A) Var i cellen och i vilken metabol process sker cellandning?
+B) Beskriv cellandningen med en formel.
+(4p) (Max 50 ord.)
3 av 4:
+A. I elektrontransportkedjan i mitokondriens innre membran.
+B. Syre + elektroner --> H O
+SjÀlva cellandningen sker i komplex 4 i elektrontransportkedjan.
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-01-27
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Du jobbar pÄ labb över sommaren och har fÄtt in en patient som du misstÀnker Àr smittad av COVID-19 (4p). (Max 200 ord.)
+a) Beskriv en analysmetod för att undersöka detta.
+b) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?
Jag vÀljer att anvÀnda en ELISA, nÀrmare bestÀmt en sandwich ELISA som identifierar om patienten har antigen.
+I en sandwich ELISA tillsÀtts patientens prov till en brunn dÀr det finns en fast antikropp, i detta fall för COVID-19. Om patienten har antigen för COVID-19 kommer dessa att binda till antikroppen. Efter detta sköljer man provet för att göra sig av med andra antigen och antikroppar. DÀrefter tillsÀtts en antikropp bunden till ett enzym, mha detta kan man fÄ fram en fÀrgskiftning i provet om det Àr positivt. Efter att den enzymbundna antikroppen tillsatts sköljer man ytterliggare en gÄng och tillsist tillsÀtter man ett substrat som inducerar en fÀrgskiftning i provet om den enzymbunda antikroppen lyckats binda, om fÀrgskiftning sker Àr provet positivt och patienten har sÄledes antigen för COVID-19.
kategory: utforska-proteiner
prov: 2024-01-27
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Varför ökar entropin i en spontan reaktion? Hur kan man förklara det molekylÀrt? (4p)
";"I en spontant reaktion ökar alltid entropin enligt termodynamikens lagar.
+Molekyler har en förmÄga att vilja sprida ut sig och sÄledes öka entropin. Detta sker genom Brownsk rörelse, alltsÄ nÀr molekyler ""krockar"" med varandra och Àndrar riktning. Molekyler kommer röra sig mot det omrÄde dÀr minst krockar uppstÄr.
+Som exempel kan vi ta salt i vatten. Saltet kommer spontant att lösa upp sig i vattnet, öka entropin. Genom Brownsk rörelse, krockar mellan molekylerna, fördelas saltet i vÀtskan.
kategory: termodynamik
prov: 2024-01-27
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Förklara vad van der Waals krafter Àr och ge ett exempel pÄ hur de kan uppkomma i en biologisk molekyl. (4p) (Max 75 ord.)
";"Van der Waals krafter Àr de svagaste av bindingstyper. Runt en molekyl finns elektroner i elektronskal och vid nÄgot tillfÀlle Àr den lite mer positiv respektive negativ pÄ ena sidan. Detta pÄverkar molekyler runt ikring som blir s.k. transienta dipoler. NÀr dessa uppstÄr medkommer krafter mellan molekylerna som kallas van der Waals krafter/bindningar.
+Ett exempel pÄ molekyler med mycket van der Waals krafter Àr aromatiska aminosyror som kan packas tÀtt pga sin planstruktur.
TotalpoÀng: 4
+ +kategory: kemiska-bindingar
prov: 2024-01-27
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kemiska-bindingar" +"Hexokinas Àr ett enzym som kan anvÀnda bÄde D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.04 mM Àr, och för D-fruktos = 1.7 mM. Vmax Àr detsamma för bÄda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av bÄda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (4p)
";"Km Àr den koncentration substrat som behövs för att halva Vmax ska vara uppnÄtt.
+I detta fall Àr Km betydligt lÀgre för D-glukos Àn för D-fruktos. I och med att Km Àr lÀgre för D-glukos uppnÄr enzymet en högre hastighet med D-glukos eftersom koncentrationen för bÄda substraten var 1mM. Km för D-frukots var 1,7 mM vilket betyder att vi inte ens uppnÄt halva Vmax vid koncentrationen 1 mM D-fruktos.
+Eftersom Vmax Àr detsamma för bÄda substraten kan man utgÄ frÄn att det substrat med lÀgst Km vÀrde Àr det som kommer förbrukas först.
+Detta stÀmmer ocksÄ in med att glukos Àr det primÀra brÀnslet som vi fÄtt lÀra oss pÄ förelÀsningar.
kategory: enzymer
prov: 2024-01-27
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden om beta-oxidationen Àr korrekta? (2p)
+A och D
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2024-01-27
frÄga: 29
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Describe the allosteric regulation of hemoglobin with an example. (4p)
+OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words)
2 av 4:
+Hemoglobin is an oxygentransport protein which transport oxygen from our lungs to our muscles and tissue. Hemoglobin consists of four subunits, two alfa and two beta, with one Fe per unit.
+When oxygen binds to the first Fe it moves 0,4 Ă
upwards, closer to the heme-group. This induce a conformatioin change in hemoglobin which increases the affinty for oxygen for the next subunit. This is why hemoglobins curve is hyperbol.
+This is called cooperativity.
kategory: hemoglobin
prov: 2024-01-27
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vilka tvÄ av dessa lipider hittas i det eukaryota cellmembranet? (2p)
+A och B
+ +kategory: cellmembran
prov: 2024-01-27
frÄga: 16
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"I katabolismen hittar vi mÄnga enzymer som tillhör gruppen (vÀlj tvÄ)
+A och B
+ +kategory:
prov: 2024-01-27
frÄga: 22
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"Varför mĂ„ste ureacykeln anvĂ€ndas vid nedbrytning av purin-nukleotider? (2p) (Max 50 ord)
";"1 av 2: +Puriner har tvÄ ringstruktur. I puriner finns det kvÀve och vÀte som bildar ammoniak vilket i höga koncentrationer Àr farligt för kroppen. Ureacyklen anvÀnds för att göra sig av med ammoniaken genom urat och sedan urinen. +AI: +Nedbrytning av purinnukleotider frigör aminogrupper, som omvandlas till ammoniak via transaminering och glutamatdehydrogenas. Ammoniak Àr starkt toxiskt, sÀrskilt för CNS, och mÄste dÀrför oskadliggöras. Ureacykeln omvandlar ammoniak till urea, som kan utsöndras sÀkert via njurarna.
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2024-01-27
frÄga: 32
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Beskriv översiktligt den allostera regleringen av glykogenfosforylas i skelettmuskel och lever, dvs de viktigaste allostera modulatorerna som reglerar enzymet i respektive vÀvnad. Ange om modulatorerna stimulerar eller hÀmmar enzymets aktivitet. RÀtt kombination av alloster modulator och pÄverkan pÄ enzymaktivitet krÀvs för poÀng. (4p) (Max 75 ord)
";"2 av 4:
+Glykogen fosforylas Àr ett av enzymen som bryter ner glykogen.
+I muskler ska glykogenet brytas ner och anvÀndas som brÀnsle. Cellen kÀnner av energikvoten. Detta betyder att om energikvoten Àr lÄg och vi har mycket ADP kommer enzymet att stimuleras. Om det finns mycket ATP hÀmmas enzymet.
+I levern ska glykogenet brytas ner och reglera blodsockret mellan mÄltider. Om glukosnivÄerna Àr lÄga kommer enzymet stimuleras och vice versa. Glukagon kommer dÄ stimulera medan insulin hÀmmar.
AI: +Skelettmuskel:
+Glykogenfosforylas aktiveras allostert av AMP, som signalerar lÄg energi. Det hÀmmas av ATP och glukos-6-fosfat, som signalerar god energitillgÄng.
+Lever:
+Glykogenfosforylas hÀmmas av glukos, vilket speglar höga blodglukosnivÄer. Levern saknar AMP-aktivering i fysiologiskt relevant grad, eftersom dess uppgift Àr att frisÀtta glukos, inte att reglera sin egen energistatus.
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-01-27
frÄga: 26
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer om splicing? (2p)
+A och C
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2024-01-27
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Which two statements about restriction enzymes such as BamHI are correct? (2p)
+(Svar markerat â TotalpoĂ€ng: 2)
";"C och D
+ +kategory: plasmid
prov: 2024-01-27
frÄga: 36
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"A) Vilka energirika föreningar bildas i ett varv i citronsyracykeln?
+B) Vilken Àr kopplingen mellan cellens energikvot och citronsyracykeln?
+(4p) (Max 75 ord.)
2 av 4:
+A. Tre NADH och en FADH2
+B. NADH och FADH2 behövs för att transportera elektoner till elektrontransportkedjan som kan bygga upp en elektrokemisk gradient för att bilda ATP genom ATP syntaset. En lÄg energikvot betyder dÀrav att det inte finns tillrÀckligt med NADH och FADH2 frÄn citronsyracyklen.
+AI:
+A) Ett varv i citronsyracykeln bildar 3 NADH, 1 FADHâ och 1 GTP (âATP).
+B) Hög energikvot (mycket ATP, NADH) hĂ€mmar cykeln, frĂ€mst via isocitratdehydrogenas och α-ketoglutaratdehydrogenas. LĂ„g energikvot (mycket ADP, NADâș) stimulerar cykeln. Cykeln regleras alltsĂ„ efter cellens energibehov.
kategory: citronsyracykeln
prov: 2024-01-27
frÄga: 27
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Lac-operonet behövs för att uttrycka enzymer som kan bryta ner laktos (mjölksocker). Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer? (2p)
+A och D
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2024-01-27
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Redogör för den principiella uppbyggnaden av spÀnningsaktiverade katjonkanaler och hur de öppnas. (4p) (Max 100 ord)
";"2 av 4:
+En jonkanal bestÄr av sex olika segment. Segment 5 och 6 bildar sjÀlva centralporen medan segment 1-3 tillsammans med segment 4 bildar den spÀnnings kÀnsliga padeln. Segment 4 Àr det segment som kÀnner av sjÀlva spÀnningsförÀndringen.
+NÀr en en spÀnningsförÀndring i membranet sker registeras detta hos padlen vilket inducerar en konformationsÀndring och fÄr den att stÀlla sig pÄ ""högkant"". Detta öppnar katjonkanalen och joner kan flöda in eller ut ur cellen.
AI: +SpĂ€nningsaktiverade katjonkanaler bestĂ„r av fyra domĂ€ner (eller fyra separata subenheter) som vardera har sex transmembransegment (S1âS6). Segmentet S4 innehĂ„ller positivt laddade aminosyror och fungerar som spĂ€nningssensor. NĂ€r membranet depolariseras rör sig S4 utĂ„t, vilket drar i kopplade segment (framför allt S5âS6) och öppnar poren. En selektivitetsfilterregion bestĂ€mmer vilka katjoner som passerar. Kanalen kan Ă€ven inaktiveras via en separat âinaktiveringsgrindâ efter öppning.
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-01-27
frÄga: 17
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende metaboliter ingÄr i glykolysen?
+C och D
+ +kategory: glykolysen
prov: 2024-01-27
frÄga: 23
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Mutationer i genen som kodar för enzymet glukos-6-fosfatdehydrogenas kan leda till ett defekt enzym vilket i sin tur kan orsaka hemolytisk anemi i vissa situationer. Vilken Àr grundorsaken till detta? (2p) (Max 50 ord)
";"1 av 2:
+Glukos 6-fosfatdehydrogenas Àr det första enzymet i pentosfosfatvÀgen, som körs för att bilda NADPH och ribos 5-fosfat.
+Vid deffekt i detta enzym bildas inte tillrÀckligt med NADPH som skyddar mot reaktiva syreföreningar. Detta Àr speceillt farligt för t.ex. eretrocyter som saknar mitokondrier och mÄste fÄ allt sitt NADPH frÄn pentosfofsfatvÀgen.
+AI:
+Glukos-6-fosfatdehydrogenas behövs för att bilda NADPH i pentosfosfatvĂ€gen. NADPH hĂ„ller glutation reducerat, vilket skyddar erytrocyter mot oxidativ skada. Vid enzymdefekt saknar cellen detta skydd â oxidativ stress skadar membran och hemoglobin â erytrocyterna hemolyserar.
kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2024-01-27
frÄga: 33
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Förklara hur arsenikförgiftning pÄverkar metabolismen och varför liknande pÄverkan ses vid alkoholism. (4p) (Max 120 ord)
";"3 av 4:
+Arsenit har affiniet för sulfhydrylgrupper. En viktig del i PDH komplexet Àr den arm som för intermediÀrerna mellan E1, E2 och E3. Denna arm bygger pÄ just svavel. Armen inhiberas sÄledes av arsenit nÀr bindningar mellan arsenit och armen bildas vilket medför att vi inte kan producera lika mycket eller ingen acetyl-CoA. Utan acetyl-CoA kan vi inte köra citronsyracyklen och sÄledes inte fÄ fram NADH och FADH2 till elektrontransport kedjan.
+Alkholism leder till liknande effekter dÄ de polÀra alkholerna kan binda till den intermediÀr-transportrande armen och inhibiera PDH komplexet.
+PDH=Pyruvat dehydrogenas
kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2024-01-27
frÄga: 24
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"![[Pasted image 20251129235332.png]] +PÄ bilden syns en eukaryot replikationsgaffel.
+A) Ange för positionerna a, b, c och d om de motsvarar en 5â eller 3â-Ă€nde.
+Vid DNA replikation skapas de tvÄ strÀngarna pÄ litet olika vis.
+B) Vad kallas strÀngen som markerats med e?
+C) Vad kallas strÀngen som markerats med f?
+(4p)
a = 5ÂŽ
+b = 3ÂŽ
+c = 5ÂŽ
+d = 5ÂŽ
B) Leadning strand
+C) Lagging strand
kategory: dna-replikation
prov: 2024-01-27
frÄga: 10
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Var binder histon H1? Vilken roll spelar detta protein? (4p)
";"Histon 1, H1, upptÀcktes senare Àn de andra histonen, H2A, H2B, H3 och H4.
+H1 har i uppgift att stabilisera och binder till linker DNA som finns mellan ""histonpÀrlorna""
kategory: dna-replikation
prov: 2024-01-27
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vilket av följande pÄstÄenden Àr korrekta avseende reglering av den intracellulÀra kolesterolhalten in vivo? (2p)
+C och D
+ +kategory: kolesterol
prov: 2024-01-27
frÄga: 34
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Beskriv i detalj hur terminationssteget i proteinsyntesen fungerar med sÀrskilt fokus pÄ funktionen av stoppkodon och ribosomens struktur. Förklara Àven hur Release Factor 1 (RF1) bidrar till processen. (4p) (Max 150 ord)
";"3 av 4:
+Ribosomen bestÄr av tvÄ subenheter, hos mÀnniskan heter dessa 40 och 60. Den lilla subenheten, 40, har i uppgift leta efter starkodonet men ocksÄ kÀnna av stoppkodonet. Den stora subenheten, 60, har i uppgift att katalysera inbindingen av rÀtt aminosyra till en vÀxande aminosyra sekvens i P-site.
+I terminations steget kommer ribosomen, 40 enheten, att kÀnna av en cleavage signal som fÄr RF1 att avsluta translationen. Cleavage signal Àr alltsÄ ett stoppkodon. Det som sker Àr att RF1 kommer klyva den nu fÀrdig byggda aminosyra sekvens som vÀxt fram i P-site sÄ att den transporteras till sin Àmmnade destination.
kategory: translation
prov: 2024-01-27
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om kompetitiva hÀmmare Àr korrekta? (2p)
+A och C
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-01-27
frÄga: 20
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Syntes av heme beror pÄ kroppens jÀrninnehÄll. Beskriv hur detta sker. (4p)
";"AI: +Hemesyntesen styrs av hur mycket jĂ€rn som finns i cellen genom reglering av ALA-syntas (erytroid isoform). NĂ€r jĂ€rn Ă€r lĂ„gt binder IRP till en IRE-sekvens i 5â-Ă€nden av ALAS-mRNA och blockerar translationen, vilket bromsar hemesyntesen. NĂ€r jĂ€rn Ă€r tillrĂ€ckligt slĂ€pper IRP â ALA-syntas kan översĂ€ttas â hemesyntesen ökar. PĂ„ sĂ„ sĂ€tt matchas hemeproduktionen med tillgĂ€ngligt jĂ€rn.
+ +kategory: heme
prov: 2024-01-27
frÄga: 30
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Hur kan man bestÀmma slÀktskap mellan olika arter med DNA-teknik och varför fungerar det? (4p)
";"Genom att sekvensera DNA kan man se hur mycket som stĂ€mmer överens mellan olika arter. Ăven om majoriteten av vĂ„rt DNA Ă€r sig likt hos mĂ„nga arter kan man Ă€ndĂ„ se skillnader pĂ„ t.ex. mutationer.
+För att exemplifiera: DNA't hos en mÀnniska och en orangutang Àr mycket likt varandra, men pga DNA'ts ordning, proteinveckning och epigentik kan det uttryckas vÀldigt olika och sÄledes ge upphov till olika utseende, beetende och andra egenskaper. SÄledes kan okika arter vara nÀra beslÀktande med varandra, alltsÄ ha liknade DNA, men ÀndÄ vara olika arter.
kategory: evolution
prov: 2024-01-27
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden stÀmmer för ATP? (2p)
+C och D
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2024-01-27
frÄga: 21
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till aminosyrametabolism Àr korrekta? (2p)
+B och D
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2024-01-27
frÄga: 31
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden stÀmmer för glukoneogenes? (2p)
+A och D
+ +kategory: glukoneogenes
prov: 2024-01-27
frÄga: 25
";"glukoneogenes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glukoneogenes" +"Telomeras Àr ett omvÀnt transkriptas. Vad anvÀnder detta enzym som templat (mall)? NÀmn ocksÄ tvÄ typer av celler i vilka detta enzym Äterfinns. (4p)
";"Telomeras har med sig en egen RNA sekvens som den anvÀnder som mall nÀr det ska förlÀnga telomererna. Detta enzym Äterfinns i t.ex. stamceller och cancer celler.
+ +kategory: kromatin
prov: 2024-01-27
frÄga: 11
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Vilka tvÄ nedanstÄende pÄstÄenden Àr korrekta? (2p)
+B och C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2024-01-27
frÄga: 8
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"I en studie utvÀrderas effekten av en ny blodtryckssÀnkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten frÄn studien visar ett p-vÀrdet pÄ 0.03 och ett 95% konfidensintervall pÄ 6-17 mmHg. Diskutera vad dessa resultat ger oss för information och huruvida nollhypotesen kan förkastas. (4p) (Max 100 ord).
";"2 av 4:
+Detta resultat visar att nollhypotesen kan förkastas dÄ p-vÀrdet Àr under 0,05 dÄ det finns sk. statistisk signifikans. Hade p-vÀrdet varit över 0,05 hade man inte kunnat förkasta nollhypotesen.
+Vidare visar konfidensintervallet att 95% av de som fick den blodtryckssÀnknade medicinen fick ett lÀgre blodtryck med 6-17 mmHg.
AI: +p-vĂ€rdet 0,03 innebĂ€r att om nollhypotesen (ingen skillnad i medelblodtryck) vore sann, skulle en sĂ„ hĂ€r stor eller större skillnad uppstĂ„ bara i cirka 3 % av fallen. Nollhypotesen kan dĂ€rför förkastas vid 5 %-nivĂ„n. Ett 95 % konfidensintervall pĂ„ 6â17 mmHg innebĂ€r att vi med 95 % sĂ€kerhet skattar den sanna medelreduktionen i blodtryck till mellan 6 och 17 mmHg, och eftersom intervallet inte innehĂ„ller 0 talar det ocksĂ„ för en statistiskt signifikant blodtryckssĂ€nkande effekt.
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2024-01-27
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Lista fyra egenskaper hos en alfahelix. (4p) (Max 75 ord.)
";"3 av 4:
+1. Har en konstant diameter.
+2. Har kvÀvebaserna innÄt och fosfatgrupperna och sockret utÄt. (Pga hydrofob/hydrofil)
+3. Kan polymeriseras till beta flaks liknande strukturer och bilda amyloider => Sjukdom.
+4. Kan bilda transmembran-alfahelixar om det finns mycket hydrofoba aminosyror. GÄr att undersöka genom hydropatiplot.
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-01-27
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och proteoglykaner. (4p) (Max 150 ord)
";"2 av 4:
+Glykoproteiner och proteoglykaner Àr bÄda former av glykokonjugat och bestÄr bÄda av proteiner och socker. Glykoproteiner Àr vÀldigt lÄnga och repetativa, tillskillnad frÄn proteoglykaner.
+BÄde glykoproteiner och proteoglykaner finns ut mot ECM och har nÄgot att göra med cellens kommunikation/interaktion med andra celler, bakterier och virus. De kan ocksÄ utgöra skydd.
+Glykoproteiner kan vara O-lÀnkade eller N-lÀnkade. Det vill sÀga om de Àr lÀnkade via syret (O) i serin eller teronins funktionella grupp eller via kvÀvet (N) i aspargins funktionella grupp.
kategory: kolhydrater
prov: 2024-01-27
frÄga: 7
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"Rita den principiella strukturen för en glykolipid. (4p)
";" + +kategory: cellmembran
prov: 2024-01-27
frÄga: 6
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende aminosyror Àr de mest troliga att förekomma mot ytan av ett cytoplasmatiskt protein?
+B och D
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-01-27
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden relaterade till pentosfosfatvÀgen Àr korrekt/korrekta? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+A och C
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2022-01-29
frÄga: 28
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"A. Hur mÄnga vÀtebindningar finns i AT resp. GC baspar?
+B. Hur pÄverkar baskompositionen DNA stabiliteten? (2p)
A.
