation.
+```
+
+#### 10. Vad är en poly(A)-svans och vilken funktion har den?
+```spoiler-block:
+En kedja av adenosiner som sätts på posttranskriptionellt; ökar stabilitet och translation.
+```
+
+#### 11. Vad är intron och exon?
+```spoiler-block:
+Introner är icke-kodande sekvenser som tas bort; exoner är sekvenser som ingår i moget mRNA.
+```
+
+#### 12. Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!
+```spoiler-block:
+Spliceosomen klipper vid 5’-splice site, bildar lariat, klipper 3’-splice site och ligerar exoner.
+```
+
+#### 13. Vad är alternativ splicing och dess betydelse?
+```spoiler-block:
+Olika kombinationer av exoner ger flera proteiner från samma gen och ökar proteomets komplexitet.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/RNA syntes/RNA syntes Instuderingsfrågor.md

@@ -1,23 +0,0 @@
----
-tags:
-  - biokemi
-  - anteckningar
-  - rna-syntes
-föreläsare: Claes Gustavsson
----
-
-#### Instuderingsfrågor - RNA-syntes och processning
-#### 1. Hur ser en transkriptionsbubbla ut?
-#### 2. Vilka tre typer av RNA-polymeraser finns i kärnan och vilka gener transkriberar de?
-#### 3. Vad är alfa-amanitin?
-#### 4. Vilka sekvenselement hittar man vid en eukaryot promotor?
-#### 5. Hur bildas preinitieringskomplexet?
-#### 6. Vilka aktiviteter hos TFIIH startar transkriptionen?
-#### 7. Vilken roll spelar CTD (den C-terminala domänen) vid transkription och processning
-#### av mRNA?
-#### 8. Hur processas den primära RNA-molekylen för att bilda moget mRNA?
-#### 9. Vad är en 5’-cap och vilken funktion har den?
-#### 10. Vad är en poly(A) svans, hur sätts den på och vilken funktion har den?
-#### 11. Vad är intron och exon?
-#### 12. Beskriv de grundläggande stegen vid splicing!
-#### 13. Vad är alternativ splicing? Vilken betydelse har denna process?

content/Biokemi/Cellulära processer/Translation/Instuderingsfrågor.md

@@ -5,49 +5,125 @@ tags:
   - instuderingsuppgifter
 föreläsare: Ana Luis
 ---
-
 ## Genetic code
-#### Describe the main features of the genetic code.
 
-#### What is degeneracy of the genetic code and what its biological significance?
+### Describe the main features of the genetic code.
+```spoiler-block:
+Triplet code (codons of three nucleotides), non-overlapping, read continuously, nearly universal, and unambiguous (each codon specifies one amino acid or stop).
+```
+
+### What is degeneracy of the genetic code and its biological significance?
+```spoiler-block:
+Multiple codons encode the same amino acid; this reduces the impact of point mutations and translation errors.
+```
 
 ## Translation and tRNA
-#### What is translation?
 
-#### What is a tRNA and what is its function in protein synthesis?
+### What is translation?
+```spoiler-block:
+The process by which ribosomes synthesize proteins using mRNA as a template.
+```
 
-#### What are the general characteristics of a tRNA?
+### What is a tRNA and what is its function in protein synthesis?
+```spoiler-block:
+A transfer RNA that carries a specific amino acid to the ribosome and matches it to the mRNA codon.
+```
 
-#### Why the 3’ CCA terminal region in a tRNA is also know as the acceptor arm?
+### What are the general characteristics of a tRNA?
+```spoiler-block:
+Small (~75 nt), cloverleaf secondary structure, L-shaped 3D structure, anticodon loop, and 3′-CCA end.
+```
 
-#### What is the wobble effect and which base in the anticodon determines the wobble effect?
+### Why is the 3′ CCA region called the acceptor arm?
+```spoiler-block:
+It is the site where the amino acid is covalently attached to the tRNA.
+```
 
-#### Explain why aminoacyl-tRNA synthetases are the ‘true reads’ of the genetic code?
+### What is the wobble effect and which base determines it?
+```spoiler-block:
+Flexible base pairing at the third codon position; determined by the first base (5′ end) of the anticodon.
+```
 