+AT har 2 vÀtebidningar
+GC har 3 vÀtebidningar
B.
+Detta gör att vÀtebidningarna mellan G och C Àr stabilare eftersom det finns fler bidningspunkter.
+AT-bidningarna som har fÀrre bindningspunkter /par Àr dÀrmed ostabilare, detta Àr nÄgot som kan utnyttjas vid bl.a. transkription, eftersom DNA blir mer lÀttsmÀlt vid AT-rika sekvenser som TATA-boxen.
kategory: nukleotider
prov: 2022-01-29
frÄga: 5
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"För ett enzym Àr Michaelis-Mentens konstant (K_M) 15 mM. Vid en substratkoncentration pÄ 5 mM, vad Àr förhÄllandet mellan reaktionshastigheten V och den maximala reaktionshastigheten V_max? Motivera ditt svar. (Max 150 ord) (2p) +![[Pasted image 20251128081722.png]]
";"Reaktionshastigheten vid 5mM Àr alltsÄ en fjÀrdedel av hastigheten vid Vmax
+ +kategory: enzymer
prov: 2022-01-29
frÄga: 18
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"A) NÀmn tvÄ olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en vÀtebindning kan bildas. Ange vilka atomer som Àr donator respektive acceptor i vÀtebindningen.
+B) NÀmn tvÄ olika aminosyror mellan vilkas R-grupper en jonbindning kan bildas vid pH = 7.
a) Serin syre Àr donator, Asparagin kvÀve Àr acceptor
+b) Lysin, Aspartat
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-01-29
frÄga: 1
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"I en av delreaktionerna som katalyseras av chymotrypsin krÀvs nÀrvaro av vatten, medan i en annan delreaktion krÀvs det att inget vatten Àr nÀrvarande. Vilka Àr dessa delreaktioner och varför krÀvs nÀrvaro respektive frÄnvaro av vatten i de respektive stegen? (Max 150 ord) (2p)
";"I delreaktion 1 krÀvs inget vatten, dÄ his tar emot vÀtet frÄn asp som gör en nukleofilattack pÄ den inkommande peptidbidningen.
+I delreaktion 2 krÀvs vatten, för att den peptiden ska klyvas och slÀppa frÄn chymotrypsin
kategory: enzymer
prov: 2022-01-29
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden relaterade till nukleotiders nedbrytning Àr korrekt/korrekta? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. C
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2022-01-29
frÄga: 29
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Vilken/vilka av dessa Àr en omega-3 fettsyra? (1p) +![[Pasted image 20251128081622.png]]
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. A +2. B
+ +kategory: lipider
prov: 2022-01-29
frÄga: 4
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Bacterial DNA may end up in a bacteriophage due to (choose one or more)/Bakteriellt DNA kan hamna i en bakteriofag för att (vÀlj ett eller flera alternativ): (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. D
+ +kategory: rekombinant-dna-teknik
prov: 2022-01-29
frÄga: 16
";"rekombinant-dna-teknik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rekombinant-dna-teknik" +"Redogör för hur enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktokinas 2 regleras och spelar en central roll i glukosmetabolismen. Max 150 ord. (2p)
";"Enzymets aktivitet styrs av hormonreglering och fosforylering.
+NÀr insulin binder in till cellens recptor stimuleras PP1. Funktionen för PP1 Àr att defosforylera enzymet. NÀr fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 Àr defosforylerat inhiberas fosfatasdelen medan kinasdelen aktiveras. NÀr kinasdelen Àr aktiverad katalyseras reaktionen dÀr fruktos 6-fosfat blir fruktos-2,6-bisfosfat.
NÀr glukagon binder in till cellens receptor sÀtter en kaskadreaktion igÄng dÀr cAMP genereras, vilket aktiverar PKA. PKAs aktivitet leder till en inhibering av PP1 och en fosforylering av enzymet fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2. Fosforyleringen inhiberar kinas delen och aktiverar fosfataset. NÀr fosfatasdelen Àr aktiv katalyseras reaktionen dÀr fruktos-2,6-bisfosfat Äterbildas till fruktos 6-fosfat.
+Detta spelar en central roll i metabolismen dÄ hög koncentration av fruktos-2,6-bisfosfat (vilket bildas nÀr enzymet Àr defosforylerat) stimulerar glykolysenzymet fosfofruktikinas 1 (som katalyserar reaktionen fruktos 6-fosfat --> fruktos 1,6-bisfosfat) samtidigt som det inhiberar glykoneogenes enzymet fruktos 1,6-bisfosfatas (som katalyserar reaktionen fruktos 1,6-bisfosfat --> fruktos 6-fosfat).
+AlltsÄ fruktos 2,6-bisfosfatas/fosfofruktoskinas 2 styr mÀngden fruktos-2,6-bisfosfat vilket reglerar om cellen ska köra glykolys eller glukoneogenes.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-01-29
frÄga: 22
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Beskriv uppbyggnaden av ett GPI-ankare. (2p)
";"En GPI-ankare bestÄr av 3 olika molekyler bundna till varandra, den innersta delen fÀster till cellmembranet och den yttersta delen binder till tex. en kolhydrat.
+ +kategory: cellmembran
prov: 2022-01-29
frÄga: 32
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Redogör för mekanismen hos ATP-syntas i mitokondriens innermembran. Max 150 ord. (2p)
";"ATP-syntas funktion Àr att utnyttja den elektrokemiska gradienten som skapats av de protonpumpande komplexen i ETK, för att omvandla vÀtejoners rörelseenergi till kemisk bidningsenergi mellan fosfatgrupperna i ATP.
+Detta sker genom att vÀtejoner som strÀvar efter att ta sig frÄn mmu genom innermembranet till matrix för att jÀmna ut gradienten Äker in och neutraliserar en halvkanal i F0s c-ring, som roterar ett steg för varje vÀtejon som binder in. (NÀr vÀtejonen Äkt ett helt varv slÀpps den ut i matrix.) Rörelseenergin som skapas av rotationen i c-ringen leds genom den roterande gammasjÀlken till F1-enheten som finns i matrix och inducerar konformationsÀndringar i dess subenheter. ADP + Pi binder in i B-subeneheterna under Loose state, binds samman under Tense state och slÀpps ut som ATP under Open state.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2022-01-29
frÄga: 26
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Vilket/vilka av följande alternativ beskriver en funktion för poly-A svansen i 3'-Ànden pÄ eukaryot mRNA? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. A +2. C
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-01-29
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Vilka Àr de tvÄ viktigaste transportörerna av kvÀve frÄn kroppens vÀvnader till levern, och via vilka tvÄ andra molekyler kommer de tvÄ kvÀveatomerna, som slutligen hamnar i urea, föras in i ureacykelns cykliska del? (2p)
";"De tvÄ viktigate transportörerna av kvÀve frÄn kroppen vÀvnader Àr alanin och asparagin.
+KvÀveatomerna hamnar i urea cykeln genom glutamat, vars kvÀvegrupp reagerar med koldioxid och bildar karbamoyl som sedan reagerar och bildar citrulin. Och asparaginsyra som i nÀsta steg lÀmnar av sin kvÀvegrupp till citrulin som dÄ bildar argininsuccinat.
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2022-01-29
frÄga: 27
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Which protein is often required to initiate transcription by a bacterial RNA polymerase? How does it mediate initiation?/Vilket protein behövs ofta för att initiera transkription av bakteriellt RNA-polymeras? Hur underlÀttar det initieringen? (2p) Denna frÄga kan besvaras pÄ svenska eller engelska.
";"Proteinet CAP behövs för att binda in cAMP för att aktivera RNA-polymeraset, sÄ att det sedan kan hitta fram till promotorn och dÀr starta transkriptionen.
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2022-01-29
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Alexandra and Bill were the finalists of the Swedish Thermodynamics championship quiz. In a crucial tie-breaker, they were asked to say something about exergonic and endergonic reactions. Alexandra said: âIn an exergonic reaction, energy is released from the system to the surroundingsâ. Bill said: âIn an endergonic reaction, âG is negativeâ./Alexandra och Bill var finalister i Sveriges termodynamiska mĂ€sterskapsquiz. I en utslagsfrĂ„ga blev de ombedda att sĂ€ga nĂ„got om exergona och endergona reaktioner. Alexandra sa: âI en exergon reaktion avges energi frĂ„n systemet till omgivningenâ. Bill sa: âI en endergon reaktion Ă€r âG negativt.â (1p)
+VĂ€lj ett alternativ:
+RĂ€tt svar +1. B
+ +kategory: termodynamik
prov: 2022-01-29
frÄga: 17
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Vad gör proteinet glykogenin och vilken viktig roll spelar enzymet i relation till glykogenmetabolism? (2p)
";"Glykogenin Àr ett protein som fungerar som en primer i glykogensyntesen. Det har en enzymaktivitet som fÀster nÄgra glukos-enheter pÄ sig sjÀlv för att utgöra en primer som glykogensyntataset kan syntetisera vidare pÄ. Utan glykogenin skulle inte glykogensyntaset ha nÄgon reducerad Ànde att starta sin glykogensyntes ifrÄn och vi skulle dÀrmed inte kunna fÄ nÄgon glykogensyntes.
+ +kategory: glykogen
prov: 2022-01-29
frÄga: 23
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Rangordna molekylerna vatten, leucin, glukos och kvÀveoxid efter deras förmÄga att passera cellens plasmamembran. Starta med den molekyl som har lÀttast att passera. Ange tvÄ egenskaper hos varje molekyl av betydelse för deras placering i listan. (2p)
";"Vatten - liten, oladdad molekyl
+Glukos - hydrofob, relativt stor molekyl
+Leucin - oladdad, hydrofil ""kropp"" (alltsÄ NH3+ och COO-, inte R-kedjan)
+KvÀveoxid - laddad, hydrofil
kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2022-01-29
frÄga: 33
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Redogör för vilket sÀtt arsenikförgiftning pÄverkar metabolismen och vad som kan göras för att hÀva förgiftningen. Max 150 ord. (2p)
";"Arsenikförgiftning hÀmmar natrium/kalium-pumpen vilket förstör gradienterna. Pumpen upprÀtthÄller gradienter över membranet som annars skulle utjÀmnas av jonkanalerna. Cellen Àr beroende av gradienten för att upprÀtthÄlla vissa reaktioner i cellen och transporter över cellmembranet. Bl.a. sÄ utnyttjas den uppbyggda kaliumgradienten för att aktivit (sekundÀr aktiv transport) transportera glukos in i cellen genom att kalium som transporteras med sin gradient drar med sig glukosmolekylen mot sin gradient in i cellen.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-01-29
frÄga: 24
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Explain how proofreading works at the molecular level during bacterial replication./Förklara hur korrekturlÀsning fungerar pÄ molekylÀr nivÄ under bakteriell replikation. (2p) Denna frÄga kan besvaras pÄ svenska eller engelska.
";"DNA-polymeras 3 har bÄde en DNA-syntetiserande del och en exonukleas del, detta gör det möjligt för polymeraset att ""backtracka"" om den skulle upptÀcka att nÄgot basparat fel. Detta gör den genom sin exonukleas-aktivitet dÀr den klyver peptidbidningar (genom att backa) 3Ž till 5Ž. NÀr den klyvt bort den/de felparade baserna syntetiserar den nya baser 5Ž till 3Ž och fortsÀtter som vanligt.
+DNA-polymeras 1 vars funktion Àr att klippa bort RNA-primer och syntetisera nya baser i gapsen har samma exonukleasa funktion (3Ž till 5Ž radering) för att korrigera den korta del den nyligen syntetiserat om ett fel skulle upptÀckas.
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2022-01-29
frÄga: 10
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Discuss the evolutionary origin of RNase P. This question needs to be answered in English. (Max 100 words.) (2p)
";"The RNaseP is an enzyme consisting of both RNA and protein. By comparing the level of protein in different organisms we can see that in less complex organisms like bacteria the enzyme consists of most RNA and only one protein unit, comparing with ""arkener"" which is a more complex organism there is shorter/smaller RNA unit and more protein units. In even more complex organisms like humans the protein units are much greater than the RNA-unit. This provens the hypothesis that RNA also acted as enzymes long time ago, before ""the tasks were split"" to proteins to be more efficient.
+ +kategory: evolution
prov: 2022-01-29
frÄga: 9
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"I vilken ordning genomförs nedanstÄende steg nÀr plasmider ska renas? (1p)
+kategory: plasmid
prov: 2022-01-29
frÄga: 34
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Vad Àr intron och exon? (2p)
";"Intron och exon Àr bÄda en del av den transkriberade omogna RNA-kedjan. För att skapa ett moget mRNA klipps introner (""onödiga"" RNA-sekvenser) bort genom splicing. Medan de sekvenser som krÀvs för transaltion utgör den mogna RNA-kedjan och anvÀnds som mall i proteinsyntesen.
+Det finns flera exon pÄ samma mRNA kedja, vissa exon kan ocksÄ klippas bort för att samma gen kan koda för olika protein. Vilket protein som uttryck styrs av miljön i cellen och beror alltsÄ pÄ vilka exon som sparas.
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-01-29
frÄga: 14
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden stÀmmer för ATP? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. C +2. D
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2022-01-29
frÄga: 20
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Syntes av heme beror pÄ cellens tillgÄng till jÀrn. Beskriv vad som sker nÀr jÀrntillgÄngen Àr lÄg. (2p)
";"PÄ mRNA som anvÀnds som mall för att syntetisera ALA-syntetaset som behövs vid hemsyntes finns den reglerande sekvensen IRE, Ire Respossible Element. NÀr jÀrntillgÄngen Àr lÄg binder IRP, IRE-binding protein, till IRE vilket hÀmmar translationen av det nödvÀndiga enzymet ALA-syntas. Detta inhiberar hemsyntesen, vilket Àr syftet eftersom vi inte har nÄgot jÀrn.
+ +kategory: heme
prov: 2022-01-29
frÄga: 30
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"What regions of a tRNA are recognized by amino-acyl-tRNA synthetases?/Vilka regioner hos tRNA kÀnns igen av amino-acyl-rRNA syntetaser? (2p)
+Denna frÄga kan besvaras pÄ svenska eller engelska.
OH-gruppen pÄ 3ŽÀnden
+Den specifika nukleotidsekvensen nÀst lÀngst ut pÄ 3ŽÀnden
kategory: translation
prov: 2022-01-29
frÄga: 15
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Vilken av nedanstÄende metaboliter Àr mest reducerad? (1p)
+VĂ€lj ett alternativ:
+RĂ€tt svar +1. D
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2022-01-29
frÄga: 21
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Vilket av följande pÄstÄenden Àr helt korrekt avseende reglering av den intracellulÀra kolesterolhalten? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. D
+ +kategory: kolesterol
prov: 2022-01-29
frÄga: 31
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Vilken/vilka av nedanstÄende produceras vid beta-oxidation? (1p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. B
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2022-01-29
frÄga: 25
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Vilken roll spelar Mediatorn vid transkriptionell aktivering? (2p)
";"Mediatorn fungerar som en sambandscentral mellan enhancern (och dess aktivatorprotein) och promotorsekvensen, enhancern ligger ca 1000 baspar bort, men pÄverkar transkriptionen för sin specifika gen.
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-01-29
frÄga: 11
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Du trÀffar en patient som du misstÀnker har drabbats av HIV. Du kommer att anvÀnda en Indirekt ELISA för att ta reda pÄ detta. (Max 150 ord.) (2p)
+A) Beskriv de olika stegen för en Indirekt ELISA.
+B) Detekterar denna metod patientens antikropp eller antigen?
A.
+Ett specifikt antigen fÀsts i en brunn, patientens prov tillsÀtts, sköljning genomförs för att sortera bort de antikroppar som inte fÀst till antigenet, ytterligare en antikropp tillsÀtts som binder till den första antikroppen, fÀrg som binder till den andra antikroppen tillsÀtts, provet fÀrgas om antikroppen Àr detekterad.
B.
+Antikropp
kategory: utforska-proteiner
prov: 2022-01-29
frÄga: 8
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::utforska-proteiner" +"Du arbetar pĂ„ en vĂ„rdcentral dĂ€r du förvĂ„nas över att mĂ„nga patienter med njursvikt (=dĂ„lig njurfunktion) tidigare har haft gikt (âportvinstĂ„â). Du bestĂ€mmer dig dĂ€rför för att undersöka om patienter med gikt löper en högre risk att utveckla njursvikt Ă€n patienter utan gikt. Vilken av nedanstĂ„ende Ă€r den mest rimliga nollhypotesen? (1p)
+VĂ€lj ett alternativ:
+B
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2022-01-29
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Diskutera molekylÀra likheter och skillnader mellan mekanismerna bakom galaktosemi och laktosintolerans. (2p)
";"Laktos Àr en molekyl som bestÄr av glukos och galaktos.
+BÄda sjukdommarna beror pÄ brist av enzymet som bryter ned den specifika molekylen.
+I laktosintolerans handlar det om enzymet laktas som spjÀlkar laktos till galaktos och glukos, medan det i galaktosemi handlar om enzymet som omvandlar galaktos till glukos.
Vid obehandlad galaktosemi ansamlas galaktos, vilket leder till att galaktos gÄr ut i blodet och omvandlas till den toxiska molekylen galaktitol, vilket Àr mycket farligt. Vid obehandlad laktos bryts inte laktosmolekylen ned i tunntarmen som kroppen annars hade gjort, utan den fortsÀtter genom magtarmkanalen tills den hamnar i tjocktramen dÀr den fermenteras av bakterier, vilket leder till gasbildning och buksmÀrtor. Ometaboliserad laktos blir alltsÄ inte toxiskt som galaktos(--> galaktitol).
+Den vanligaste behandlingen för bÄda intoleranserna handlar frÀmst om att utesluta den sjukdomsframkallande molekylen. BÄda molekylerna finns i komjölk, vilket alltsÄ ska undvikas. Vid laktosintolerans finns laktosfria mjölkprodukter, det finns dÀremot inte galaktosfria mjölkprodukter.
+ +kategory: kolhydrater
prov: 2022-01-29
frÄga: 3
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kolhydrater" +"En allvarlig komplikation till bl.a. Covid-19 Ă€r sĂ„ kallad Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS), vilket ger en gravt sviktande lungfunktion orsakad av inflammation och vĂ€tskeansamling (ödem) i alveolerna. Ădemet leder till att mindre syre nĂ„r blodet och att mindre koldioxid lĂ€mnar blodet. Beskriv i detalj hur den minskade mĂ€ngden syre och den ökade mĂ€ngden koldioxid pĂ„verkar hemoglobinets struktur och funktion. (2p)
";"Den ökande mĂ€ngden koldioxid stabiliserar T-state, deoxy-formen, av hemoglobin vilket minskar hemoglobinets affinitet för syre och gör det svĂ„rare för syremolekylen att binda in. Detta sker bl.a. genom att koldioxid binder i till hemoglobins ena peptidĂ€nde, vilket gör det möjligt för saltbryggor att Ă„terskapas vilket stabiliserar T-state (tense state). Ăkad mĂ€ngd koldioxid innebĂ€r Ă€ven lĂ€gre PH i blodet, dvs. ökad mĂ€ngd vĂ€tejoner - vilka kan binda in till hemoglobin och de möjliggör ocksĂ„ Ă„terskapandet av saltbryggor för hemoglobinet.
+Vid lungorna ska normalt sett den höga syrehalten och det högre PHt leda till att koldioxidet och vÀtejoner slÀpper, för att destabilisera T-state. NÀr syrehalten Àr lÄg Àr PH i blodet vid lungorna nÄgot lÀgre Àn normalt vilket gör det svÄrare för denna reaktion att ske.
+Syrehalten ska ocksÄ bidra till att en syremolekyl initialt binder in till jÀrnet i en subenhet. Eftersom hemoglobin Àr ett kooperativ av 4 subenheter med 4 hemgrupper leder inbidningen av syre i en enhet till en konformationsÀndring i de andra subenheterna vilket gör jÀrnemolekylerna mer tillgÀngliga för syre att binda in till. Detta stimulerar R-state och oxy-formen av hemoglobin. Den lÄga syrehalten gör ""sannolikheten lÀgre"" för det första syret att binda in, och konformationsÀndringen sker dÄ inte.
+Vanligtvis sker denna vÀxling mellan T- och R-state pÄ sÄ vis att koldioxid konc. Àr högst i muskler och stimulerar T-state vilket gör att syret slÀpps av dÀr det behövs. à andra sidan Àr koncentrationen syre tillrÀckligt hög vid lungorna för att stimulera R-state och binda in syre. Dessa konformationsÀndringar Àr nödvÀndiga för ett sÄ effektivt gasutbyte som möjligt och för att syre ska binda och slÀppa pÄ rÀtt stÀlle. NÀr dessa koncentrationer Àndras och koldioxidhalten i bloden blir för hög i relation till syrehalten rubbas samspelet mellan dessa konformationsformer och T-state, deoxyformen blir dominerande.
+ +kategory: hemoglobin
prov: 2022-01-29
frÄga: 7
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden om RNA Àr korrekta?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. A +2. C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2022-01-29
frÄga: 6
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Vilket/vilka av nedanstÄende kan hittas i ett protein?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. A +2. B +3. D
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-01-29
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kvÀveatomer som ingÄr i följande tvÄ nukleotider dÄ dessa bryts ner? (1p)
+A: AMP
+B: CMP
A: Urat
+B: Urea
kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2022-05-16
frÄga: 28
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Rita syredissociationskurvan för hemoglobin och myoglobin. Vilken strukturell skillnad mellan myoglobin och hemoglobin förklarar skillnaden i dissociationskurvorna? (2p) (Max 100 ord)
";"Myoglobin bestÄr av en subenhet och har mycket affinitet för syre. Myoglobin har en mycket brant dissociationskurva. Man kan sÀga att myoglobin fungerar som en on-off knapp, dÄ den antingen Àr oxiderad (oxyform) eller deoxiderad (deoxyform). Myoglobin Àr dÀrför bra för lagring av syre men vÀldigt dÄligt för syretransport.
+Tillskillnad frÄn myoglobin bestÄr hemoglobin av fyra subenheter. Hemoglobin har inte lika brant dissociationskurva, vilket innebÀr att hemoglobin Àr lÀmplig för transport av syre. Hemoglobin blir oxyform i lungorna dÀr syrehalten Àr stor. I musklerna slÀpper hemoglobinet sina syre atomer gradvist och till slut blir den deoxyform.
+![[Pasted image 20251129234842.png]]
+ +kategory: hemoglobin
prov: 2022-05-16
frÄga: 5
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende molekyler har sitt ursprung i en B vitamin?
+RĂ€tt svar +1. A +2. D
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-05-16
frÄga: 18
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"A) Vad Àr mukopolysackaridos?
+B) Beskriv den biokemiska bakgrunden för mukopolysackaridos. (2p)
A.
+Mukopolysackaridos Àr en sjukdom som innebÀr att GAG (glukoaminoglukaner) inte kan brytas ner. DÄ ansamlas GAGs i blodet och kroppens vÀvnader vilket har negativa konsekvenser pÄ kroppen.
B.
+GAG finns i proteoglykaner och bestÄr av repeterande disackarid enheter. Disackariden bestÄr av en negativt laddad monosackarid och en annan monosackarid som innehÄller en acetylamin grupp (till exempel acetylgalaktosamin). Nedbrytningen av GAG behöver speciella enzymer. NÀr dessa enzymer fungerar inte som de ska bryts GAGs inte ner. DÄ ansamlas stora mÀngder av GAG i kroppen.
kategory: kolhydrater
prov: 2022-05-16
frÄga: 1
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxiderats fullstÀndigt. I vilken ordning kommer följande enzymer att vara verksamma i den processen? (1p)
+kategory: glykolysen
prov: 2022-05-16
frÄga: 19
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Ribos-5-fosfat kan bildas pÄ tvÄ olika sÀtt i pentosfosfatvÀgen. I det ena fallet utnyttjas enbart den icke-oxidativa fasen av denna metabola vÀg. Vilka tvÄ glykolysintermediÀrer utnyttjas i detta fall för syntesen av ribos-5-fosfat? Ange molekylernas fullstÀndiga namn, inte förkortningar. (1p)
";"fruktos-6-fosfat och glyceraldehyd-3-fosfat
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2022-05-16
frÄga: 29
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp som deras R-grupper kan delta i nÀr pH Àr 7. (1p)
+Möjliga bindningstyper: +- kovalent bindning +- jonbindning +- van der Waals interaktion +- vÀtebindning
+Aminosyror: +- Arginin +- Asparagin +- Fenylalanin +- Tyrosin
";"Fenylalanin: van der Waals interaktion +Asparagin: vÀtebindning +Arginin: jonbindning +Tyrosin: van der Waals interaktion
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-05-16
frÄga: 4
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Hexokinas Àr ett enzym som kan anvÀnda bÄde D-glukos och D-fruktos som substrat. Km för D-glukos = 0.05 mM Àr, och för D-fruktos = 1.5 mM. Vmax Àr detsamma för bÄda substraten. Vid samtidig tillsats av 1 mM av bÄda substraten till enzymet kommer produkter att bildas. Vilket substrat kommer att förbrukas först? Motivera svaret. (2p)
";"Km Àr substratkoncentrationen nÀr enzymhastigheten Àr hÀlften av den maximala enzymhastigheten (Vmax/2). Ett lÀgre Km-vÀrde innebÀr att enzymet kommer att nÄ hÀlften av sin maximala hastigheten vid en mindre substratkoncentration. Om vi jÀmför Km-vÀrdet för D-glukos och D-fruktos sÄ ser vi att Km-vÀrdet Àr lÀgre för D-glukos. Detta innebÀr att hexokinas kommer att förbruka D-glukos snabbare.
+ +kategory: enzymer
prov: 2022-05-16
frÄga: 16
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Ange vilka tvÄ av följande som Àr en ketonkropp. (1p)
+RĂ€tt svar +1. B +2. D
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2022-05-16
frÄga: 22
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Beskriv hur lipid rafts Àr uppbyggda. (2p)
";"Lipid rafts Àr uppbyggda av kolesterol, sphingomyelin och glukolipider.
+ +kategory: cellmembran
prov: 2022-05-16
frÄga: 32
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Vilka tvÄ av följande aminosyror rÀknas som rent glukogena?
+A och D
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2022-05-16
frÄga: 26
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. A +2. B
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2022-05-16
frÄga: 12
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till ureacykeln Àr korrekta?
+B och C
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2022-05-16
frÄga: 27
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Vilken roll spelar tryptofanrepressorn vid tryptofanoperonet? Hur styrs dess aktivitet av mÀngden tryptofan? (2p)
";"Tryptofanoperonet kodar för enzymer som Àr essentiella för bildningen av tryptofan. Tryptofanrepressorn binder till operatorn i tryptofanoperonet och hÀmmar transkriptionen. NÀr en tryptofan molekyl binder sig till tryptofanrepressorn, kommer tryptofanrepressorn att kunna binda till operatorn och hÀmma transkriptionen av tryptofanoperonet. Vid brist pÄ tryptofan, kommer trymptofanrepressorn inte att vara bunden till nÄgra tryptofan molekyler och dÀrmed kommer tryptofanrepressorn att lösna frÄn operatorn och tillÄta transkriptionen av tryptofanoperonet.
+Mycket tryptofan => tryptofanrepressorn binder => Transkriptionen hÀmmas
+Lite tryptofan => tryptofanrepressorn lössnar => Transkriptionen stimuleras
kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2022-05-16
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden om övergÄngstillstÄndet vid en enzym-katalyserad reaktion stÀmmer?
+RĂ€tt svar +1. A +2. C
+ +kategory: enzymer
prov: 2022-05-16
frÄga: 17
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"2,4-dinitrofenol Àr en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)
";"2,4-dinitrofenol Àr en frikopplare, vilket innebÀr att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol Àr en hydrofob molekyl som kan lÀtt diffundera frÄn mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vÀtejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till vÀrme.
+Protongradienten behövs för att producera ATP. NÀr protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprÀtthÄlla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, dÄ kroppen bryter ner en stor mÀngd av fett. Vilka tvÄ av nedanstÄende enzymer katalyserar en dekarboxylering?
+kategory: citronsyracykeln
prov: 2022-05-16
frÄga: 23
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::citronsyracykeln" +"Proteinet pĂ„ bilden transporterar glukos och Naâș frĂ„n tarmen in i epitelceller.
+A) Vilken typ av transportör Àr det?
+B) Vilken typ av transport sker för glukos?
+C) Vilken Àr drivkraften bakom transporten av glukos?
+(Max 75 ord)
![[Pasted image 20251128083857.png]]
";"A. Symport
+B. SekundÀr-aktivtransport
+C. Vid sekundÀr-aktivtransport anvÀnds en molekyl koncentrationsgradient för att transportera en annan molekyl mot sin koncentrationsgradient. Vid transport av glukos anvÀnds Na jonernas koncentrationsgradient som drivkraften. Det Àr termodynamiskt fördelaktigt att transportera Na in i cellen dÄ det sker med koncentrationsgradienten.
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2022-05-16
frÄga: 33
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"2,4 -dinitrofenol Àr en frikopplare och ett effektivt bantningspreparat. Förklara hur 2,4 -dinitrofenol leder till viktminskning. (2p) (Max 150 ord)
";"1.5p av 2: +2,4-dinitrofenol Àr en frikopplare, vilket innebÀr att den förstör protongradienten över mitokondriens inremembran. 2,4-dinitrofenol Àr en hydrofob molekyl som kan lÀtt diffundera frÄn mitokondriens intermembranutrymmet till matrix. 2,4-dinitrofenol kan binda till vÀtejoner och transportera de över mitokondriens inre membran, vilket förstör protongradienter och ger upphov till vÀrme.
+Protongradienten behövs för att producera ATP. NÀr protongradienter förstörs kommer cellen att bryta mer fettsyror ner för att upprÀtthÄlla gradienter. Detta gör att upptag av 2,4-dinitrofenol leder till viktminskning, dÄ kroppen bryter ner en stor mÀngd av fett.
+AI: +2,4-Dinitrofenol (DNP) frikopplar oxidativ fosforylering genom att transportera protoner över det inre mitokondriemembranet. NÀr protongradienten kortsluts kan ATP-syntas inte anvÀnda energin i elektrontransportkedjan för att bilda ATP.
+Cellerna svarar genom att öka oxidationen av fett och kolhydrater för att försöka upprĂ€tthĂ„lla ATP-nivĂ„erna, vilket kraftigt ökar metabolismen och vĂ€rmeproduktionen. Denna ineffektiva energiomvandling gör att mer brĂ€nsle förbrukas per producerad ATP â snabb viktminskning.
+Den ökade syreförbrukningen och vÀrmeproduktionen kan bli livshotande, eftersom DNP ger hypertermi, acidos och organsvikt vid relativt smÄ doser.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-05-16
frÄga: 24
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingÄr flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. A +2. D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-05-16
frÄga: 10
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Hur kan en punktmutation i ett intron leda till human sjukdom? (2p) (Max 25 ord).
";"Genom att skapa nya splice-sites i intronen som leder till att mRNAt klivs felaktigt, som gör att mRNAt kan koda för fel proteiner.
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-05-16
frÄga: 9
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Förklara kortfattat vad som menas med
+A) Selektion av antibiotikaresistenta bakterier
+B) BlÄvit screening
(2p) Den hÀr frÄgan kan besvaras pÄ svenska eller engelska.
";"A. Selektion av antibiotikaresistenta bakterier innebÀr att odla bakterier i en miljö med antibiotika. DÄ kommer bara de bakterier med antibiotikaresistens att överleva, medan de bakterier utan antibiotika resistens kommer att dö ut. Ampicillin Àr ett exempel av antibiotika som anvÀnds vid selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Genom att anvÀnda plasmider som innehÄller antibiotikaresistens-gener kommer endast de bakterier som bÀr pÄ dessa plasmider att överleva i en antibiotikarik miljö.
+B. BlÄvit screening Àr ett metod att skilja mellan bakterier med plasmider och bakterier utan plasmider. Bakterier med plasmider har en klyvd lac-operon och dÀrför kommer inte de fÀrgas vid addition av x-GAL, dÄ sÀger man att de Àr vita kolonier. Bakterier utan plasmider har en fullt fungerande lac-operon och kommer att fÀrgas blÄtt vid addition av x-GAL, dÄ sÀger man att de Àr blÄ kolonier.
+ +kategory: plasmid
prov: 2022-05-16
frÄga: 34
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Hur Àr det möjligt för en bakterie att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner frÄn enbart ett mRNA-transkript? (2p)
";"Till skillnad frÄn eukaryouter dÀr mRNAt har endast en startkodon (AUG), har bakterier flera start kodoner inom samma mRNA molekyl. I bakterier har mRNAt ""shine dalgarno"" sekvenser i nÀrhet till startkodonerna AUG. Dessa ""shine dalgarno"" sekvenser kÀnns igen med hjÀlp av S16 subenheten som i sin tur finns i S30 subenheten av ribosomen (ocksÄ kallad den lilla subenheten). Detta förklarar hur det Àr möjligt att initiera proteinsyntes av flera olika proteiner frÄn enbart ett mRNA-transkript i bakterier.
+ +kategory: translation
prov: 2022-05-16
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"I vilka tvÄ vÀvnader hittar vi framförallt glykogen hos mÀnniska, och vilken huvudsakliga funktion har glykogenet i respektive vÀvnad? (2p)
";"Glykogen finns i muskelvÀvnad och i levern.
+Glykogen i levern anvÀnds för att reglera glukoshalten i blodet. Glykogen bryts ner till glukos-1-fosfat och omvandlas senare till glukos-6-fosfat med hjÀlp av enzymet fosfoglukomutas. Glukos-6-fosfat kan defosforyliseras till glukos med hjÀlp av enzymet glukos-6-fosfatas som endast finns i levern. Senare kan glukos molekylerna frisÀttas frÄn levern till blodet.
+Muskler saknar enzymet glukos-6-fosfatas vilket innebÀr att muskler kan inte skapa glukos och frisÀtta det i blodet. Glykogenet i muskler anvÀnds dÀrför som energireserv, genom att brytas ner till glukos-6-fosfat som kan fortsÀtta i glykolysen och till sist producera ATP.
+ +kategory: glykogen
prov: 2022-05-16
frÄga: 20
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Vilken typ av bilirubin (konjugerat eller okonjugerat) Àr förhöjt vid hemolytisk sjukdom? Förklara varför. (2p)
";"I mjÀlten bryts hem ner till biliverdin och sedan omvandlas till okonjugerat bilirubin som frisÀtts i blodet. I levern konjugeras bilirubinet och utsöndras via galla. Konjugeringen sker för att göra den hydrofoba bilirubinet amfipatisk och vattenlöslig. Vid hemolytiska sjukdomar ökar nedbrytningen av röda blodkroppar i mjÀlten vilket ger upphov till förhöjt koncentration av okonjugerat bilirubin. Om levern inte kan ta hand om de stora koncentrationer av okonjugerat bilirubin i blodet ansamlas okonjugerat bilirubin i stora koncentrationer.
+ +kategory: heme
prov: 2022-05-16
frÄga: 30
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"A biologist studying a new bacterial strain identified in Göteborg is interested in the following two new biochemical reactions:
+P + HâO -> Q + Pi (âG = -38 kJ/mol)
+X + Y -> Z + HâO (âG = +55 kJ/mol)
What does âG mean in Thermodynamics? Which of the two reactions is spontaneous and what is the explanation for this? /
+En biolog som studerar en ny bakteriestam som har identifierats i Göteborg Àr intresserad av följande biokemiska reaktioner:
P + HâO -> Q + Pi (âG = -38 kJ/mol)
+X + Y -> Z + HâO (âG = +55 kJ/mol)
Vad avses med âG inom termodynamiken? Vilken av reaktionerna Ă€r spontan och vilken Ă€r anledningen till det?
+This question needs to be answered in English. (2p) (Max 100 words)
";"G (Gibbs free energi) means the change of free energy in the system. Delta-G explains how the free energi in the system change after a specific reaction. Negative delta-G means the reaction is spontaneous, while positive delta-G indicates that the reaction is not spontaneous and is not thermodynamicly favorable. The spontaneous reaction is P + HâO -> Q + Pi because it has negativ Delta-G.
+ +kategory: termodynamik
prov: 2022-05-16
frÄga: 15
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och Àr dÀrmed reglerat pÄ flera nivÄer. (2p) (Max 120 ord)
+A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen?
+B) Varför Àr det viktigt att komplexet Àr reglerat?
+C) En typ av reglering av komplexet Àr av feedforwardtyp. Redogör för vad feedforwardreglering innebÀr samt vad som ger feedforwardreglering av komplexet och hur.
A. Pyruvatdehydrogenaskomplexet Àr lÀnken mellan glykolysen och citronsyracykeln. Komplexet katalyserar den irreversibla nedbrytningen av pyruvat till koldioxid och acetyl-Coa.
+B. Komplexet styr en irreversibel reaktion dÀr pyruvat bryts ner till Acetyl-Coa. Acetyl-Coa kan inte anvÀndas för Äterbilda pyruvat och dÀrför mÄste den anvÀndas i andra metabola vÀgar. DÀrför Àr enormt viktigt att reglera komplexet för att inte slösa pyruvat onödigt.
+C. Feedforwardreglering innebÀr att substraten i en reaktion stimulerar enzymet som katalyserar denna reaktion. Pyruvat ger feedforwardreglering av pyruvatdehydrogenaskomplexet, dÄ ökade koncentrationen av pyruvat leder till att komplexet stimuleras. DÄ bryts pyruvat till Acetyl-Coa för att minska koncentrationen av pyruvat.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-05-16
frÄga: 21
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Beskriv kortfattat tvÄ huvudsakliga mekanismer för hur cellens intracellulÀra kolesterolkoncentration regleras. (2p)
";"Transkriptionen av HMGR kan regleras. Vid lÄg halt av kolesterol kommer Insig-proteinet att lössna frÄn scap-SREBP komplexet i ER, vilket gör att scap-SREBP transporteras till golgia apparaten med hjÀlp av COPII. SREBP bryts ner av enzymerna S1P och S2P, vilket gör att den N-terminala delen av SREBP frigörs till cellkÀrnan. I cellkÀrnan kan den N-terminala delen av SREBP binda till SRE-1, vilket bland annat ökar transkriptionen av enzymet HMGR. HMGR katalyserar första steget i kolesterolsyntesen dÀr HMG omvandlas till mevalonat.
+Translationen av HMGR-mRNAt kan regleras med hjÀlp av oxylanesterol-halten i cellen. En hög halt oxylanesterol (orsakad av hög halt av kolesterol) leder till att mindre polysomer binder till HMGR-mRNAt, vilket leder till mindre translation av HMGR. à andra sidan kommer en lÄg oxylanesterol-halt (orsakad av lÄg halt av kolesterol) i cellen att leda till att fler polysomer binder sig till HMGR-mRNAt, dÄ translateras fler HMGR som stimulerar kolesterolsyntes.
+kategory: kolesterol
prov: 2022-05-16
frÄga: 31
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"A. Vad innebÀr redoxpotential?
+B. Ge tvÄ exempel pÄ redoxpar som förekommer i elektrontransportkedjan.
+(2p) (Max 75 ord)
A. Redoxpotential innebÀr ett molekyls förmÄga att ta upp elektroner. Hög redoxpotential innebÀr att molekylen har stor affinitet till elektroner (molekylen vill ta upp mer elektroner), medan lÄg redoxpotential innebÀr att molekylen har lÄg affinitet till elektroner (molekylen vill avge sina elektroner).
+B. Ubiquiton (Q) och Ubiquinol (QHâ). QHâ har lĂ€gre redoxpotential Ă€n Q, dĂ„ QHâ vill avge sina tvĂ„ elektroner. FADHâ och FAD Ă€r ett annat redoxpar i elektrontransportkedjan.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2022-05-16
frÄga: 25
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden om histoner Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. B +2. C
+ +kategory: kromatin
prov: 2022-05-16
frÄga: 11
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i vÄra celler. (2p)
";"Endosymbios Àr en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin gÄr ut pÄ att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, dÀr den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism Ät den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis pÄ att endosymbios teorin stÀmmer Àr att mitokondrier har egna DNA.
+ +kategory: evolution
prov: 2022-05-16
frÄga: 8
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Du vill sÀtta upp en studie för att ta reda pÄ hur lÄng tid det tar för blod att koagulera hos friska individer. Du vill fÄ ett relativt litet standardfel (SE) för att kÀnna att du har lyckats fÄ en bra skattning av hur lÄng tid det brukar ta för blod att koagulera. SE kan hÀrledas fram med hjÀlp av tvÄ parametrar. Vilka Àr parametrarna och hur ska de se ut om du vill fÄ ett litet vÀrde pÄ SE? (2p) (Max 50 ord.)
";"1- Ju större antal individer som försöket utförs pÄ desto lÀgre SE.
+2- Ju mer lika dessa individers egenskaper Àr (Älder, kön, hÀlsa, kost mm.) desto lÀgre SE.
kategory: introduktionslaboration
prov: 2022-05-16
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"NÀr protoner transporteras över mitokondriens inre membran genom ATPsyntas spelar specifika aminosyror en viktig roll. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar protontransporten behöver ha och vad som möjliggör protontransporten. Ge Àven ett exempel pÄ en aminosyra som har den egenskapen. (2p) (Max 100 ord)
";"ATPsyntasets transmembranella del (F0) ansvarar för transporten av protoner över mitokondriens inre membran. F0 innehÄller en roterande c-ring som bestÄr av 10 c-subenheter samt en a-subenhet som protoniserar och deprotoniserar c-subenheterna. NÀr en c-subenhet protoniseras, nutraliseras ett negativt laddat aminosyra i c-subenheten, vilket leder till en konformationsÀndring som tillÄter c-ringen att rotera. En protoniserad c-subenhet roterar en varv runt c-ringen innan den slÀpper sin proton, dÄ blir aminosyran negativt laddad som i början.
+Exempel pÄ ett negativt laddad aminosyra: Aspartat
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-05-16
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Beskriv kortfattat hur endosymbios gav upphov till en viktig organell i vÄra celler. (2p)
";"Endosymbios Àr en teori som förklarar mitokondriens uppkomst i eukaryota celler. Teorin gÄr ut pÄ att en stor anaerob eukaryotcell har endocyterat en aerob bakterie. Den eukaryota cellen och bakterien lever i symbios, dÀr den eukaryota cellen försörjer bakterien med metaboliter medan bakterien utför aerob metabolism Ät den eukaryotacellen. Bakterien har senare utvecklats till mitokondrie. En bevis pÄ att endosymbios teorin stÀmmer Àr att mitokondrier har egna DNA. A. Hur skiljer sig endonukleaser frÄn exonukleaser?
+B. Skriv det fullstÀndiga namnet för dADP?