-#### How do aminoacyl-tRNA synthetases work? Describe active and editing sites.
+### Why are aminoacyl-tRNA synthetases the ‘true readers’ of the genetic code?
+```spoiler-block:
+They ensure correct amino acid is attached to the correct tRNA, enforcing codon–amino acid fidelity.
+```
+
+### How do aminoacyl-tRNA synthetases work?
+```spoiler-block:
+Two-step reaction: amino acid activation with ATP, then transfer to tRNA; editing site removes mischarged amino acids.
+```
 
 ## Ribosomes
-#### What is a ribosome and what are its different components?
 
-#### Which components of the ribosome are critical to its structure and function?
+### What is a ribosome and what are its components?
+```spoiler-block:
+A ribonucleoprotein complex of rRNA and proteins; composed of large and small subunits.
+```
 
-#### Describe the three binding sites (A, P, and E) and which tRNAs are found in each site.
-#### What are the differences between bacterial and eukaryotic ribosomes?
+### Which ribosomal components are critical for structure and function?
+```spoiler-block:
+rRNA forms the structural core and catalyzes peptide bond formation.
+```
 
-#### How can the ribosome be used as a structure to development of new antibiotics?
+### Describe the A, P, and E sites.
+```spoiler-block:
+A-site binds aminoacyl-tRNA; P-site holds peptidyl-tRNA; E-site releases empty tRNA.
+```
+
+### Differences between bacterial and eukaryotic ribosomes?
+```spoiler-block:
+Bacterial: 70S (30S+50S); eukaryotic: 80S (40S+60S).
+```
+
+### How can ribosomes be targets for antibiotics?
+```spoiler-block:
+Antibiotics selectively bind bacterial ribosomes, inhibiting translation without affecting eukaryotic ribosomes.
+```
 
 ## Protein translation mechanism
-#### What are the steps of protein translation?
 
-#### What are the characteristics of the initiation region in bacteria?
+### What are the steps of protein translation?
+```spoiler-block:
+Initiation, elongation, and termination.
+```
 
-#### Explain why the reading frame is establish during the initiation step of protein synthesis?
-#### How does protein initiation start and what role initiation factors play?
-#### What is the role of elongation and translocation factors?
-#### What is the role of release factors in protein synthesis?
+### Characteristics of the bacterial initiation region?
+```spoiler-block:
+Shine–Dalgarno sequence upstream of start codon aligns mRNA with ribosome.
+```
 
-#### What is a polysome and what is its biological significance?
+### Why is the reading frame established during initiation?
+```spoiler-block:
+Start codon positioning defines triplet grouping for the entire mRNA.
+```
 
-#### What are the differences between bacteria and eukaryotic protein biosynthesis?
+### How does protein initiation start and what is the role of initiation factors?
+```spoiler-block:
+Initiation factors assemble ribosomal subunits at the start codon and recruit initiator tRNA.
+```
 
-#### Streptomycin is a bacterial antibiotic that blocks protein biosynthesis. Describe how this antibiotic works and which step of protein biosynthesis is inhibited.
+### Role of elongation and translocation factors?
+```spoiler-block:
+Deliver aa-tRNAs (EF-Tu/eEF1A) and move ribosome along mRNA (EF-G/eEF2).
+```
+
+### Role of release factors?
+```spoiler-block:
+Recognize stop codons and trigger peptide release.
+```
+
+### What is a polysome and its significance?
+```spoiler-block:
+Multiple ribosomes translating one mRNA simultaneously, increasing efficiency.
+```
+
+### Differences between bacterial and eukaryotic protein biosynthesis?
+```spoiler-block:
+Different ribosomes, initiation mechanisms, factors, and cellular localization.
+```
+
+### How does streptomycin inhibit protein biosynthesis?
+```spoiler-block:
+Binds 30S subunit, causes misreading of mRNA, and blocks initiation.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/Transport över cellmembran/Instuderingsfrågor.md