+(2p)
A. Endonukleaser klipper nukleinsyror frÄn mitten, medan exonukleaser klipper nukleinsyror frÄn Àndarna (antingen frÄn 3' till 5' riktning eller frÄn 5' till 3'). Detta utförs genom att bryta fosfodiesterbindningen mellan nukleotiderna.
+B. Deoxyadinosindifosfat
+ +kategory: nukleotider
prov: 2022-05-16
frÄga: 7
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Du har fÄtt i uppgift att preparera fram ett protein ur ett homogenisat och du kommer anvÀnda tre olika metoder för detta. Beskriv varje metod kortfattat samt ange vilken proteinegenskap som anvÀnds för separationen (2p) (Max 200 ord)
+A. Gelfiltrering
+B. Jonbyteskromatografi
+C. Affinitetskromatografi
A. Vid gelfiltrering bestÄr den fasta fasen av kulor med hÄligheter. Vid gelfiltrering filtreras proteinerna storleksmÀssigt, dÀr smÄ proteiner binder till kulorna medan de stora proteiner fortsÀtter vidare genom kolumnen. DÀrför kommer protienerna med störst massa först ut, och proteinerna med lÄg massa hamnar sist i filtreringen.
+B. Jonbyteskromatografi filtrerar protiener beroende pÄ laddning. De finns tvÄ typer av jonbyteskromatografi. Första typen Àr anjonsbytare, dÀr proteinerna med positiv laddning kommer ut först. Andra typen Àr katjonsbytare dÀr jonerna med negativ laddning kommer ut först. Den fasta fasen bestÄr av kulor med antingen negativ eller positiv laddning som kan fÀsta till de laddade proteinerna med hjÀlp av jonbindningar.
+C. Affinitetskromatografi Àr en filtreringsmetod som Àr baserad pÄ att filtrera protiener med hjÀlp av en speciell egenskap hos proteinerna. Till exempel kan proteinernas glykolysering anvÀndas för att filtrera protienerna.
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2022-05-16
frÄga: 6
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Nya regler frÄn EU ska se till att minimera mÀngden transfetter i livsmedel. Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer om transfetter? (1p)
+RĂ€tt svar +1. A +2. B
+ +kategory: lipider
prov: 2022-05-16
frÄga: 2
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Redogör för ett skÀl till att man inte kan sÀga exakt hur mÄnga protoner som behöver förflyttas över mitokondriens inre membran för varje ATP som bildas av ATP-syntaset. Förklara ocksÄ hur protonerna förflyttas i ATP-syntaset. (4p) Max 80 ord.
";"3.5 av 4 poÀng +C-ringen Àr bunden till ATP-syntasets matrix del via en gamma stjÀlk. Inre delen bestÄr av 6 subenheter, 3 beta och 3 alfa. Det Àr beta subenheterna som sköter produktion av ATP dÄ de har 3 konformationer, loose(tar emot ADP+pi), tense (bildar ATP) och open (ATP lÀmnar). NÀr en proton binder till c-subenhet neutraliserar det en negativladdad aa --> c ringen roterar - -> gamma-stjÀlken + b-subenheter roterar-->ATP-produktion. -SvÄrt att sÀga exakt atntal H+ eftersom frikopplare utjÀmnar gradienten utan att tillverka ATP. Ord: 80 TotalpoÀng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen +AI-rÀttning
+kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2025-02-01
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::elektrontransportkedjan" +"Du jobbar pĂ„ labb över sommaren och har fĂ„tt in en patient som du misstĂ€nker Ă€r smittad av HIV. (4p) Max 200 ord. (Lista AâB i ditt svar nedan!)
+A) NÀmn en analysmetod som kan anvÀndas för att undersöka detta samt beskriv de olika stegen i metoden.
+B) Vilken substans hos patienten undersöks med denna metod?
a) För att undersöka huruvida en patient Àr smittad av HIV eller inte, kan metoden indirekt ELISA anvÀndas. I denna metod har vi först en brunn med HIV-antigener. Prov frÄn patienten tillsÀtts för att senare kunna se om dess antikroppar binder till antigenerna, och dÀrefter sköljer vi för att undvika att oönskade substanser ska pÄverka resultatet. Senare tillsÀtts enzymbundna antikroppar till provet, och sedan sköljer vi igen. EfterÄt tillsÀtts ett substrat som binder till enzymet. Om patienten har antikroppar, kommer patientens antikroppar ha bundit till antigenena och dÀrmed kommer provet att fÀrgas. Om patientens antikroppar inte binder, kommer vi inte fÄ nÄgot fÀrgÀmne, vilket tyder pÄ att patienten inte har antikropparna och har dÀrmed inte HIV.
+b) antikroppar
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2025-02-01
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Redogör för begreppet entalpi. Vilka termer/aspekter ingÄr och hur kan man anvÀnda entalpiförÀndringar för att förutse benÀgenheten för en viss biokemisk reaktion att ske? (4p)
";"Elev 1 - 2 av 4 poÀng
+Entalpi Àr skillnaden mellan produkternas och reaktanternas energi i en reaktion. Om entalpivÀrdet Àr positivt, innebÀr det att reaktionen kommer krÀva energitillförsel, dÄ produkterna kommer ha högre energi Àn reaktanterna. Om entalpivÀrdet Àr negativt innebÀr det att reaktionen kan ske spontant dÄ det frigörs energi och det Àr dÀrmed fördelaktig.
+Elev 2 - 2 av 4 poÀng
+Entalpi Àr vÀrme energi, betecknas H. En reaktion mellan x och y, dÀr y har högre entalpi Àn x Àr ofördelaktig eller har positiv deltaG för man gÄr frÄn att ha lite energi till att ha mer, vilket innebÀr att energiförÀndringen (E2-E1) Àr negativ --> alltsÄ behöver energi tillföras för att reaktionen ska ske. Om reaktionen skulle vara spontant istÀllet sÄ behöver entalpin hos y vara lÀgre Àn X --> deltaG < 0. H = S - T x deltaG
+AI-rÀttning:
+- Den riktiga definitionen: H = U + pV.
+- ÎH = vĂ€rmeutbyte vid konstant tryck.
+- ÎH ensamt rĂ€cker inte för spontanitet â mĂ„ste kopplas till ÎG = ÎH â TÎS.
+- Entropi och temperatur som avgörande delar av bedömningen.
+- Biokemisk kontext: bindningsstyrka, vĂ€rmeutbyte, och hur ÎH vĂ€gs mot ÎS för att avgöra om en reaktion gĂ„r Ă„t rĂ€tt hĂ„ll.
kategory: termodynamik
prov: 2025-02-01
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om vÀtebindningar Àr korrekta? (2p)
+B och D
+ +kategory: kemiska-bindingar
prov: 2025-02-01
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kemiska-bindingar" +"Fördelen med att mÀta den initiala hastigheten V i början av en reaktion Àr att (vÀlj tvÄ av nedanstÄende): (2p)
+A och B
+ +kategory: enzymer
prov: 2025-02-01
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till ureacykeln Àr korrekta? (2p)
+B och C
+OBS: Fel i facit, förelÀsaren bekrÀftat att B och C Àr rÀtt
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2025-02-01
frÄga: 29
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"A) Name two allosteric regulators of oxygen binding to hemoglobin.
+B) Explain an outcome for each regulator.
+(Max 100 words.) Please answer this question in English. (4p)
a) Oâ and COâ
+b)
+Oâ:
+Hemoglobin has four subunits that bind to Oâ through cooperativity, meaning that if one subunit binds to an Oâ, the other subunits' affinity for Oâ will increase, leading to all subunits binding to Oâ. When Oâ binds, the state goes from T-state (deoxy; tense) to R-state (oxy; relaxed).
COâ:
+When COâ binds to hemoglobin, the hemoglobin's affinity to oxygen decreases, leading to a stabilization of the T-state instead.
kategory: hemoglobin
prov: 2025-02-01
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"![[Pasted image 20251129235913.png]]
+Proteinet pÄ bilden utför transport.
+A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet?
+B) Var i cellen finns proteinet?
+C) Vad driver transporten?
+(4p) Max 40 ord.
A) ATPaser, specifikt ABCaset. Exempel pÄ aktiv transport. +B) Ligger pÄ cellmembranet, transporterar substrat frÄn cytoplasman till ECM. +C) ATP hydrolys --> fosfoanhydridbindningar bryts --> energi frigörs, det sker konformationsÀndringar som vÀxlar mellan att proteinet öppnar mot cytoplasman respektive ECM. Ord: 40 TotalpoÀng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2025-02-01
frÄga: 16
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden stÀmmer för glykolysen? (2p)
+B och C
+ +kategory: glykolysen
prov: 2025-02-01
frÄga: 22
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"NÀmn tvÄ metabola vÀgar som Àr integrerade med pentosfosfatvÀgen eftersom de sker i samma del av cellen och har gemensamma intermediÀrer. (2p) Max 10 ord.
";"Glykolysen och glukoneogenesen
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2025-02-01
frÄga: 32
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Beskriv hur acetyl-CoA karboxylas regleras. (4p)
";"Elev 1 - 1 av 4
+Insulin stimulerar enzymet medan glukagon hÀmmar.
+Enzymet Àr aktivt i dess defosforylerade form, och insulin stimulerar defosforylering.
+Acetyl-CoA-karboxylas fosforyleras nÀr glukagon Àr dominerande, och dÀrmed hÀmmas enzymet av glukagon.
+Feedforwardreglering av pyruvat dÀr höga mÀngder pyruvat hÀmmar och lÄga mÀngder stimulerar.
+Elev 2 - 1 av 4
+Acetyl-CoA karboxylas stimuleras av insulin och hÀmmas av glukagon. Den regleras Àven av energikvoten dÀr ATP stimulerar och ADP/AMP hÀmmar.
+AI-rÀttning
+- Citrat aktiverar (allosteriskt + polymerisering)
+- Palmitoyl-CoA hÀmmar (feedback + depolymerisering)
+- AMPK fosforylerar och inaktiverar â energikontroll
+- PolymeriseringstillstÄndet styr enzymets aktivitet
+- (Insulin/glukagon ska nÀmnas, men rÀcker inte ens nÀra för 4p)
kategory: lipider
prov: 2025-02-01
frÄga: 26
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om RNA-splicing Àr korrekta? (2p)
+A och D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2025-02-01
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Rangordna nedanstÄende komponenter i andningskedjan frÄn lÀgst till högst redoxpotential. (2p)
+Börja med lÀgst redoxpotential:
+kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2025-02-01
frÄga: 27
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Lac-operonet reglerar nedbrytningen av laktos i bakterier. Vilken roll spelar allolaktos vid lac-operonet, och hur pÄverkar detta transkriptionen av generna som Àr inblandade i laktosmetabolismen? (4p)
";"Allolaktos Àr en korepressor som binder till repressorn pÄ lac-operonet vid nÀrvaro av laktos. NÀr allolaktos binder, kommer repressorn att flyttas och dÀrmed kommer gener som kodar för enzymer som bryter ner laktos att kunna transkriberas.
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2025-02-01
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Perifera membranproteiner kan vara bundna till cellmembranet pÄ flera olika sÀtt. Beskriv tre olika varianter. (4p)
";"kategory: cellmembran
prov: 2025-02-01
frÄga: 17
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Redogör för hur glukosmetabolismen regleras pÄ hormonell nivÄ. (4p) Max 150 ord.
";"Elev 1 - 3 av 4 poÀng
+Glukagon aktiverar glukoneogenesen, det vill sÀga Äterbildning av glukos. Detta dÄ glukagon aktiverar cAMP som fosforylerar PKA. PKA, i sin tur, fosforylerar Fosfofruktokinas 2 (PFK2) /fruktos-2,6-bisfosfatas (FBPase-2). Vid fosforylering kommer PFK2-delen att hÀmmas, samtidigt som FBPase-2-delen aktiveras. NÀr FBPase-2 Àr aktivt, kommer fruktos-2,6-bisfosfat att brytas ner. DÄ fruktos-2,6-bisfosfat Àr en allosterisk regluator som aktiverar fosfofruktokinas 1 i glykolysen, kommer glykolysen att hÀmmas dÄ f-2,6-bp kommer att brytas ned.
+Om insulin Àr dominerande, kommer det dÀremot signalera defosforylering som medför att PFK2 blir aktivt och bilda fruktos-2,6-bisfosfat som kan stimulera glykolysen.
+(Sen tror jag ocksÄ att Àven glukokinas i levern regleras hormonellt dÀr insulin aktiverar och glukagon hÀmmar)
+Elev 2 - 3 av 4 poÀng
+Insulin: FrisÀtts nÀr glukos nivÄer i blodet höjs. Insulin stimulerar enzymer i glykolysen, mycket glukos --> den behöver metaboliseras och anvÀndas till ATP produktion. Insulin hÀmmar enzymer i glukoneogenesen sÄsom fruktos-1,6-bisfosfatas. Den gör detta genom att aktivera PKA som i sin tur aktiverar fosfofruktokinas-2, enzym som fosforylerar fruktos-6-fosfat för att omvandlas till fruktos-2,6-bisfosfat. Fruktos-2,6-bisfosfat stimulerar glykolysen och hÀmmar glukoneogenesen, som jag nÀmnt innan sÄ inhiberar den fruktos- 1,6-fosfatas. Fosfofruktokinas-1 stimuleras av insulin för att omvandla fruktos-6-fosfat till fruktos-1,6-bisfosfat. Glukagon: FrisÀtts nÀr glukos nivÄer i blodet Àr lÄga. Den har motsatt effekt till insulin, den stimulerar glukoneogenesen och hÀmmar glykolysen. Glukagon verkar mest pÄ levern och stimulerar enzymer i som pyruvatkarboxykinasdehydrogenas som Àr en del av glukoneogenesen. Adrenalin verkar likt glukagon men mer pÄ skelettmuskulatur. All hormonell reglering sker genom att hormonet binder till 7TM receptorer pÄ cellmembranet --> ATP--> cAMP --> aktivt/inaktivt PKA beroende pÄ om enzymet behöver fosforyleras eller defosforyleras.
+AI-rÀttning:
+- Att insulin/glukagon reglerar bÄde glykolys, glukoneogenes och glykogenmetabolism.
+- Att insulin verkar via defosforylering och glukagon via fosforylering â kopplat till flera enzym, inte bara PFK-2.
+- Att adrenalin har en tydlig roll i muskel.
kategory: glykolysen
prov: 2025-02-01
frÄga: 23
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Beskriv tvÄ huvudsakliga och principiellt olika sÀtt, pÄ vilka cellen reglerar mÀngden fritt intracellulÀrt kolesterol. (4p)
";"kategory: kolesterol
prov: 2025-02-01
frÄga: 33
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Hur skiljer sig glykogenets huvudsakliga funktion i levern frÄn dess funktion i skelettmuskulaturen? Vilket enzym Àr avgörande för denna skillnad och i vilken av vÀvnaderna uttrycks det? (4p) Max 50 ord.
";"Glykogen i levern anvÀnds för att upprÀtthÄlla stabilt blodsocker. Glykogen i muskler anvÀnds till ATP eftersom den saknar glukos-6-fosfatas. Glukos bryts som glukos-1-fosfat frÄn glykogen och omvandlas sedan till glukos-6-fosfat(fosfoglukomutas). I levern finns enzymet glukos-6-fosfatas som omvandlar glukos-6-fosfat till glukos men i skelettmuskler metaboliseras glukos-6-fosfat vidare i glykolysen för ATP-produktion.
+ +kategory: glykogen
prov: 2025-02-01
frÄga: 24
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om kromatin Àr korrekta? (2p)
+A och D
+ +kategory: kromatin
prov: 2025-02-01
frÄga: 10
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om eukaryot DNA-replikation Àr korrekta? (2p)
+A och C
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2025-02-01
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Du arbetar som lÀkare och följer upp hemoglobin (Hb) hos 200 patienter behandlade för jÀrnbrist. Hb följer en normalfördelning med medelvÀrde 130 g/L och standardavvikelse 10 g/L.
+Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden Àr korrekta? (2p)
A och B
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2025-02-01
frÄga: 34
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Aminoacyl-tRNA synthetases have an activation site and an editing site. Account for their function in translation. (4p) Please answer this question in English.
";"The activation site is where the binding of an aminoacid to the 3Žamino acid pocket in tRNA happens. The enzym catalyzes the reaction between these two to create an ""esterbindning"" between the CCA in tRNA's amino acid seat/pocket to the C in the aminoacid. More specfically, it is adenine that directly binds to the tRNA. The aminoacyl-tRNA is then moved to the editing site where it gets checked that the right aminoacid has bound to the tRNA to see if its anticodons are compatible with the mRNAs codons. Ord: 88 TotalpoÀng: 4 LPG001 Biokemi med skannat papper - Omtentamen
+ +kategory: translation
prov: 2025-02-01
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Enzymer har ofta en katalytisk klyfta dÀr den katalyserade reaktionen sker. Redogör för tvÄ olika kemiska fördelar med detta. (4p)
";"kategory: enzymer
prov: 2025-02-01
frÄga: 20
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till aminosyrametabolism Àr korrekta? (2p)
+B och D
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2025-02-01
frÄga: 30
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Redogör för de tvÄ viktigaste principerna som förklarar hur nya egenskaper kan utvecklas i ett evolutionÀrt sammanhang samt hur de tvÄ principerna Àr beroende av varandra. (4p)
";"De tvÄ viktigaste principerna Àr variation och naturligt urval.
+I en population förekommer en genetisk variation mellan individerna. Den genetiska variationen beror pÄ mutationer bland annat. Alla individer har inte samma egenskaper och Àr dÀrför olika anpassade efter miljön som dessa lever i. De individer som Àr bÀst anpassade till miljön kommer ha en större chans att utnyttja resurserna och kunna överleva samt föröka sig och föra vidare sina gynnsamma gener. Detta i sin tur Àr kallat naturligt urval dÀr miljön ""selekterar"" de bÀst anpassade.
+Exempel pÄ det Àr hur giraffens lÄnga hals kan ha uppstÄtt. I en giraffpopulation förekom en genetisk variation med giraffer som hade bÄde korta och lÄnga halser. I en miljö med korta trÀd kunde bÄda nyttjas, men i samband med att trÀden blev allt högre, kunde de som hade lÄngt hals nÄ upp och utnyttja det. Dessa blev de bÀst anpassade och dÀrmed överförde vidare de gynnsamma generna, medan de som hade kort hals kunde inte utnyttja resurserna pÄ samma sÀtt i just den specifika miljön.
kategory: evolution
prov: 2025-02-01
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende molekyler innehÄller delar frÄn en B-vitamin? (2p)
+C och D
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2025-02-01
frÄga: 21
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Namnge en nukleosid och ange i vilken molekyl merparten av nukleosidens kvÀveatomer hamnar nÀr den bryts ned. Molekylen utsöndras slutligen med urinen. (2p) Max 10 ord.
";"Adenosin. Hamnar i Urat
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2025-02-01
frÄga: 31
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"I citronsyracykeln deltar fyra dehydrogenaser.
+A) Vad gör ett dehydrogenas?
+B) Vilka tvÄ av de fyra dehydrogenaserna utför ocksÄ en annan gemensam reaktion?
+C) Vilken Àr den andra gemensamma reaktionen?
+(4p) Max 30 ord.
a) Tar bort vÀte
+b) Isocitratdehydrogenas och alfa-ketoglutaratdehydrogenas
+c) Dekarboxylering; frigör COâ
kategory: citronsyracykeln
prov: 2025-02-01
frÄga: 25
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Telomeras Àr ett enzym som spelar en viktig roll i bevarandet av kromosomernas integritet under DNA-replikation. Vad gör telomeras, och varför Àr det viktigt för celler som delar sig ofta, som stamceller och könsceller? (4p)
";"Vid replikation av DNA har vi en ledande strÀng som syntetiseras kontinuerligt, och en lagging strÀng som syntetiseras i olika fragment kallade Okazakifragment. DÄ replikationen sker i 5'- till 3'-riktning, mÄste Okazakifragmenten ha olika RNA-primers som de startar vid. Just hÀr uppstÄr ett problem, dÄ vi inte kan lÀgga till primers pÄ Àndarna, sÄ lagging strand kommer inte kunna syntetisera dÀr. I normala fall leder detta till att DNA förkortas efter varje replikation. Men i celler som stamceller och cancerceller kommer telomeraset att ha med sig en egen RNA-mall och utför omvÀnd transkriptas, det vill sÀga att göra RNA till DNA. SÄ telomeraset kommer att förlÀnga Àndarna med en repeterande sekvens. Det som hÀnder dÄ Àr att vid nÀsta replikation kommer DNA att förkortas vid de sekvenserna som lades till av telomeraset, men ingen viktig information kommer att tas bort. Detta utnyttjas av stamceller och cancerceller för att cellerna ska kunna dela sig utan att dö eller tappa viktiga gener.
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2025-02-01
frÄga: 11
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Nukleotider Àr de byggstenar som bygger upp bÄde DNA och RNA. Vilken kemisk grupp finns i 2'-position hos ribonukleotider, och hur skiljer sig denna frÄn deoxyribonukleotider? (4p)
";"Hos ribonukleotider finns en OH-grupp i 2Žpositioinen medan det i DNA finns H. Detta beror pÄ att enzymet ribonukleotidreduktas ersÀtter OH gruppen i RNA med H för att omvandla ribos till deoxyribos. RNA: Ribos har OH pÄ kol nr 2. DNA: Deoxyribos har H pÄ kol nr 2.