@@ -6,16 +6,72 @@ tags:
   - instuderingsuppgifter
 date: 2025-11-25
 ---
-#### Vilka lipider ingår i det eukaryota cellmembranet? 
-#### Vilken roll har kolesterolet? 
-#### Cellmembranet brukar sägas varra assymetriskt. Vad avses med detta? 
-#### Vilka molekyler kan spontant diffundera över cellmembranet? 
-#### Vilka kan inte göra det? 
-#### Vilka typer av rörlighet finns i cellmembranet vid 37°? 
-#### Hur är lipid rafts uppbyggda? 
-#### Vilka typer av integrala membranproteiner finns? 
-#### Vad är en hydropatiplot?
-#### Vad ger den information om?
-#### Hur är perifera membranet associerade till cellmembranet? Vilka olika typer av celladhesionsproteiner finns?
-#### Vad binder de till?
-#### Vilken är deras huvudsakliga funktion?
+### Vilka lipider ingår i det eukaryota cellmembranet?
+```spoiler-block:
+Fosfolipider, glykolipider och kolesterol.
+```
+
+### Vilken roll har kolesterolet?
+```spoiler-block:
+Reglerar membranets fluiditet och stabilitet; minskar permeabilitet.
+```
+
+### Cellmembranet sägs vara asymmetriskt – vad innebär detta?
+```spoiler-block:
+Olika lipider och proteiner är ojämnt fördelade mellan inre och yttre membranbladet.
+```
+
+### Vilka molekyler kan spontant diffundera över cellmembranet?
+```spoiler-block:
+Små opolära molekyler och små oladdade polära molekyler (t.ex. O₂, CO₂).
+```
+
+### Vilka molekyler kan inte spontant diffundera över cellmembranet?
+```spoiler-block:
+Laddade joner och stora polära molekyler (t.ex. Na⁺, glukos).
+```
+
+### Vilka typer av rörlighet finns i cellmembranet vid 37°?
+```spoiler-block:
+Lateral diffusion, rotation och flexion av lipidkedjor.
+```
+
+### Hur är lipid rafts uppbyggda?
+```spoiler-block:
+Kolesterol- och sfingolipidrika, mer ordnade membrandomäner med specifika proteiner.
+```
+
+### Vilka typer av integrala membranproteiner finns?
+```spoiler-block:
+Single-pass, multi-pass (α-helixar) och β-tunnor.
+```
+
+### Vad är en hydropatiplot?
+```spoiler-block:
+Ett diagram som visar hydrofoba och hydrofila regioner i ett protein.
+```
+
+### Vad ger en hydropatiplot information om?
+```spoiler-block:
+Förekomst och position av transmembrana segment.
+```
+
+### Hur är perifera membranproteiner associerade till cellmembranet?
+```spoiler-block:
+Via icke-kovalenta interaktioner med lipider eller integrala membranproteiner.
+```
+
+### Vilka typer av celladhesionsproteiner finns?
+```spoiler-block:
+Cadheriner, integriner, selektiner och Ig-superfamiljen.
+```
+
+### Vad binder celladhesionsproteiner till?
+```spoiler-block:
+Andra celler eller extracellulär matrix.
+```
+
+### Vilken är deras huvudsakliga funktion?
+```spoiler-block:
+Mediar cell–cell- och cell–matrix-adhesion samt signalering.
+```

content/Biokemi/Cellulära processer/Utforska proteiner/Instuderingsfrågor.md

@@ -5,47 +5,213 @@ tags:
   - instuderingsuppgifter
 föreläsare: Ingela Parmryd
 ---
+### Vad är definitionen av ”genom”?
+```spoiler-block:
+Allt genetiskt material (DNA) i en organism eller cell.
+```
 