+ +kategory: nukleotider
prov: 2025-02-01
frÄga: 8
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Explain how gel electrophoresis can be used to analyze different conformations of plasmid DNA. Discuss how the migration patterns of these conformations differ and how comparing them with the ladder (marker) helps interpreting the gel results and understand the structure of the plasmid DNA. (4p) Max 150 words. Answer in English.
";"The electrophoresis has two differently charged ends, one positive and one negative. The plasmids get injected into the gel electrophoresis in a well from the negatively charged end. When we then give it a current, the plasmids will travel to the positive end (because DNA is negative). The bigger the plasmid is, the further it will travel, because it has more negative charges than a small one. Supercoiled and circular DNA will meet different amount of friction, since they have different forms, which will result in one traveling further than the other even though they have the same size.
+The marker will help identify how many base pairs the plasmid have. But if we analyze two of the same plasmids and they travel different distances, then it means that they have different conformations where one is supercoiled and the other is circular. The circular meets more friction.
kategory: plasmid
prov: 2025-02-01
frÄga: 35
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Ange tvÄ likheter och tvÄ skillnader mellan en alfahelix och en hÄrnÄlsböj (reverse turn). (4p)
+Max 50 ord.
Alfahelixar har vÀtebindningar mellan var fjÀrde aminosyra, medan hÄrnÄlsböj har mellan var tredje.
+BÄda Àr en typ av primÀrstruktur.
+Alfahelixar Àr ofta högervridna.
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2025-02-01
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Glukos lagras hos mÀnniskan i form av glykogen. Hos vÀxter lagras glukos som stÀrkelse. Beskriv skillnader och likheter mellan glykogen och stÀrkelse. (4p)
";"Elev 1 - 3 av 4 poÀng: +BÄda Àr lÄnga kedjor av kolhydrater. Skillnaden Àr dock att glykogen bestÄr av förgrenade kedjor dÀr vi har 1,4-glykosidbindningar mellan linjÀra delar, och 1,6-glykosidbindningar mellan förgreningar. StÀrkelse Àr en enda linjÀr kedja som inte förgrenas.
+Elev 2 - 3 av 4 poÀng +StÀrkelse i vÀxter bildas av fotosyntes, utav koldioxid och vatten dÀr solenergin utnyttjas för att skapa bindningar mellan dessa molekyler, dÄ fÄr vi bl.a glukos. Det glukos som tillverkas i vÀxter av fotosyntes Àr samma glukos vi Àter och bryter dess bindningar för energi. Att glukos lagras som glykogen hos oss Àr för att glukos Àr för osmotiskt aktiv för att lagras som den Àr. Men stÀrkelse lagras inte för vÀxternas skull, utan det Àr ett sÀtt att omvandla koldioxid som vi andas ut till syrgas, annars skulle syrgas i atmosfÀren ha tagit slut.
+AI-rÀttning: +Kort sammanfattning av vad som typiskt ger full poÀng: +- Likhet: bÄda bestÄr av α-D-glukos. +- Likhet: bÄda anvÀnder α-1,4- och α-1,6-bindningar. +- Skillnad: stÀrkelse = amylose (linjÀr) + amylopektin (lÀtt förgrenad). +- Skillnad: glykogen = mycket mer förgrenat.
+ +kategory: glykogen
prov: 2025-02-01
frÄga: 7
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Du gör forskar-ST inom infektionsmedicin och studerar hur Helicobacter pylori binder till glykolipider. Du ritar upp en glykolipid i cellmembranet och markerar hur den del som sitter pÄ utsidan Àr den bakterierna binder till. Principiell struktur rÀcker. (4p)
";".
+Ritning: PĂ„ ritningen (sida 11) visas ett cellmembran med glykolipider: hydrofila huvuden utĂ„t, hydofoba fettsyrasvansar i membranet och en kolhydrat kopplad via glycerol (kommentar: âkan ocksĂ„ vara sfingosinâ).
+LÀrarens kommentar: Det absolut vanligaste Àr att glykolipider har sfingosin som bas och inte glycerol, och nÀr man sÀger glykolipid utan att specificera mer sÄ menar man nÀstan alltid de med sfingosin som bas.
+Ord (textsvar): 1
+ +kategory: cellmembran
prov: 2025-02-01
frÄga: 6
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄende stÀmmer för proteinveckning? (2p)
+A och C
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2025-02-01
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vad fÄr det för konsekvens nÀr NADH som bildats i glykolysen transporteras till mitokondriens +matrix med glycerol 3-fosfatshunten istÀllet för med malat-aspartatshunten? +(2p) (Max 30 ord)
";"0 poÀng:
+Konsekvensen blir att vi kommer behöva förbruka en atp för att glycerol 3
+fosfat ska kunna bildas. Det krÀver mer energi
+AI-svar:
+NĂ€r elektroner frĂ„n cytosoliskt NADH gĂ„r via glycerol-3-fosfatshunten i stĂ€llet för malatâaspartatshunten blir konsekvensen:
â FĂ€rre ATP per NADH.
+Glycerol-3-fosfatshunten överför elektroner till FAD i mitokondriens inre membran â FADHâ â komplex II â ger ~1,5 ATP.
+Malatâaspartatshunten överför elektroner direkt till mitokondriellt NADâș â NADH â komplex I â ger ~2,5 ATP.
+Konsekvens: lÀgre ATP-utbyte frÄn glykolysen nÀr glycerol-3-fosfatshunten anvÀnds.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-08-01
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Du Àr lÀkare och handleder en lÀkarstudent som Àr stressad över sin biokemitenta.
+LÀkarstudenten kommer inte ihÄg membranlipiderna sÄ bra och undrar om du kan hjÀlpa till att
+förklara, vilket du gör genom att:
+A) Rita den principiella strukturen för den vanligaste membranlipiden.
+B) Markera i bilden som du har ritat den del som Àr polÀr, samt den del som Àr hydrofob.
+(4p)
![[Pasted image 20251129235536.png]]
";"Svar pÄ ritpapper: fosfolipid med alkohol + fosfat (polÀr del) kopplad till +glycerol och tvÄ fettsyrasvansar (hydrofob del).
+ +kategory: cellmembran
prov: 2024-08-01
frÄga: 5
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Kemiska reaktioner i vÀtskor och gaser sker snabbare nÀr temperaturen höjs. Hur kan det +förklaras? (4p) (Max 150 ord.)
";"Det gÄr snabbare dÀrför att en ökning i vÀrmeenergi kommer omvandlas till en +ökning i rörelseenergin (termodynamikens första lag, energi kan inte skapas +eller förstöras men det kan omvandlas). NÀr vi höjer rörelseenergi kommer +detta innebÀra att varje partikel befinner sig pÄ en högre energinivÄ Àn vad den +var innan. Detta ökar bÄde chansen för att tvÄ partiklar med rÀtt konformation +krockar med varandra, men ocksÄ att de krockar med varandra med tillrÀckligt +mycket energi för att kunna nÄ övergÄngstillstÄndet och sÄledes reagera.
+ +kategory: termodynamik
prov: 2024-08-01
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"I glykolysens första steg binder glukos till en klyfta i enzymet som utför reaktionen frÄn vilken +vatten stÀngs ute. Förklara vilka egenskaper de aminosyror behöver ha som binder till glukos och +nÀmn tvÄ aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 60 ord.)
";"Glukos Àr en vattenlöslig molekyl - den Àr polÀr. De som binder till glukos +behöver dÄ ocksÄ vara polÀra och vattenlösliga. tvÄ aminosyror som har dessa +egenskaper Àr serin och treonin. Det som utmÀrker dessa Àr att de Àr alkoholer - +sÄ de binder gÀrna till glukos via sina OH-grupper.
+ +kategory: kolhydrater
prov: 2024-08-01
frÄga: 1
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"Enzymet A som omvandlar S till P har ett Km pÄ 10 ”M och ett Vmax pÄ 100 nmol/s. +Enzymet B som omvandlar S till Q har ett Km pÄ 1 mM och ett Vmax pÄ 200 nmol/s. +Lika mÀngder av A och B blandas med 100 ”M S i ett och samma kÀrl. +Vad kommer man att ha mest av nÀr reaktionerna Àr klara - P eller Q? Motivera ditt svar. +(4p) (Max 150 ord.)
";"1 av 4: +Km = ([E]+[S])/[ES] och Vmax = K + Etot k2=turnover number +Med hjÀlp av formlerna ovan har jag kunnat dra slutsatsen att Enzym A har +bÄde en mindre kapacitet för att forma enzym-substrat komplex och har Àven +en lÀgre turnover number Àn vad Enzym B har. Denna slutsats drar jag dÄ +enzym A har ett större Km vÀrde Àn vad Enzym B har, vilket innebÀr att [ES] Àr +mindre hos Enzym A Àn Enzym B enligt michealis mentes kinetiken. Enzym A +har alltsÄ lÀgre affinitet för sitt substrat Àn Enzym B +Vmax Àr ocksÄ lÀgre hos enzymA Àn vad den Àr hos enxym B, detta beror pÄ +turnover number som Àr det vÀrde som talar om hur bra ett enzym bildar +produkt. Enzym A mÄste ha ett lÀgre turnover-number Àn enzym B dÄ dess +Vmax Àr lÀgre. +Enzym B har alltsÄ bÄde större [ES] och bildar produkt bÀttre(K )->Q kommer +bildas.
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-08-01
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende komponenter deltar i elektrontransportkedjan? (2p)
+A och D
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-08-01
frÄga: 29
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Du jobbar pÄ labb över sommaren och du har fÄtt i uppgift att utföra en ELISA för att undersöka
+om en patient har HIV. Beskriv vilken typ av ELISA som skall utföras, vilka steg som utförs och
+ange vilken substans hos patienten som undersöks med metoden.
+(4p). (Max 200 ord.)
För att undersöka om en patient har HIV sÄ vill man kolla ifall den har
+antikroppar för det. DÄ anvÀnder man sig av indirekt ELIZA samt ett prov
+innehÄllande patientens plasma-komponenter - dÄ det Àr dÀr antikropparna
+finns.
+Vid indirekt ELIZA kommer det i en behÄllare finnas antigener bundna till
+botten, dessa ska ha en epitop som HIV-antikroppen kÀnner igen. Man kommer
+tillsÀtta ett prov innehÄllande patientens plasma-komponenter till behÄllaren.
+HIV-antikropparna kommer binda till antigenerna och sedan kommer provet att
+sköljas.
+efter sköjlning kommer man tillsÀtta en substans innehÄllande enzymlÀnkade
+antikroppar som kommer binda till HIV-antikropparna. Efter dessa har fÄtt tid
+att binda sköljer man provet en gÄng till. sedan sÄ tillsÀtter man en annan
+substans som innehÄller ett substrat som enzymerna binder. Detta substrat
+kommer orsaka ett fÀrgskifte om det finns HIV-antikroppar i provet, om det inte
+finns hiv-antikroppar blir det inget fÀrgskifte och man vet att patienten inte har
+HIV.
+det Àr viktigt att man sköljer ordentligt mellan stegen, annars kan det uppstÄ en
+falsk positiv, detta dÄ antikropparna ju skulle finnas kvar i provet, som dÄ de
+enzymbundna antikropparna kan binda till, som dÄ kommer ge fÀrgskifte vid
+tillsatts av substrat.
kategory: utforska-proteiner
prov: 2024-08-01
frÄga: 4
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende proteiner utför aktiv transport?
+(2p)
";"B och C
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-08-01
frÄga: 16
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"A) Förklara vad som menas med feedbackreglering.
+B) Ge ett exempel pÄ ett enzym i glykolysen som regleras med feedbackreglering och ange vad
+det Àr som ger feedbackregleringen. (4p) (50 ord)
A) Feedback reglering Àr att en produkt som bildas kommer reglera aktiviteten
+hos ett enzym som katalyserar en reaktion som sker innan den reglerande
+produkten har bildats.
+B) Hexokinas katalyserar reaktionen Glukos + ATP -> glukos-6-fosfat + ADP,
+den feedbackinhiberas av sin egen produkt, glukos-6-fosfat.
kategory: glykolysen
prov: 2024-08-01
frÄga: 22
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till pentosfosfatvÀgen Àr korrekta? (2p)
+A och C
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2024-08-01
frÄga: 32
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Kan citronsyracykeln gÄ Ät vilket hÄll som helst? Motivera svaret. (4p) (Max 75 ord)
";"Jag förstÄr inte helt frÄgan som stÀlls, CSC kan inte gÄ bakÄt i cykeln dÄ vi har +tvÄ reglerande steg dÄ koldioxid avges. Isocitratdehdyrogenas och +alfaketoglutaratdehydrogenas Àr reglerade dels av sina produkter men Àven av +energikvoten, dessa kan inte gÄ bakÄt hur som helst. +DÄ det Àr en cykel kan vi dock Äterbilda en produkt genom att lÄta cykeln fortgÄ +efter oxalacetat har bildats tills vi fÄr den produkten som vi ville Äterbilda.
+ +kategory: citronsyracykeln
prov: 2024-08-01
frÄga: 26
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Vid prokaryot transkription spelar sigma-faktorn en avgörande roll. Vilka tvÄ pÄstÄenden om +sigma-faktorn stÀmmer? (2p)
+B och C
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2024-08-01
frÄga: 12
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Para ihop nedanstÄende metaboliter med en metabol vÀg dÀr de ingÄr. Varje metabolit fÄr enbart +anvÀndas en gÄng. (2p)
+Metaboliter / vÀgar:
+laktatdehydrogenas
+citronsyracykeln
+kategory: glukoneogenes
prov: 2024-08-01
frÄga: 27
";"glukoneogenes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glukoneogenes" +"Hur sker matchningen mellan den kodande sekvensen pÄ mRNA och antikodonsekvensen pÄ +tRNA? Beskriv var i ribosomer som denna matchning sker under translationen. (4p) (Max 150 +ord.)
";"3 av 4:
+Ribosomen bestÄr av en liten subenhet - 30S och en stor subenhetet 50S. den
+stora subenheten kommer sköta matchningen av kodon till antikodon och den
+lilla kommer hÄlla i mRNA strÀngen. Matchningen mellan den kodande
+sekvensen pÄ mRNA och antikodonssekvensen pÄ tRNA sker pÄ Aminoadenyl
+siten (A-site) i ribosomen.
+En aminosyra-laddad tRNA kommer att vandra in i A-siten pÄ en riboosom.
+DÀr kommer antikodonerna matchas med kodonerna och vÀtebindingar
+kommer bildas mellan dem. Om dessa har matchat rÀtt kommer elongation
+factors göra att tRNA slÀpper ifrÄn och fortsÀtter till peptidyl-site och sedan ut
+via exit-site i ribosomen.
kategory: translation
prov: 2024-08-01
frÄga: 13
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Rangordna molekylerna etanol, fruktos, leucin och koldioxid efter deras förmÄga att passera +cellens plasmamembran. Starta med den som har lÀttast att passera. (2p)
+LĂ€ttast â SvĂ„rast:
+kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-08-01
frÄga: 17
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden stÀmmer för glukoneogenes? (2p)
+B och C
+ +kategory: glukoneogenes
prov: 2024-08-01
frÄga: 23
";"glukoneogenes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glukoneogenes" +"Beskriv kortfattat vad det enterohepatiska kretsloppet Àr och förklara dess koppling till kolesterolsyntes. (4p)
";"2 av 4:
+Nedbruten kolesterol kommer att utsöndras med gallsyror, dÀrför Àr det viktigt
+att vi har gallsyror sÄ att vi inte fÄr en ackumulering av kolesterol.
+Enterohepatiska kretsloppet Àr att vi har en 95-procentig reabsorption av
+gallsyror i hepatocyterna - vilket gör att vi stÀndigt har galla.
+AI:
+Det enterohepatiska kretsloppet innebÀr att gallsyror som bildats frÄn kolesterol i levern utsöndras till tarmen och dÀrefter till största delen Äterabsorberas i ileum och förs tillbaka till levern via portavenen. Detta sparar kolesterol, eftersom fÀrre nya gallsyror behöver syntetiseras. Om Ätercirkulationen minskar mÄste levern istÀllet öka sin kolesterolsyntes och uppreglera LDL-receptorer för att fÄ mer kolesterol till ny gallsyrabildning.
kategory: kolesterol
prov: 2024-08-01
frÄga: 33
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"A) Under vilka omstÀndigheter sker bildning av ketonkroppar och varför sker detta?
+B) Vilka Àr de tre ketonkropparna som bildas?
+(4p)
1 av 4:
+a) bildningen av ketonkroppar sker vid svÀlt. Vid svÀlt kommer
+glukosreserverna att ha brutits ned och vi kommer gÄ över till att bryta ner vÄra
+fettreserver. DÄ kommer det bildas ketonkroppar och detta Àr ffa för att förse
+hjÀrnan med energi, dÄ den inte lÀngre kan fÄ det frÄn glukos.
+b) acyl-CoA, acetoacyl-CoA och aceton.
kategory: betaoxidation
prov: 2024-08-01
frÄga: 24
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer om RNA processning? (2p)
+A och B
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2024-08-01
frÄga: 10
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"A) Vad Àr skillnaden mellan exo- och endonukleaser?
+B) Skriv det fullstÀndiga namnet för CMP.
+(4p)
a) exonukleaser kommer att bryta fosfodiesterbindingar pÄ Ànden av en DNA-
+kedja medan endonukelaser kommer bryta en fosfodiesterbindning nÄgonstans
+i mitten av DNA-kedjan.
+b) cytidinmonofosfat.
kategory: dna-replikation
prov: 2024-08-01
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vilka tvÄ faropiktogram visas i bild nedan?
+![[Pasted image 20251129235602.png]]
+(2p)
";"A & C
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2024-08-01
frÄga: 34
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Beskriv kortfattat hur den första eukaryota cellen bildades. (4p) (Max 150 ord.)
";"Den första eukaryota cellen bildades tack vare endosymbios. Med endosymbios
+menas att tvÄ bakterier har gÄtt ihop och har haft ett utbyte mellan varandra
+som gynnar bÄda. Detta sker genom att en mindre bakterie vandrar in i en
+större bakterie med en egenskap som gynnar överlevnaden hos bÄde sig sjÀlv
+och den större bakterien. Tillslut kommer den större bakterien att ta över vissa
+processer som den lilla gör genom att den lilla bakteriens DNA överförs till den
+större bakterien - pÄ sÄ sÀtt fÄr vi en cell med flera organeller.
+Exempel: mitokondrien
+mitokondrien - som var en aerob bakterie, vandrade en gÄng in i en anaerob,
+större cell. den gav energi i form av ATP och den större anaeroba cellen gav den
+nÀring. tillslut överfördes DNA frÄn den aeroba bakterien till den anaeroba
+cellen - pÄ sÄ sÀtt kunde cellen börja styra vissa processer och vi fick en
+cellandande cell.
kategory: evolution
prov: 2024-08-01
frÄga: 14
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden om enzymer Àr korrekta? (2p)
+B och C
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-08-01
frÄga: 20
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Alanin kan bildas i en sÄ kallad transamineringsreaktion med hjÀlp av ett kliniskt viktigt enzym. +Ange det fullstÀndiga namnet pÄ enzymet, samt beskriv reaktionen som enzymet katalyserar +med en reaktionsformel. (4p) (Max 20 ord.)
";"3 av 4:
+Alanin-aminotransferas
+pyruvat + glutamat -> alanin + alfa-ketoglutarat
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2024-08-01
frÄga: 30
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Ange tvÄ typer av celladhesionsmolekyler och beskriv kortfattat deras funktion. (4p)
";"integriner - förankrar cellen med ECM. Detta gör de genom att binda till
+cytoskelettet som aktinfilament och sedan binda till ECM komponenter sÄsom
+fibrinogen samt kollagen.
+cadheriner - finns i desmosomer och adherensjunctions, de förankrar cellerna i
+varandra. Detta gör de genom att binda till andra cedheriner med homophilic
+bindings samt till cytoskelletet, pÄ sÄ sÀtt binder de ihop cellerna.
kategory: cellmembran
prov: 2024-08-01
frÄga: 15
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Ange vad som anvÀnds som cellens energivaluta och förklara vad som gör molekylen lÀmplig för +ÀndamÄlet. (4p) (Max 100 ord).
";"Det som anvÀnds som cellens energivaluta Àr ATP. +Det som gör ATP lÀmplig Àr att den innehÄller tre stycken fosfatgrupper som +binder till varandra med fosfoanhybridbindniningar. Fosfoanhybridbindingen +Àr instabil och krÀver energi för att hÄllas ihop dÄ det Àr en repulsion mellan +fosfatgrupperna. DÄ en fosfat spjÀlkas av sÄ kommer det att frisÀttas energi +genom att repulsionen minskar, dessutom uppstÄr resonans mellan de tvÄ +övriga fosfatgrupperna som gör dem stabilare - mer energi avges. Energin som +avges kan dÄ gÄ till andra energikrÀvadne processer ex. bilda gradienter och +makromolekyler.
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2024-08-01
frÄga: 21
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till nukleotidnedbrytning Àr korrekta? (2p)
+B och D
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2024-08-01
frÄga: 31
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"För att initiera bildningen av en helt ny glykogenpartikel, det vill sÀga börja bilda en +glykogenpartikel ""frÄn början"", sÄ behövs en sÄ kallad glykogen-primer, dvs en kort strÀcka linjÀrt +glykogen. Hur bildas denna primer, och varför mÄste strukturen bildas för att glykogenpartikeln +sedan skall kunna byggas upp? (4p) (Max 50 ord.)