-Vad är definitionen av ”genom”?  
-1. Vad menas med ”proteom”?  
-2. Vad menas med ett homogenisat?  
-3. Beskriv några egenskaper hos proteiner som kan användas för rening  
-4. I vilken storleksordning kommer proteinerna ut vid gelfiltrering?  
-5. Vilken laddning har de protein som binder en katjonbytare?  
-6. Vilken laddning har de protein som INTE binder till en katjonbytare?  
-7. Vilken laddning har de protein som binder en anjonbytare?  
-8. Vilken laddning har de protein som INTE binder till en anjonbytare?  
-9. Hur kan man eluera ut protein från en katjonbytare?  
-10. Vad menas med affinitetskromatografi?  
-11. Hur kan man eluera ett protein med 6xHistag från en Nickel(II)-kolonn?  
-12. Vad kallas det automatiserade system som kan användas för proteinrening?  
-13. Vilken parameter brukar man följa?  
-14. Vilken typ av medium (gel) används för en SDS-PAGE?  
-15. Vad är SDS?  
-16. Vilken laddning har SDS?  
-17. Vilka molekyler hamnar längst upp respektive längst ner på en SDS-PAGE gel?  
-18. Hur kan man visualisera en SDS-PAGE efter körning?  
-19. Varför menas med proteinreferens för SDS-PAGE?  
-20. Vad är isoelektrisk fokusering?  
-21. Vad är två-dimensionell gelelektrofores?  
-22. Hur kan en SDS-PAGE användas för att följa proteinrening?  
-23. Vad är en antikropp?  
-24. Vad är ett antigen?  
-25. Vad är en epitop?  
-26. Vad kännetecknar en monoklonal antikropp?  
-27. Vad kännetecknar polyklonala antikroppar?  
-28. Hur tillverkas monoklonala antikroppar?  
-29. Beskriv ELISA  
-30. Beskriv Indirekt ELISA  
-31. Beskriv Sandwich ELISA  
-32. Vilken av de två ELISA-metoderna är mer specifik?  
-33. Nämn kliniska applikationer för de båda ELISA-metoderna.  
-34. Vad är Western blot?  
-35. Vad är skillnaden på SDS-PAGE och Western blot?  
-36. Vilka substanser kan masspektrometri detektera?  
-37. Nämn några användningsområden för masspektrometri.  
-38. Varför behöver vi kristaller för röntgenkristallografi?  
-39. Varför är det viktigt med hög upplösning?  
-40. Nämn den vanligaste atomen som används för Nuclear Magnetic Resonance (NMR).  
-41. Vad är den främsta fördelen med att använda kryo-elektronmikroskopi istället för  
-röntgenkristallografi?
+### 1. Vad menas med ”proteom”?
+```spoiler-block:
+Samtliga proteiner som uttrycks i en cell, vävnad eller organism vid ett givet tillfälle.
+```
+
+### 2. Vad menas med ett homogenisat?
+```spoiler-block:
+En cell- eller vävnadssuspension där celler har brutits sönder.
+```
+
+### 3. Egenskaper hos proteiner som kan användas för rening
+```spoiler-block:
+Storlek, laddning, hydrofobicitet och specifik bindningsförmåga.
+```
+
+### 4. I vilken ordning elueras proteiner vid gelfiltrering?
+```spoiler-block:
+Stora proteiner först, små sist.
+```
+
+### 5. Vilken laddning har proteiner som binder en katjonbytare?
+```spoiler-block:
+Positiv laddning.
+```
+
+### 6. Vilken laddning har proteiner som inte binder till katjonbytare?
+```spoiler-block:
+Negativ eller neutral laddning.
+```
+
+### 7. Vilken laddning har proteiner som binder en anjonbytare?
+```spoiler-block:
+Negativ laddning.
+```
+
+### 8. Vilken laddning har proteiner som inte binder till anjonbytare?
+```spoiler-block:
+Positiv eller neutral laddning.
+```
+
+### 9. Hur eluerar man protein från en katjonbytare?
+```spoiler-block:
+Genom ökad salthalt eller ändrat pH.
+```
+
+### 10. Vad menas med affinitetskromatografi?
+```spoiler-block:
+Rening baserad på specifik bindning mellan protein och ligand.
+```
+
+### 11. Hur elueras 6xHis-protein från Ni²⁺-kolonn?
+```spoiler-block:
+Med imidazol.
+```
+
+### 12. Vad kallas det automatiserade systemet för proteinrening?
+```spoiler-block:
+ÄKTA-system.
+```
+
+### 13. Vilken parameter följs oftast?
+```spoiler-block:
+Absorbans vid 280 nm.
+```
+
+### 14. Vilken gel används i SDS-PAGE?
+```spoiler-block:
+Polyakrylamidgel.
+```
+
+### 15. Vad är SDS?
+```spoiler-block:
+Ett anjoniskt detergent (natriumdodecylsulfat).
+```
+
+### 16. Vilken laddning har SDS?
+```spoiler-block:
+Negativ.
+```
+
+### 17. Vad hamnar högst upp respektive längst ner i SDS-PAGE?
+```spoiler-block:
+Stora proteiner överst, små längst ner.
+```
+
+### 18. Hur visualiseras SDS-PAGE?
+```spoiler-block:
+Coomassie-färgning eller silverfärgning.
+```
+
+### 19. Vad menas med proteinreferens?
+```spoiler-block:
+Molekylviktsmarkör (protein ladder).
+```
+
+### 20. Vad är isoelektrisk fokusering?
+```spoiler-block:
+Separation av proteiner efter deras isoelektriska punkt (pI).
+```
+
+### 21. Vad är tvådimensionell gelelektrofores?
+```spoiler-block:
+Kombination av isoelektrisk fokusering och SDS-PAGE.
+```
+
+### 22. Hur används SDS-PAGE för att följa proteinrening?
+```spoiler-block:
+Genom att analysera renhet och bandintensitet över reningssteg.
+```
+
+### 23. Vad är en antikropp?
+```spoiler-block:
+Ett protein som specifikt binder ett antigen.
+```
+
+### 24. Vad är ett antigen?
+```spoiler-block:
+En molekyl som känns igen av antikroppar.
+```
+
+### 25. Vad är en epitop?
+```spoiler-block:
+Den del av antigenet som antikroppen binder.
+```
+
+### 26. Vad kännetecknar en monoklonal antikropp?
+```spoiler-block:
+Binder en enda specifik epitop.
+```
+
+### 27. Vad kännetecknar polyklonala antikroppar?
+```spoiler-block:
+Binder flera epitoper på samma antigen.
+```
+
+### 28. Hur tillverkas monoklonala antikroppar?
+```spoiler-block:
+Via hybridomteknik (B-cell + myelomcell).
+```
+
+### 29. Beskriv ELISA
+```spoiler-block:
+En enzymbaserad metod för att detektera antigen eller antikroppar.
+```
+
+### 30. Beskriv indirekt ELISA
+```spoiler-block:
+Antigen på platta → primärantikropp → enzymkopplad sekundärantikropp.
+```
+
+### 31. Beskriv Sandwich ELISA
+```spoiler-block:
+Antigen fångas mellan två antikroppar.
+```
+
+### 32. Vilken ELISA-metod är mest specifik?
+```spoiler-block:
+Sandwich ELISA.
+```
+
+### 33. Kliniska applikationer för ELISA
+```spoiler-block:
+Indirekt: antikroppsdetektion (infektioner).  
+Sandwich: antigen-/hormondetektion.
+```
+
+### 34. Vad är Western blot?
+```spoiler-block:
+Proteiner separeras med SDS-PAGE, överförs till membran och detekteras med antikroppar.
+```
+
+### 35. Skillnad mellan SDS-PAGE och Western blot?
+```spoiler-block:
+SDS-PAGE separerar proteiner; Western blot identifierar specifika proteiner.
+```
+
+### 36. Vad kan masspektrometri detektera?
+```spoiler-block:
+Proteiner, peptider, metaboliter och lipider.
+```
+
+### 37. Användningsområden för masspektrometri
+```spoiler-block:
+Proteomik, identifiering av proteiner, posttranslationella modifieringar.
+```
+
+### 38. Varför behövs kristaller för röntgenkristallografi?
+```spoiler-block:
+För att ge regelbundet diffraktionsmönster.
+```
+
+### 39. Varför är hög upplösning viktig?
+```spoiler-block:
+För att kunna se atomära detaljer i strukturen.
+```
+
+### 40. Vanligaste atomen i NMR?
+```spoiler-block:
+¹H (väte).
+```
+
+### 41. Fördel med kryo-EM jämfört med röntgenkristallografi?
+```spoiler-block:
+Kräver inga kristaller och kan studera stora komplex i nära nativt tillstånd.
+```