";"Glykogenin kommer att autokatalysera bildningen av en glykogenprimer +genom att sÀtta pÄ den aktiva formen av glukos (UDP-glukos) pÄ sin tyrosins +OH-grupp. Sedan forsÀtter den att binda ca. 10-20 glukosenheter innan +glykogensyntas tar över. Glykogensyntas kan bara bilda alfa-1,4-bindningar om +det finns en kedja att koppa dem till.
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-08-01
frÄga: 25
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Var sitter histon H1 och vilken roll spelar denna faktor? (4p)
";"H1 sitter pÄ den yttre regionen av en nukleosom. Dess uppgift Àr att stabilisera +nukleosomen genom att binda till/över DNA:t som Àr virat kring histonbunten +och se till att DNAt förankras med histonerna. Utan H1 hade dnat +frÀmst hÄllts kvar av H3 och H4s positivt laddade N-terminaler som binder till +den negativt laddade DNA strÀngen. Detta hade inneburit att sÄ fort dessa +histoner hade genomgÄtt acetylering eller metylering sÄ hade nukleosomen +varit vÀldigt instabil.
+ +kategory: kromatin
prov: 2024-08-01
frÄga: 11
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om DNA-replikation stÀmmer? (2p)
+(svar angivet i flervalsformulÀr)
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2024-08-01
frÄga: 8
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"A gene of interest was amplified and verified using the blue/white screening method. The plasmids from two bacterial colonies, one blue colony and one white colony, were purified. Then restriction enzyme digestion was performed, and the samples were run on a gel as follows: white uncut, white cut, blue uncut, blue cut (see figure below). After imaging the gel, we can conclude that while there is plasmid DNA in all samples, the white sample was probably mixed with the blue sample. Explain what finding in the gel indicates the white sample was probably mixed with the blue sample by referring to the size/number of bands. Account for the other source of error for this outcome besides pipette tip contamination from sample to sample. (4p) (Max 200 words)
+OBS! This question needs to be answered in English.
![[Pasted image 20251129235633.png]]
";"the findings in the gel that indicate that the samples were mixed are the lines in the white uncut sample. It has two visible bands, with one lining up quite nicely with the blue uncut bands in size. If the plasmid is uncut, than there shouldn't be two distinct bands because the sample only consists of an uncut product. The white uncut should also have a larger amount of base pairs than the blue uncut because we have transformed a gene of interest into it, but they seem to have the same amount.
+a source of error for this outcome could be that the colony picked for the white cut may have been close to a blue colony - causing a small amount of the blue colony to be accidentaly picked.
kategory: plasmid
prov: 2024-08-01
frÄga: 35
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"How does fetal hemoglobin (HbF) differ from adult hemoglobin (HbA) and what effect does this
+have? (4p)
+OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).
3 av 4:
+Adult hemoglobin consists of two beta subunits and two alfa subunits, while fetal
+hemoglobin consists of two alfa subunits and two gamma subunits. HbA has a
+lower affinity for oxygen than HbF.
+Beta subunits allow for the allosteric regulator 2,3-BPG to bind. when 2,3-bpg
+binds it enhances T-state because it becomes a type of blockage for the
+conformational change to R-state, meaning that the affinity for oxygen is
+lowered. 2,3-BPG cannot bind to the gamma subunits - meaning that the affinity
+for oxygen increases.
kategory: hemoglobin
prov: 2024-08-01
frÄga: 3
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln?
+B) Hur ser denna faktor ut?
+(4p)
a) PCNA, eller en sliding clamp, ökar DNA-polymerasets processivitet, den kan
+öka hastigheten med upp till 50x. Den fungerar pÄ det sÀttet att den hÄller i DNA
+strÀngen sÄ att dna-polymeraset lÀtt kan glida fram
+b) Den ser ungefÀr ut som en ring som omringar leading/lagging strand.
kategory: dna-replikation
prov: 2024-08-01
frÄga: 7
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Diskutera kortfattat skillnader och likheter mellan glykoproteiner och glykolipider. (4p)
";"3 av 4:
+glykoproteiner Àr glykosylerade proteiner, dessa bestÄr alltsÄ av ett protein med
+""barr"" av kolhydrater. de kan vara o-lÀnkade, via serin och treonins OH-grupp,
+eller sÄ kan de vara n-lÀnkade via aspargin. Glykoproteiner bygger upp extra-
+cellulÀr-matrix och finns i ledvÀtska, brosk, ögat mm.
+likt glykoproteiner Àr glykolipider glykosylerade, men de bestÄr av sfingosin + en
+fettsyra + en sackarid/flera sackarider. Denna finns i outer leaflet i cellmembran
+och bl.a. bygger upp glykokalyx som Àr pÄ cellen och inte i ECM. Dessa har som
+en ""svans"" med sackarider medan glykoproteiners kolhydrater Àr mer som
+ovannÀmnt, ""barr"" som kan finnas över hela proteinet.
kategory: cellmembran
prov: 2024-08-01
frÄga: 6
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Stamceller behöver skyddas frÄn det Äldrande som drabbar andra celler. En sak som skyddar +dem Àr ökat uttryck av chaperoniner. Förklara hur det kan skydda mot nÄgot som Àr skadligt för +celler. (4p) (Max 60 ord.)
";"chaperoniner - som hsp60 har tvÄ stycken ringstrukturer och en hÄlighet. I +hÄligheten erbjuds en isolerad plats för proteiner att vecka sig genom att +proteinet gÄr in i hÄligheten och ett lock rekryteras - den veckas ""som vanligt"" +oavsett hur miljön utanför. utan detta skulle prioner kunna bildas - vilka kan +infektera andra proteiner att veckas fel, vilket skadar cellen.
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-08-01
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 28
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 5
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 18
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 1
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 19
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 29
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 4
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 16
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 22
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 32
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 26
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 12
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 27
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 13
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 17
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 23
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 33
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 24
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 10
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 9
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 34
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 14
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 20
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 30
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 15
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 21
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 31
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 25
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 11
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 8
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 35
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 3
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 7
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 6
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"";" + +kategory:
prov:
frÄga: 2
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"ALAT Ă€r ett kliniskt mycket viktigt enzym. Beskriv reaktionen enzymet katalyserar samt vad en ökad plasmakoncentration av enzymet vanligen indikerar.
";"ALAT â alaninaminotransferas. Enzymet utför en transaminering â glutamat slĂ„s ihop med pyruvat â aminogruppen frĂ„n glutamat överförs till pyruvat â pyruvat blir dĂ„ alanin och glutamat alfaketoglutarat. ALAT kan Ă€ven genomföra omvĂ€nd reaktion.
+ALAT Àr vanligtvis ett intracellulÀrt enzym, om man uppmÀter en hög koncentration av detta antyder det pÄ att det lÀckt ut ur cellerna. Detta indikerar dÀrav pÄ vÀvnadsskada. ALAT finns i hög utstrÀckning i levern. DÀrför kan man se höga koncentrationer av ALAT i plasma vid mÄnga typer av leversjukdomar t.ex. hepatit.
+ +kategory: aminosyrametabolism
prov: 2021-12-16
frÄga: 28
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"A) Vilken typ av bindning bryter nukleaser?
+B) Skriv det fullstÀndiga namnet för dCMP.
A) Nukleaser bryter bindningar mellan nukleotider â dĂ€rav fosfodiesterbindningar.
+B) dehydroxyriboscytosinmonofosfat (fel)
+ rÀtt: - deoxycytidinmonofosfat
kategory: nukleotider
prov: 2021-12-16
frÄga: 5
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Vid syntes av DNA eller RNA mÄste var och en av de nukleotider som ska adderas till den vÀxande strÀngen ha tre fosfatgrupper pÄ sig. Man fÄr ingen reaktion om det bara sitter en eller tvÄ fosfatgrupper pÄ nukleotiderna. Förklara varför de tre fosfatgrupperna behövs. (Max 150 ord.)
";"Nukleotider kopplas ihop med fosfodiesterbindningar. Bildningen av denna bindning Ă€r termodynamiskt ofördelaktig eftersom att entropin minskar â reaktionen krĂ€ver tillförd energi. Fosfatgrupperna pĂ„ nukleotiden Ă€r kopplade med mycket energirika fosfoanhydridbindningar. NĂ€r dessa hydrolyseras frigörs mycket energi.
+NĂ€r nukleotiden ska binda in kommer dĂ„ tvĂ„ av fosfatgrupperna att slĂ€ppa â först frigörs det energi nĂ€r de bryter frĂ„n det ena fosfatet (som fortfarande sitter pĂ„ nukleotiden) â och sedan Ă€nnu mer energi nĂ€r bindningen bryts mellan de tvĂ„ frigjorda fosfatgrupperna sinsemellan. Med hjĂ€lp av denna energi kan man dĂ„ driva den energikrĂ€vande processen av att skapa en fosfodiesterbindning mellan den nya nukleotiden och den som redan finns pĂ„ DNA/RNA-strĂ€ngen.
+För att fÄ tillrÀckligt med energi för att driva fosfodiesterbindningen behöver man alltsÄ bryta tvÄ fosfoanhydridbindningar m.h.a. hydrolys. DÀrför krÀvs det totalt tre stycken fosfat (tvÄ slÀpps av och en hamnar i DNA/RNA-skelettet).
+ +kategory: nukleotider
prov: 2021-12-16
frÄga: 18
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Blodgrupperna ABO Àr kolhydratstrukturer som bland annat finns pÄ vÄra röda blodkroppar.
+A) Hur skiljer sig A, B och O strukturerna frÄn varandra?
+B) NÀr man ska ge röda blodkroppar till patienter kan man ge röda blodkroppar frÄn O-donatorer till patienter med blodgrupp A, B och AB, men man kan inte ge patienter med blodgrupp O röda blodkroppar frÄn donatorer med blodgrupp A, B eller AB. Varför?
";"A) De har olika uppsÀttning av sockerenheter.
+- A har fucos + galaktos + acetylgalaktosamin
+- B har fucos + galaktos + galaktos
+- 0 har fucos + galaktos
AlltsÄ skiljer sig dessa sekvenser frÄn varandra, dÀrför binder olika antikroppar in till olika sorter.
+B) Beroende pÄ vilken blodgrupp man har kommer man ha olika antigen och antikroppar
+- A har A-antigen och antikroppar mot B
+- B har B-antigen och antikroppar mot A
+- AB har A+B-antigen och inga antikroppar mot vare sig A eller B
+- 0 har ""inget antigen"" och dÀrav antikroppar mot bÄde A och B
Anledningen varför en person med blodgrupp 0 dĂ„ inte kan fĂ„ röda blodkroppar frĂ„n vare sig A, B eller AB Ă€r att den har antikroppar mot bĂ„de A och B. Dessa skulle dĂ„ fĂ€sta sig pĂ„ de transfererade blodkropparnas antigen och aktivera immunförsvaret â autoimmun reaktion. DĂ€remot gĂ„r det bra att personer som har blodgrupp A, B eller AB fĂ„r 0-röda blodkroppar eftersom dessa inte innehĂ„ller nĂ„gra antigen som deras immunförsvar (antikroppar) skulle kĂ€nna igen.
+ +kategory: kolhydrater
prov: 2021-12-16
frÄga: 1
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"![[Pasted image 20251128080420.png]]
+Diagrammet ovan visar koncentrationen av Ă€mnet A som funktion av tiden i en reaktion dĂ€r A omvandlas till Ă€mnet B i nĂ€rvaro av en lĂ„g koncentration av ett enzym som katalyserar reaktionen. Enzymet tillsattes omedelbart efter tiden tâ.
+Vi upprepar nu försöket pĂ„ samma sĂ€tt, men med den skillnaden att vi nu tillsĂ€tter 10 gĂ„nger högre koncentration av enzymet omedelbart efter tiden tâ. Ange för var och en av tidpunkterna tâ, tâ och tâ om [A] kommer att vara högre, lĂ€gre eller oförĂ€ndrad jĂ€mfört med i diagrammet ovan. Ange ocksĂ„ en motivation till ditt svar vid varje tidpunkt. (Max 150 ord.)
";"tâ kommer att vara oförĂ€ndrad. Detta pga att utgĂ„ngskoncentrationen av A inte kommer att minska bara för att man adderar mer enzym.
+tâ kommer vara lĂ€gre. Detta pga att enzymet katalyserar reaktionen â den kommer ske mycket snabbare â A kommer att bildas till B snabbare nĂ€r man tillsĂ€tter mer enzym â dĂ€rför sĂ€nks koncentrationen av A snabbare.
+tâ kommer Ă€ven den att vara oförĂ€ndrad eftersom man i kurvan ser att reaktionen vid den tidpunkten uppnĂ„tt jĂ€mvikt (koncentrationen förĂ€ndras inte). Enzymer pĂ„verkar inte jĂ€mviktskonstanten â alltsĂ„ vid vilket förhĂ„llande mellan koncentrationerna av A och B som reaktionshastigheten av AâB och BâA Ă€r lika. DĂ€rför kommer koncentrationen av A vid jĂ€mvikt (tâ) inte att pĂ„verkas av ökad koncentration av enzym.
+ +kategory: enzymer
prov: 2021-12-16
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden relaterade till pentosfosfatvÀgen Àr korrekt/korrekta?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
RĂ€tt svar
";"A, B och D
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2021-12-16
frÄga: 29
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"NÀr elektroner frÄn NADH genom transport i NADH-Q oxidoreduktas nÄr Q sker en konformationsförÀndring i komplexet som tillÄter protontransport över mitokondriens inre membran. Redogör för vilken egenskap en aminosyra som förmedlar konformationsÀndringen behöver ha, varför den behöver ha den egenskapen samt ge ett exempel pÄ en aminosyra som har den egenskapen. (Max 75 ord.)
";"NĂ€r Q tar upp tvĂ„ elektroner kommer den innan upptaget av protoner att vara negativt laddad, QÂČâ». Eftersom den Ă€r negativt laddad kommer den dĂ„ att interagera med aminosyror som har en laddning (kommer ske repulsion eller attraktion), dĂ€rför krĂ€vs det att aminosyran som förmedlar konformationsĂ€ndringen Ă€r positivt eller negativt laddad. Ett exempel pĂ„ en sĂ„dan aminosyra Ă€r arginin (Arg) â som Ă€r positivt laddad vid pH runt 7.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2021-12-16
frÄga: 4
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Which basic building blocks is the ribosome made of? / Vad Àr ribosomen huvudsakligen uppbyggd av?
";"It is made of rRNA and proteins. rRNA is in the center of both the large subunit and the small subunit. The proteins are more in the periphery.
+As described the ribosome has a large and a small subunit. In prokaryotes the small subunit is 30S and the large is 50S â they together form the 70S ribosome. In eukaryotes the ribosome is a bigger, the small subunit is 40S and the bigger is 60S â they form the 80S ribosome.
+The small subunits is where the t-RNAÂŽs anticodon pairs with the codon on the RNA strand, in the large subunit the peptide-bond is formed.
+ +kategory: translation
prov: 2021-12-16
frÄga: 16
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och Àr dÀrmed reglerat pÄ flera nivÄer. (Max 120 ord.)
+A) Vad gör att komplexet har en central roll i metabolismen?
+B) Ange summaformeln för de reaktioner som katalyseras av komplexet.
+C) En typ av reglering av komplexet Àr av feedforward-typ. Vad innebÀr feedforwardreglering, vad ger feedforwardreglering av komplexet och hur? Rita gÀrna.
a) Eftersom att den omvandlar pyruvat till acetyl-CoA â ett irreversibelt steg â glukoneogenes kan ej ske (eftersom pyruvat omvandlats).
+b) Pyruvat + CoA + NADâș â Acetyl-CoA + COâ + NADH + Hâș
+c) PDC kommer att feedforward-stimuleras av pyruvat. Feedforwardreglering innebĂ€r att en metabolit i nĂ„got steg innan det aktuella steget kommer att reglera den aktuella reaktionen. Stor mĂ€ngd pyruvat â det finns tillrĂ€ckligt â pyruvat inhiberar PD-kinas (enzym som fosforylerar och dĂ€rmed inhiberar PDC) â PDC Ă€r ej fosforylerat och dĂ€rmed aktivt. Pyruvatet signalerar alltsĂ„ att det finns tillrĂ€ckligt pyruvat â bĂ€ttre att omvandlas till acetyl-CoA för andra anvĂ€ndningsomrĂ„den.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2021-12-16
frÄga: 22
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"cVilken typ av molekyler passerar lÀttast genom ett cellmembran?
+VĂ€lj ett alternativ:
RĂ€tt svar
";"E
+ +kategory: cellmembran
prov: 2021-12-16
frÄga: 32
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Under vilka omstÀndigheter sker bildning av ketonkroppar. Varför sker detta? Beskriv den molekylÀra mekanismen.
";"Bildning av ketonkroppar sker vid svĂ€lt/fasta men kan Ă€ven ske vid diabetes typ 1. Vid bĂ„da dessa tillstĂ„nd kommer det finnas en lĂ„g nivĂ„ av insulin i blodet. Vid svĂ€lt för att glukoshalten Ă€r mycket lĂ„g â vid diabetes typ 1 för att pankreas ej kan producera insulin. Levern kommer att tolka de lĂ„ga nivĂ„erna av insulin som att kroppen svĂ€lter â den kommer genomföra mycket glukoneogenes för att bilda glukos för att slĂ€ppa ut till kroppens vĂ€vnader. Vid glukoneogenes anvĂ€nds oxaloacetat â nĂ€r levern kör glukoneogenes i högvarv kommer den dĂ€rför nĂ€stan helt ta slut. Den behövs Ă€ven för att slĂ„s ihop med acetyl-CoA för att kunna pĂ„börja citronsyracykeln. Vid avsaknad av oxaloacetat kommer dĂ€rav acetyl-CoA att ansamlas â den kommer dĂ„ att brytas ner till ketonkroppar. Dessa Ă€r vattenlösliga (till skillnad frĂ„n lipider) och kan dĂ€rav ta sig igenom blod-hjĂ€rnbarriĂ€ren. HjĂ€rnan kan dĂ„ omvandla ketonkropparna till acetyl-CoA och anvĂ€nda det som energi. HjĂ€rnan tar dock endast upp dessa vid svĂ€lt (dĂ„ finns ju ingen glukos i blodet) men inte vid diabetes (dĂ„ Ă€r glukoshalten hög).
+Bildningen av ketonkroppar Àr alltsÄ ett sÀtt att se till att hjÀrnan fÄr energi vid svÀlt. Vid svÀlt kan andra celler bilda energi m.h.a lipider men det kan inte hjÀrnan eftersom dessa inte kan passera blod-hjÀrnbarriÀren. Vid svÀlt (lÄgt glukos) mÄste dÀrför hjÀrnan fÄ energi pÄ annat sÀtt Àn glukos. Detta sker genom bildningen av ketonkroppar.
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2021-12-16
frÄga: 26
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Vid initiering av RNA-polymeras II-beroende transkription ingÄr flera basala transkriptionsfaktorer. Vilket/vilka pÄstÄende(n) om denna process stÀmmer?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
RĂ€tt svar
";"D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2021-12-16
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Vilket/vilka av följande pÄstÄenden Àr helt korrekta avseende kolesterolets omsÀttning och funktion i kroppen?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
B och D
+ +kategory: kolesterol
prov: 2021-12-16
frÄga: 27
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Describe mechanistically how an antibiotic may interfere with transcription of a bacterial genome. / Beskriv en mekanism för hur antibiotika kan störa transkription av ett bakteriellt genom.
";"Antibiotics can work as repressors. They can bind in to the operator region of an operon and thereby inhibiting the transcription of the genes that the operon contains.
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2021-12-16
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"The coupling of ATP synthesis to a glycolytic reaction is described below.
+PEP + HâO â pyruvate + Pi (ÎG = â78 kJ/mol)
+ADP + Pi â ATP + HâO (ÎG = +55 kJ/mol)
PEP + ADP â pyruvate + ATP (ÎG = â23 kJ/mol)
+Which of the following statements is correct for the reaction ADP + Pi â ATP + HâO?
+VĂ€lj ett alternativ:
RĂ€tt svar
";"D
+ +kategory: termodynamik
prov: 2021-12-16
frÄga: 17
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Rangordna nedanstÄende komponenter i andningskedjan frÄn lÀgst till högst redoxpotential.
+kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2021-12-16
frÄga: 23
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Vilken/vilka av nedanstÄende transportörer Àr en antiport?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
RĂ€tt svar
";"A och C
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2021-12-16
frÄga: 33
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullstÀndigt. I vilken ordning kommer följande intermediÀrer: alfaketoglutarat, 3-fosfoglycerat, glyceraldehyd 3-fosfat, oxalacetat?
+(Drag-och-slÀpp-frÄga)
";"kategory: glykolysen
prov: 2021-12-16
frÄga: 24
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Vilket/vilka av följande alternativ om DNA-replikation Àr korrekt/korrekta?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
A & B
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2021-12-16
frÄga: 10
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vid eukaryot DNA-replikation sÄ spelar CMG-helikaset en viktig roll. Detta helikas bestÄr av tre delar: MCM, Gins och Cdc45. (Max 50 ord.)
+a. I vilken fas av cellcykeln binder MCM till replikations-origin?
+b. I vilken fas av cellcykeln binder Gins och Cdc45 till MCM?
+c. Varför Àr det viktigt att separera laddningen av MCM-helikaset frÄn dess aktivering med hjÀlp av Gins och Cdc45?
a) I G1-fasen binder MCM m.h.a. ORC och laddningsfaktorerna Cdc6 och Cdt1.
+b) Ăkad nivĂ„ av CDK (kinaser) bidrar till att binda Gins och Cdc45 i S-fasen.
+c) För att försÀkra att replikationen bara sker en gÄng per cellcykel. DÀrför Àr nivÄerna av CDK lÄga i G1 och stiger i S.
kategory: dna-replikation
prov: 2021-12-16
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Plasmid DNA purified from colonies grown on blue/white screening plates was verified by electrophoresis. Samples in Lanes C and D are digested by enzyme for verification whilst Lanes A and B are non-digested samples. Select the correct description/descriptions based on the gel picture below.
+![[Pasted image 20251128080404.png]]
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+RĂ€tt svar +1. C +2. D
+(FlersvarsfrÄga; i originalbilden Àr första pÄstÄendet felmarkerat, de tvÄ sista rÀttmarkerade.)
+ +kategory: plasmid
prov: 2021-12-16
frÄga: 34
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Which of the following is/are true about bacterial transformation? / Vilket/vilka av nedanstÄende stÀmmer för bakteriell transformation?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
B och D
+ +kategory: rekombinant-dna-teknik
prov: 2021-12-16
frÄga: 14
";"rekombinant-dna-teknik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rekombinant-dna-teknik" +"Ge ett exempel pÄ och förklara mekanismen bakom en förÀndring i metabolismen som sker vid högintensivt muskelarbete för att vi ska bli bÀttre pÄ att utföra anaerob glykolys framöver. (Max 120 ord.)
";"Högintensivt muskelarbete kommer leda till syrebrist, nĂ€r detta sker kommer transkriptionsfaktorn HIF-1 att aktiveras. Den kommer att stimulera ökad produktion av glukostransportörer, enzymer i glykolysen och Ă€ven aktivera VEGF. VEGF ökar vaskulariseringen av vĂ€vnaden â mer blodkĂ€rl. Detta gör att musklerna kommer i kontakt med fler blodkĂ€rl och dĂ€rmed mer glukos. Den ökade mĂ€ngden glukostransportörer gör att cellerna kan ta upp glukos i större mĂ€ngder nĂ€r det behövs. Ăkad mĂ€ngd enzymer i glykolysen gör att musklerna kan ta hand om glukoset och omvandla det till energi i större utstrĂ€ckning nĂ€r det behövs. Vid anaeroba förhĂ„llanden kan musklerna bara anvĂ€nda sig av glykolys â genom HIF-1 blir de bĂ€ttre pĂ„ att ta upp glukos och bĂ€ttre pĂ„ att utnyttja den.
+ +kategory: glykolysen
prov: 2021-12-16
frÄga: 20
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Vilket/vilket av följande pÄstÄenden relaterade till nukleotiders nedbrytning Àr korrekt/korrekta?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
RĂ€tt svar
";"A, B och D
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2021-12-16
frÄga: 30
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"In order for the lagging strand to become one single continuous strand, the Okazaki fragments (OF) must undergo a maturation process. / För att den slÀpande strÀngen ska bli en kontinuerlig strÀng behöver Okazakifragment genomgÄ en mognadsprocess.
+A) Which two enzymes are involved in bacterial OF maturation?
+B) Briefly describe their specific functions in the process.
a) Polymeras 1 och DNA-ligas.
+b) Polymeras 1 har en 5-3-exonukleas-aktivitet, den kommer att bryta upp RNA-primerna pÄ Okazakifragmenten i 5-3-riktning. Den kommer ocksÄ byta ut RNAt mot korresponderande DNA. För att detta ska ske korrekt har den Àven en 3-5-exonukleas-aktivitet som kan bryta fosfodiesterbindningar om fel nukleotid sÀtts pÄ.
+Ligaset kommer att reparera ""nicks"", alltsÄ smÄ mellanrum som kommer finnas mellan det nysyntetiserade DNAt som tagit primerns plats och det ""Àldre"" DNAt. Detta gör ligaset genom att skapa en fosfodiesterbindning mellan nukleotiderna, detta sker med hjÀlp av ATP.
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2021-12-16
frÄga: 15
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Förklara varför utbytet av ATP frÄn en glukos som genomgÄr aerob katabolism inte alltid blir detsamma. (Max 120 ord.)
";"Hur mycket ATP man fÄr beror pÄ vilken transportör som anvÀnds för intaget av de 2 NADH till mitokondrien som tillverkats vid glykolys.
+Om glycerol-3-fosfatshunten anvĂ€nds, dĂ€r kommer NADH genom ett mellansteg donera sina elektroner till FAD som befinner sig i komplex 2 i elektrontransportkedjan. DĂ€rav kommer 2 st NADH inte att donera nĂ„gra elektroner till komplex 1 vilket skulle ha resulterat i utpumpandet av 2Ă4 vĂ€ten som i sin tur skulle resulterat tvĂ„ mer ATP genererade.
+Om istĂ€llet malat-aspartatshunten anvĂ€ndas kommer inte tvĂ„ ATP att förloras. DĂ€r kommer NADH reducera oxaloacetat till malat â transporteras in i mitokondrien â omvĂ€nda reaktionen sker â NADâș i mitokondrien blir NADH â donerar elektroner till komplex 1 â inga protoner ""tappas"", tvĂ„ ""extra"" ATP.
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2021-12-16
frÄga: 21
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Beskriv översiktligt hur heme bryts ner och utsöndras.
";"Heme kommer först att bilda biliverdin â sedan bildas bilirubin â sedan bildas bilrubin. Bilirubin Ă€r en hydrofob molekul â kan inte transporteras fritt i blodet â dĂ€rför kommer den i levern att konjugeras med tvĂ„ stycken syror, glukaronsyror â bilrubin bildas som Ă€r amfipatisk och en mer vattenlöslig molekyl. Den kommer dĂ€rmed att utsöndras genom gallan i levern â transporteras till tunntarmen â utsöndras slutligen i avföringen.
+ +kategory: heme
prov: 2021-12-16
frÄga: 31
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Vilken Àr den huvudsakliga funktionen av glykogen i levern respektive skelettmuskulaturen? Ange Àven den huvudsakliga orsaken till denna skillnad samt vilken slutprodukt som bildas vid fullstÀndig glykogenolys i respektive vÀvnad.
";"Glykogen i levern fungerar som en glukosreserv för blodet â man vill kunna sĂ€nka blodglukosen om den Ă€r för hög â glykogen bildas â och kunna höja den om den Ă€r för lĂ„g â glykogen bryts ner â glukos slĂ€pps ut i blodet.
+I muskler fungerar glykogen som en glukosreserv för muskeln sjÀlv. Om det behövs ATP pga muskelarbete kommer glykogen att brytas ned och gÄ in i glykolysen.
+Anledningen till att bara levern kan skicka ut glukos till blodet Ă€r för att den har enzymet glukos-6-fosfatas i ER. Vid nedbrytning av glykogen kommer glukos-1-fosfat bildas â sedan isomeriseras detta m.h.a. fosfoglukosmutas (sker i bĂ„de muskler och lever) till glukos-6-fosfat. Detta Ă€r den slutgiltiga produkt som bildas i glykogenolys i muskler â den kan gĂ„ in i glykolys eller andra metabola vĂ€gar. Glukos-6-fosfat kan dock inte transporteras ut ur cellerna. För att göra detta mĂ„ste den omvandlas till glukos. Det Ă€r vad glukos-6-fosfatas-enzymet gör, den tar bort fosfatgruppen med hjĂ€lp av hydrolys. DĂ„ kan glukos slĂ€ppas ut i blodet och transporteras till andra vĂ€vnader. Glukos Ă€r alltsĂ„ slutprodukten i lever.
+Sammanfattat Àr alltsÄ anledningen till varför glykogen har olika funktioner i muskler och lever för att lever innehÄller enzymet glukos-6-fosfatas medan muskler inte innehÄller detta enzym. Detta enzym möjliggör att glukos kan slÀppas ut i blodet och inte endast anvÀndas i den egna cellen.
+ +kategory: glykogen
prov: 2021-12-16
frÄga: 25
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Beskriv nukleosomens uppbyggnad (Nucleosome core particle). Ange vilka komponenter som ingÄr och hur de Àr organiserade.
";"Nukleosomen bestĂ„r av histon-proteiner och DNA-helix. I mitten av nukleosomen finns tvĂ„ kopior av histonproteinerna H2A, H2B, H3 och H4. Detta bildar alltsĂ„ en oktamer. Sedan lindas DNA runt histonerna ungefĂ€r 1,75 varv, ca 100â200 baspar lĂ„ngt. Sedan sĂ€tter sig en till histon, H1, utanpĂ„ DNA-strĂ€ngen och oktameren för att stabilisera och motverka att strukturen lindas upp. Mellan tvĂ„ histoner kommer det finnas en fri bit av DNA som kallas linker-DNA.
+ +kategory: kromatin
prov: 2021-12-16
frÄga: 11
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Du har fÄtt i uppgift att analysera proteiner i en lösning med hjÀlp av SDS-PAGE. (Max 150 ord)
+A) Förklara principen för metoden.
+B) Vad fyller SDS för funktion?
+C) Vilken egenskap hos proteinet anvÀnds för separation?
A) Principen med SDS-PAGE Ă€r att man vill analysera proteiner avseende massa. Man anvĂ€nder först en molekyl som heter SDS, en negativt laddad molekyl som binder till proteiner. Ju större massa proteinet har â desto större mĂ€ngd SDS-molekyler binder â resulterar i en större negativ laddning (jĂ€mfört med mindre proteiner). Sedan lĂ„ter man dessa proteiner vandra genom en polyakrylamid-gel frĂ„n en negativ elektrod till en positiv elektrod. Ju större negativ laddning desto större motstĂ„nd i gelen. Detta leder till att smĂ„ proteiner vandrar lĂ€ngst och stora kortast. DĂ„ fĂ„r man alltsĂ„ en separation i gelen avseende storlek.
+B) SDS som beskrivet Ă€r en negativ molekyl som binder till protein â funktionen Ă€r att skapa en laddningsskillnad mellan proteiner som korresponderar till storleken.
+C) Det Àr proteinernas massa som anvÀnds för separation.
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2021-12-16
frÄga: 8
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::utforska-proteiner" +"Du sĂ€tter upp en studie för att avgöra om mĂ€nniskor som migrerar löper en ökad risk att utveckla schizofreni jĂ€mfört med icke-migranter. Din nollhypotes Ă€r sĂ„ledes följande: âRisken att utveckla schizofreni Ă€r densamma bland migranter och icke-migranterâ. Du genomför studien, sammanstĂ€ller resultaten och utför ett statistiskt test för att avgöra om den eventuella skillnaden Ă€r statistiskt signifikant. NĂ€r kan du förkasta nollhypotesen med viss sĂ€kerhet?
+VĂ€lj ett alternativ:
C
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2021-12-16
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Rita en dipeptid bestÄende av de tvÄ (olika) aminosyror frÄn vars sidokedjor det inte gÄr att bilda glukos. Dipeptiden befinner sig i en lösning med pH-vÀrde 2. Ange vilka aminosyrorna Àr.
";"![[Pasted image 20251128074813.png]]
+Ska stÄ Lysin, inte Lycin.
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2021-12-16
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Briefly describe the RNA world hypothesis with an example. / Beskriv kortfattat RNA-vÀrlds-hypotesen genom ett exempel. (Max 100 words.)
";"The RNA world hypothesis describes how living things has gone from using only RNA as storage of genetic material and catalyzing chemical processes (ribozymes) to being close to solely depending on proteins to catalyze many important chemical processes.
+One example is the enzyme RNAse P which function is cleave the 5ÂŽ end of tRNA-molecules. In bacteria the enzyme consits of almost only RNA and very little proteins (which are not even essentiall to the function). In archea there is less RNA and more protein, and in eukaryotes proteins make up the largest part of the enzyme. This is aligned with the hypothesis.
+ +kategory: evolution
prov: 2021-12-16
frÄga: 7
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilken/vilka av nedanstÄende faktorer leder till att hemoglobinets syrebindande förmÄga minskar?
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
A och D
+ +kategory: hemoglobin
prov: 2021-12-16
frÄga: 6
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Ange en skillnad mellan mÀttade och omÀttade fettsyror avseende struktur och en skillnad avseende inverkan pÄ fluiditeten hos cellens membran.
";"MĂ€ttade fettsyror har inga dubbelbindningar â dĂ€rav Ă€r deras fettsyrekedjor raka strukturer.
+OmĂ€ttade fettsyror har dĂ€remot en eller flera dubbelbindningar â detta leder till en böjning i strukturen dĂ€r dubbelbindningen sitter â fettsyrorna blir inte helt raka strukturer utan böjda pĂ„ olika sĂ€tt beroende pĂ„ vart dubbelbindningarna sitter och om de har trans eller cis-konfiguration.
Eftersom att de mĂ€ttade fettsyrorna har raka fettsyrasvansar kan dessa packas mycket tĂ€tt â fluiditeten i membranet minskar. DĂ€remot kan de omĂ€ttade fettsvansarna inte packas lika tĂ€tt pĂ„ grund av att de inte Ă€r raka strukturer â fluiditeten i membranet ökar.
+ +kategory: lipider
prov: 2021-12-16
frÄga: 2
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om heme Àr korrekta? (2p)
+A och D
+ +kategory: heme
prov: 2023-12-18
frÄga: 28
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Du jobbar pÄ labb över sommaren och har fÄtt i uppgift att göra en rening av ett protein baserat pÄ laddning. (4p) (Max 200 ord)
+A) Beskriv vilken metod du skulle anvÀnda dig av och hur denna fungerar.
+B) Ange en metod för att analysera storleken pÄ ditt framrenade protein och ge en förklaring till hur denna fungerar.
a) Jonbyteskromotografi. Efter att ha lösgjört proteinerna i homogenisat gÄr reningsmetoden ut pÄ att man för proteinlösningen genom en kolonn som innehÄller kulor som antingen Àr positivt eller negativt laddade beroende pÄ proteinets laddning som man vill ha ut. En katjonsbytare Àr negativt laddade kulor i kolonnen som kommer att attrahera positivt laddade proteiner frÄn fasen man för igenom medan en anjonbytare dÀremot Àr positivt laddade kulor som kommer att attrahera negativt laddade proteiner. Det Àr proteinets totala laddning som selekteras. Sedan kan en buffert eller salt anvÀndas för att eluera proteinerna frÄn de laddade kulorna i kolonnen för vidare analys. b) För att analysera storleken hade jag valt SDS page som Àr en elektrofores-metod dÀr man först blandar i Àmnet SDS (sodum dodecyl sulfate) som Àr negativt laddade molekyler som kommer att binda till aminosyrorna och slÄ ut proteinets tidigare laddning. Proteinetet kommer att binda SDS baserat pÄ hur stort det Àr, ju större protein desto mer negativt laddat dÄ fler aminosyror laddas av SDS och proteinerna fÄr vandra i ett elektriskt fÀlt dÀr de minsta vandrar lÀngst mot positiv pol dÄ de hindras minst av de steriska hindrena i polyakrylamid-gelen. Separation map STORLEK
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2023-12-18
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Redogör för begreppet entalpi samt för hur den kan anvÀndas för att förutse tendensen för att en viss biokemisk reaktion att ske. (4p)
";"Entalpi (H) betyder energiinnehÄllet i en reaktion.
+Entalpi beror pÄ bindningar som finns i de Àmnen som Àr delaktiga i reaktionen och vilken art bindningarna har.
+I en exoterm reaktion kommer energiinnehÄllet minska eftersom energi slÀpps ut.
+Om ÎH Ă€r negativ för en reaktion Ă€r den exoterm och kan dĂ€rmed ses som fördelaktig.
+NÀr energi, t.ex. i form av vÀrme, slÀpps ut till omgivningen kan det öka entropin i molekyler som finns runtom, vilket Àr fördelaktigt enligt termodynamikens andra lag.
(Om temperaturen och trycket Ă€r konstant kan H tillsammans med systemets parametrar anvĂ€ndas för att berĂ€kna den fria energin. ÎG = ÎH â TÎS. Om ÎG Ă€r negativ Ă€r reaktionen spontan och benĂ€gen att ske.)
+ +kategory: termodynamik
prov: 2023-12-18
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"I celler Àr vatten lösningsmedel. Förklara ur bindningssynpunkt varför detta Àr fördelaktigt. (4p) (Max 100 ord.)
";"Vatten Àr en polÀr molekyl och har en dipol eftersom syret Àr mer elektronegativt Àn de tvÄ vÀtena.
+Polariteten gör att vattenmolekyler kan interagera med bÄde positivt laddade molekyler och negativa laddade molekyler som finns i celler.
+Vid interaktioner med positivt laddade joner kommer den mer elektronegativa syret interagera med jonerna.
+I interaktioner med negativt laddade joner kommer istÀllet vÀterna interagera.
+Vatten kan sÄledes bilda hydratiseringsskal runt joner som Àr essentiella för cellfunktion.
+Vatten har hög dielektricitetskonstant som gör att alltför starka jonbindningar inte bildas till Àmnen, sÄ att joner kan fortfarande utnyttjas i cellulÀra processer vid behov.
kategory: kemiska-bindingar
prov: 2023-12-18
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kemiska-bindingar" +"TvĂ„ fördelar med att mĂ€ta den initiala hastigheten för en reaktion, Vâ, Ă€r att i början av en reaktion ⊠(2p)
+A och B
+ +kategory: enzymer
prov: 2023-12-18
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Redogör för hur ATP-syntaset fungerar. (4p) (Max 150 ord.)
";"ATP-syntaset utnyttjar protongradienten som bildades i elektrontransportkedjan.
+Dess Fâ-del finns i mitokondriens inre membran och har en a-subenhet som innehĂ„ller tvĂ„ hydrofila halvkanaler: mot mellanmembranutrymmet (MMU) respektive matrix.
+a-subenheten interagerar med en c-subenhet (som finns i en ring) som har en negativt laddad aspartat- eller glutamatrest.
+En proton kan komma in i halvkanalen mot MMU och interagera med aminosyraresten i c-subenheten.
+Neutralisering gör att c-subenheten roterar en enhet medsols.
+DÀrmed kan en proton komma in mot halvkanalen mot matrix och frisÀttas i matrix.
Fâ Ă€r kopplad till Fâ-delen i matrix via en Îł-stjĂ€lk.
+Fâ har 3 alfa- och 3 betasubenheter i en ring.
+Betasubenheterna bildar ATP och antar tre konformationer: Loose (dÀr ADP + Pi binder), Tight (dÀr ATP bildas) och Open (dÀr ATP frislÀpps och en ny ADP + Pi kan binda in).
+Den roterande γ-stjÀlken kan leda till konformationsÀndringarna i betasubenheterna.
+3 ATP bildas per varv.
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2023-12-18
frÄga: 29
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"What does cooperative binding mean? Explain this in the context of hemoglobin. (4p)
+OBS! This question needs to be answered in English. (Max 100 words)
Cooperative binding means that the binding of an oxygen to hemoglobin makes it more likely for the molecule to bind more oxygen.
+This is because when an oxygen binds to hemoglobin the structure becomes less tense as one αÎČ-dimer rotates 15 degrees, which increases its affinity for oxygen at other binding sites.
+Release of an oxygen promotes also further release.
+Due to the cooperativity hemoglobin has a sigmoidal binding curve at different partial pressures of oxygen.
+Cooperativity enables hemoglobin to be a good oxygen transporter.
kategory: hemoglobin
prov: 2023-12-18
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vad Àr en hydropatiplot och vad ger den information om? (4p)
";"En hydropatiplot kan ge information om det Àr sannolikt att en viss sekvens Àr en transmembran alfahelix och hur mÄnga alfahelixar det kan motsvara.
+En hydropatiplot kan skapas genom att undersöka en aminosyrasekvens frĂ„n N- till C-terminal i intervaller om 20 (aminosyra 1â20, 2â21, 3â22 osv.).
+Detta beror pÄ att det krÀvs 20 aminosyror för att gÄ genom cellmembranet.
+Man tittar pÄ den energimÀssiga kostnaden för att flytta respektive aminosyra frÄn en hydrofob till hydrofil miljö.
+VÀrdena plottas i en graf dÀr energinivÄn Àr pÄ y-axeln och intervallerna Àr pÄ x-axeln.
+Man sÀtter grÀnsvÀrdet pÄ 84 kJ/mol (kommer frÄn transmembrana alfahelixar med kÀnd struktur).
+Om en graf gÄr över grÀnsvÀrdet en gÄng Àr det sannolikt en transmembran alfahelix.
+Om den gÄr ovanför grÀnsvÀrdet flera gÄnger tyder det pÄ flera transmembrana alfahelixar.
kategory: cellmembran
prov: 2023-12-18
frÄga: 16
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"I glykolysen finns tvÄ reaktioner dÀr ATP förbrukas och tvÄ reaktioner dÀr ATP bildas.
+A) Vilka enzymer katalyserar dessa reaktioner?
+B) Förklara hur glykolysen trots detta ger ett nettoutbyte av tvÄ ATP.
+(4p) (Max 50 ord)
A) Hexokinas (glukokinas) katalyserar första förbrukningen av ATP och fosfofruktokinas 1 katalyserar andra. Fosfoglyceratkinas katalyserar bildning av första ATP och pyruvatkinas katalyserar bildning av.
+B) Vid spjÀlning av fruktos 1,6 - bisfosfatas bildas tvÄ 3-kolsenheter, dihydroxyacetonfosfat och glyceraldehyd 3 fosfat. Dihydroxyacetonfosfat kommer bilda glyceraldehyd3fosfat och dÀrmed gÄr 2 glyceraldehyd3fosfat igenom
+ +kategory: glykolysen
prov: 2023-12-18
frÄga: 22
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"NÀmn det fullstÀndiga namnet pÄ en purin-nukleotid och ange i vilken molekyl kolskelettet respektive huvuddelen av molekylens kvÀveatomer slutligen hamnar dÄ nukleotiden bryts ned. (2p) (Max 50 ord)
";"Adenosinmonofosfat (AMP).
+Kolskelettet samt huvuddelen av kvÀvet hamnar i urat.
kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2023-12-18
frÄga: 32
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"I aerob katabolism kommer glukos att omvandlas i ett flertal steg innan det oxiderats fullstÀndigt. I vilken ordning kommer följande metaboliter? (2p)
+kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2023-12-18
frÄga: 26
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Hur kan en mutation i ett icke-kodande intron ge upphov till sjukdom, t.ex. talassemi? (4p)
";"En mutation, t.ex. en punktmutation, kan leda till att en ny splice site bildas i mitten av en intron.
+NÀr ett primÀrt mRNA senare ska genomgÄ splicing kan det nya splice-sitet leda till att en del av intronet blir kvar.
+Intronet kan t.ex. leda till att andra kodon finns kvar eller att stoppkodon blir kvar som leder till att felaktig genprodukt bildas nÀr mRNA senare translateras.
+Detta kan i sin tur leda till proteiner som har defekter och inte kan utföra normal funktion.
kategory: rna-syntes
prov: 2023-12-18
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"You amplified a gene of interest using the blue/white screening method. You extracted plasmids from two bacterial colonies (one blue colony and one white colony), then performed restriction enzyme digestion and ran the samples on a gel as follows: blue uncut, blue cut, white uncut, white cut (see gel below). When imaging the gel, however, you notice there is a faint band in the blue cut sample (see arrow), which should not be there. Explain why the faint band should not be present in that sample and what are the possible sources of error for this outcome? Refer to the size/number of bands in comparison to the bands in the other lanes for your explanation. This questions needs to be answered in English. (4p)
+![[Pasted image 20251129235214.png]]
";"The blue samples are samples with no DNA-insert.
+They have an intact lacZ-gene and are able to produce ÎČ-galactosidase which breaks down X-gal to a blue pigment.
+Since the blue colony samples have no DNA insert, the blue sample should show one band on the gel electrophoresis.
The reason that the blue cut shows two bands can be because a mixed colony was chosen, meaning one that also had white colonies.
+This could likely be the case because the second band has a 1500 bp size which the second band of the ""white cut"" also has.
+Another possible reason for this odd result is contamination.
+The ""blue cut"" sample could possibly have been contaminated with white cut samples when pipetting or by improper labelling of tubes.
+This could be the case as the samples in both lanes show similar sizes (even the larger band is approximately the same size in both, 3000 bp).
kategory: plasmid
prov: 2023-12-18
frÄga: 36
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Vilka tvÄ effekter har insulin pÄ fettmetabolismen? (2p)
+C och D
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2023-12-18
frÄga: 27
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer om trp-operonet? (2p)
+C och D
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2023-12-18
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om glukostransportörer Àr korrekta? (2p)
+B och C
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2023-12-18
frÄga: 17
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för flera enzymer.
+A) Vilka Àr enzymerna och hur pÄverkas deras aktivitet av fruktos 2,6-bisfosfat inbindning?
+B) Vad reglerar hur mycket fruktos 2,6-bisfosfat som bildas?
+(4p) (Max 75 ord.)
A) Fosfofruktokinas i glykolys aktiveras.
+Fruktos-1,6-bisfosfatas i glukoneogenes inhiberas.
B) Fruktos 2,6-bisfosfat (F-2,6-BP) bildas av fosfofruktokinas 2 som ingÄr i ett bifunktionellt enzym med fruktos-2,6-bisfosfatas.
+Om insulin finns stimulerar det fosfoproteinfosfatas som defosforylerar och aktiverar fosfofruktokinas 2 vilket leder till ökad F-2,6-BP-produktion.
+DÀremot, om glukagon finns, ger det upphov till cAMP-bildning som aktiverar proteinkinas A som fosforylerar fosfofruktokinas 2, som dÀrmed inhiberar produktionen av fruktos-2,6-bisfosfat.
kategory:
prov: 2023-12-18
frÄga: 23
";"";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::FĂRELĂSNING" +"En fullt funktionell pentosfosfatvĂ€g Ă€r viktig för röda blodkroppars skydd mot vĂ€teperoxid. Varför? (2p) (Max 50 ord)
";"NÀr glutationperoxidas tar hand om vÀteperoxid oxideras glutation.
+För att skyddet ska fortsÀtta finnas mot vÀteperoxid mÄste den reducerade formen av glutation Äterbildas med reduktionsmedlet NADPH.
+I röda blodkroppar saknas mitokondrier och NADPH kan endast bildas genom pentosfosfatvÀgen.
+DÀrför Àr en funktionell pentosfosfatvÀg viktig.
kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2023-12-18
frÄga: 33
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden om glykogenmetabolism Àr korrekta? (2p)
+D: Glykogenolys sker i huvudsak via sÄ kallad hydrolys.
+A och C
+ +kategory: glykogen
prov: 2023-12-18
frÄga: 24
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"PÄ bilden syns en eukaryot replikationsgaffel. Fyra olika replikationsfaktorer Àr markerade pÄ denna bild. Vad heter de olika faktorerna vid pil a, b, c och d? (4p)
+![[Pasted image 20251129235154.png]]
";"a) CMG-helikas
+b) PCNA
+c) Replication protein A
+d) DNA-polymeras ÎŽ
kategory: dna-replikation
prov: 2023-12-18
frÄga: 10
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om kromatin Àr korrekta? (2p)
+A och B
+ +kategory: kromatin
prov: 2023-12-18
frÄga: 9
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reduktas (HMG-CoA-reduktas) har en nyckelroll i reglering av cellernas kolesterolsyntes. Beskriv hur detta enzym regleras pÄ transkriptionell nivÄ; den viktigaste reglermekanismen. (4p)
";"Transkriptionen regleras av Sterol Regulator Element Binding Protein (SREBP) som har en transkriptionsfaktordel mot cytosolen.
+Vid lÄg kolesterol flyttas SREBP frÄn det endoplasmatiska retiklet till golgiapparaten.
+HĂ€r klyvs transkriptionsfaktordelen av SREBP av Golgi localized site 1 proteaset.
+DĂ€refter klyver site 2-proteaset vid N-terminalen.
+Den N-terminala delen som har transkriptionsfaktorn binder till Sterol Regulator Element 1 som finns i promotorn av bland annat HMGR, som leder till en ökad transkription av HMGR.
SjÀlva transporten av SREBP till golgiapparaten, som ocksÄ pÄverkar transkriptionen, regleras av Insig 1, Insig 2 och Scap.
+Vid lĂ„g kolesterolnivĂ„ kommer Insig inte binda till SREBPâScap-komplexet.
+Insig bryts dĂ€rmed ned i proteasomen och SREBPâScap-komplexet kan interagera med COPII, som Ă€r involverade i vesiklar som transporteras till golgi.
+Men om kolesterol finns och det binder till SREBPâScap-komplexet kommer en konformationsĂ€ndring ske som gör att Insig kan binda in.
+Detta förhindrar interaktion med COPII.
+SREBP gÄr inte med i vesiklar till golgi, vilket betyder att transkription av HMGR inte ökar nÀr mycket kolesterol finns.
kategory: kolesterol
prov: 2023-12-18
frÄga: 34
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Wobble-effekten Àr en viktig aspekt av genetisk kodavlÀsning under translationen. Förklara vad wobble-effekten Àr och hur den bidrar till flexibiliteten i parningen mellan kodoner pÄ mRNA och antikodonerna pÄ tRNA. Diskutera Àven hur denna effekt kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer. (4p) (Max 150 ord)
";"Wobble-effekten betyder att den första basen i ett antikodon kan binda till flera olika baser pÄ den tredje basen av ett kodon.
+En kvÀvebas pÄ tRNA-antikodon som har en sÄdan förmÄga att binda till flera olika baser pÄ den tredje basen i kodonet Àr inosin, som kan binda till uracil, cytosin och adenin.
+Att den första basen i antikodonet kan binda till flera baser leder till att ett tRNA kan binda till flera kodon pÄ mRNA vilket ökar molekylens flexibilitet (en aminosyra kan kopplas till flera olika kodon).
+Wobble-effekten kan bidra till tolerans mot vissa genetiska mutationer, eftersom Àven om en mutation finns som gör att en annorlunda kvÀvebas finns, kan tRNA trots detta binda till det och binda korrekt aminosyra.
kategory: translation
prov: 2023-12-18
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Vad Àr syftet med den katalytiska klyftan som finns i ett enzym? Redogör för tvÄ fördelar den katalytiska klyftan ger för katalys. (4p)
";"Den katalytiska klyftan Àr den del av enzymet som substratet binder in och som reaktionen kan katalyseras i. och övergÄngstillstÄndet kan stabilseras sÄ att reaktionen kan ske snabbare. Den katalytiska klyftan Àr en vÀldigt liten del av enzymet och bestÄr av aminosyrarester i proteinet som ger en specificitet för enbart vissa molekyler att binda in, detta ökar specificiteten och hindrar andra potentiella reaktanter frÄn att komma nÀra och interagera. Den utesluter bland annat vatten som hade hÀmmat mÄnga reaktioner genom sin polaritet. Dessutom kommer den katalytiska klyftan att införa svaga bindingar som stabiliserar övergÄngstillstÄndet och bildningen av produkt, ett fenomen som i vanliga fall hade krÀvt betydligt högre aktiveringsenergi för att kunna ske. Dvs som hade krÀvt högre energi i omlopp som hade satt molekylerna i rörelse sÄ att de kom nÀra varandra tillrÀckligt ofta för att det ostabila övergÄngstillstÄndet hade kunnat ske. Den katalytiska klyftan av enzymet sÀnker dÀrför aktiveringsenergin till reaktionen.
+ +kategory: enzymer
prov: 2023-12-18
frÄga: 20
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Beskriv med en reaktionsformel hur celler hanterar att syrgas ibland enbart tar upp en elektron. (2p) (Max 25 ord)
";"Superoxid + 2 Hâș â HâOâ mha dismutas.
+(superoxid = Oâ·â»)
(VĂ€teperoxiden tas hand om av glutationperoxidas
+(2 HâOâ â Oâ + 2 HâO, dĂ€r 2 glutation oxideras))
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2023-12-18
frÄga: 30
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Lista fyra aspekter som Àr identiska för alla livsformer pÄ jorden. (4p)
";"kategory: evolution
prov: 2023-12-18
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende molekyler Àr beroende av en B-vitamin för sin syntes? (2p)
+A och C
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2023-12-18
frÄga: 21
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Ange det fullstÀndiga namnet pÄ ett kliniskt viktigt enzym som tillhör gruppen aminotransferaser, samt ange reaktionen enzymet katalyserar. (4p) (Max 50 ord)
";"Alanin aminotransferas (höga nivÄer av detta tyder pÄ leversjukdom).
+Den katalyserar följande reaktion:
+Alanin + α-ketoglutarat â Pyruvat + Glutamat.
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2023-12-18
frÄga: 31
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende molekyler reglerar nÄgot enzym i citronsyracykeln? (2p)
+A och D
+ +kategory: citronsyracykeln
prov: 2023-12-18
frÄga: 25
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"a) Vilken roll spelar DNA-polymeras epsilon?
+b) Hur kan PCNA pÄverka aktiviteten hos DNA-polymeras epsilon?
+(4p)
a) DNA-polymeras epsilon Àr involverad i DNA-replikation pÄ leading strand.
+Det katalyserar pÄkopplingen av kvÀvebaser frÄn 5' till 3'-riktning.
+Det har en 3' till 5' exonukleasaktivitet och kan ta bort om en felaktig bas har kopplats pÄ (proofreading).
b) PCNA (sliding clamp) ökar processiviteten hos DNA-polymeras genom att hÄlla det fastbundet till DNA-mallen.
+PÄ sÄ sÀtt ramlar DNA-polymeraset inte av och kan arbeta med ökad processivitet.
kategory: dna-replikation
prov: 2023-12-18
frÄga: 11
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Glykaner kan vara O-lÀnkade och N-lÀnkade. Förklara kortfattat vad detta innebÀr pÄ molekylÀr nivÄ. (4p) (Max 150 ord)
";"O-lÀnkade glykaner betyder att kolhydraten Àr lÀnkad via syre i sidokedjan av serin eller threonin.
+N-lÀnkade betyder att kolhydraterna Àr lÀnkade via kvÀvet i sidokedjan av asparagin.
kategory: kolhydrater
prov: 2023-12-18
frÄga: 8
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kolhydrater" +"I en studie utvĂ€rderas effekten av en ny blodtryckssĂ€nkande medicin mellan en behandlingsgrupp och en placebogrupp. Resultaten frĂ„n studien visar ett p-vĂ€rde pĂ„ 0,03 och ett 95% konfidensintervall pĂ„ 6â17 mmHg. Nollhypotesen Ă€r att det inte finns nĂ„gon skillnad i medelvĂ€rde i blodtryck mellan de tvĂ„ grupperna. Vilka tvĂ„ pĂ„stĂ„enden Ă€r korrekta baserat pĂ„ dessa resultat? (2p)
+VĂ€lj ett eller flera alternativ:
+A och B
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2023-12-18
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Fruktos 2,6-bisfosfat fungerar som en allosterisk regulator för tvÄ enzymer. Förklara vilka egenskaper de aminosyror som binder till fruktos 2,6-bisfosfat behöver ha och nÀmn tvÄ aminosyror som har dessa egenskaper. (4p) (Max 75 ord.)
";"Fruktos 2,6-bisfosfat har tvÄ fosfatgrupper som kan ha negativt laddade syren.
+För att binda in Àmnet och skapa en elektrostatisk attraktion (jonbindning), kan det dÀrmed vara fördelaktigt att ha aminosyror som har en positiv laddning.
+Lysin och arginin Àr tvÄ positivt laddade aminosyror som kan vara lÀmpliga.
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2023-12-18
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Den vanligaste formen som DNA antar kallas B-DNA. Vilka tvÄ pÄstÄenden stÀmmer om denna? (2p)
+B och C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2023-12-18
frÄga: 7
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"a) Rita strukturen för kolesterol.
+b) Visa hur kolesterol orienteras i ett membran.
OBS! Den hÀr frÄgan ska besvaras pÄ separat papper som kommer att skannas in och bifogas tentamen. (4p)
";"se 2023-12-18-0114-EES
+ +kategory: lipider
prov: 2023-12-18
frÄga: 6
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Rangordna nedanstÄende aminosyror efter stigande polaritet (2p)
+kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2023-12-18
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vilka tvÄ av följande faktorer stimulerar glykogenes (syntes av glykogen) i en skelettmuskelcell? (2p)
+C och D
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-05-15
frÄga: 28
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Du jobbar pÄ ett labb över sommaren och har fÄtt i uppgift att göra en rening av ett protein med hjÀlp av affinitetskromatografi.
+A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med hjÀlp av affinitetskromatografi.
+B) Ange en metod för att analysera storleken pÄ ditt framrenade protein och ge en kortfattad förklaring till hur denna fungerar.
+(4p) (Max 200 ord.)
3 av 4 poÀng: +A) Affinitetskromatografi Àr rening baserad pÄ egenskaper hos proteinet. Ett exempel Àr att man kan sÀtta pÄ 6 stycken histidin pÄ proteinet pÄ DNA nivÄ, sk 6xHis. Histidin har en hög affinitet för nickeljoner som man kan lÀgga i kolonnen. NÀr man hÀller ner proteinblandningen kommer histidin att binda till nickeljonerna vilket gör att proteinet stannar i kolonnen. För att sedan fÄ proteinet att slÀppa kan man anvÀnda sig av imidazol som har Ànnu högre affinitet för nickeljonerna för att eleduera ut proteinet.
+B) Man kan anvÀnda sig av SDS-Page. DÄ utsÀtter man proteinet för SDS molekyler som kommer att binda in till det. SDS molekylerna Àr negativt laddade och ju större protein, ju fler SDS molekyler kommer binda in, ju mer negativt laddat blir det. Sedan anvÀnder man sig av gelelektrofores (Page) för att fÄ proteinet att röra pÄ sig i ett elektromagnetiskt fÀlt. Större protein kommer röra sig lÄngsammare medan snabbare rör sig fortare. DVS Störst, sist.
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2024-05-15
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"En Àndring i entropi kan vara den huvudsakliga drivkraften för en reaktion. NÀmn tvÄ sÀtt att Àndra entropin i biokemiska reaktioner. Förklara med exempel. (4p) (Max 150 ord.)
";"3 av 4:
+Entropi Àr ett mÄtt pÄ oordning.
+Enligt deltaG= deltaH - T * deltaS. Vilket betyder att förÀndring i S/entropi kan man fÄ utifrÄn (deltaH - deltaG)/T.
+AlltsÄ kan man Àndra entropin genom att Àndra temperaturen. DÄ temperatur Àr mÄtt pÄ vÀrmeenergi. Högre temperatur betyder mer oordning.
+Man kan Àndra entropin genom att katalysera en reaktion med ett enzym. Enzymet minskar aktiveringsenergin som behövs för att reaktionen ska se.
kategory: termodynamik
prov: 2024-05-15
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Rangordna nedanstÄende bindningstyper frÄn den svagaste till den starkaste. (2p)
+Svagast â Starkast:
+(svar angivet i drag-och-slÀpp-formulÀr)
+TotalpoÀng: 2
+ +kategory: kemiska-bindingar
prov: 2024-05-15
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kemiska-bindingar" +"Ett enzym uppvisar Michaelis-Mentens kinetik.
+A) Redogör för hur man i ett V mot [S] diagram kan avlÀsa de tvÄ konstanterna Km och Vmax.
+B) Förklara vad som hÀnder med Km respektive Vmax om man tillsÀtter en icke-kompetitiv hÀmmare?
+(4p) (Max 150 ord.)
A) Vmax kan avlÀsas som det y-vÀrde pÄ grafen som fÄs dÄ substratoncentrationen gÄr mot oÀndligheten dvs det y-vÀrde som fÄs nÀr grafen planar ut allt eftersom substratkoncentrationen ökar.
+Km kan avlÀsas som det x-vÀrde som grafen antar dÄ grafens y-vÀrde Àr halva Vmax dvs hÀlften av grafens maxvÀrde.
+B) Det som sker Àr att Vmax kommer minska eftersom en icke-kompetitiv hÀmmare binder allostert till enzymet oavsett om substrat bundit eller ej och genför en konformationsÀndring i enzymet som gör att enzymet fÄr sÀmre katalytisk förmÄga dvs Vmax sÀnks. DÀremot kommer Km att vara oförÀndrat dÄ inhibitorn Àr oberoende av substratkoncentrationen eftersom den binder till enzymet oavsett om substrat finns och oavsett hur mycket/lite substrat som finns.
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-05-15
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till glykogenmetabolismen Àr korrekta? (2p)
+A och B
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-05-15
frÄga: 29
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"How does the partial pressure of oxygen influence binding and release of oxygen to/from hemoglobin? (4p)
+OBS! This question needs to be answered in English. (Max. 100 words).
If the partial pressure is high it means that there is a high concentration of oxygen in the area which will increase the chance of oxygen binding to the hemoglobin. Once one oxygen has binded to the hemoglobin, the affinity for oxygen increases in its subunits. This occurs in the lungs, where the concentration of oxygen is very high.
+On the other hand, in the tissues where oxygen is needed, the partial pressure of oxygen is low which will lead to oxygen being released from the hemoglobin. Leading to the hemoglobin going inte T-state which facilitates oxygen release.
kategory: hemoglobin
prov: 2024-05-15
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Det finns tre olika typer av integrala cellmembranproteiner. Vilka? Beskriv kortfattat hur de Àr uppbyggda. (4p)
";"Alfa-helixar, dessa Àr vanliga alfahelixar som bildar en tunnel dÄ hydrofob R-grupp Àr riktad utÄt.
+Beta barrels, flera stycken antiparallella Beta flak som bildar en stor tunnel, likt en tunna. DÀrifrÄn namnet.
+Partiellt integrerade, dessa Àr alfahelixar som sitter bland de hydrofoba svansarna i membranet och sticker ut frÄn membranet. Kan finnas pÄ bÄda sidorna av membranet.
kategory: cellmembran
prov: 2024-05-15
frÄga: 16
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende molekyler Àr mest reducerade? (2p)
+B & C
+ +kategory: glykolysen
prov: 2024-05-15
frÄga: 22
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Vilken molekyl utgör substratet som gÄr in i pentosfosfatvÀgens oxidativa fas och vilka tre olika slutprodukter bildas i denna fas? (2p) Max 20 ord.
";"1.5 av 2:
+Glukos-6-fosfat gÄr in i pentosfosfatvÀgen.
+I den oxidativa fasen bildas NADPH, Ribulose-5-fosfat och Ribos-5-fosfat.
kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2024-05-15
frÄga: 32
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende enzymer katalyserar en reaktion dÀr det sker en dekarboxylering? (2p)
+B och C
+ +kategory: citronsyracykeln
prov: 2024-05-15
frÄga: 26
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Lac-operonet kodar för genprodukter som behövs för att bryta ner laktos. Vilka tvÄ pÄstÄenden om lac-operonet stÀmmer? (2p)
+B och D
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2024-05-15
frÄga: 12
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"I vilken ordning genomförs stegen nedan nÀr en gen ska amplifieras med rekombinant DNA-teknologi? (2p)
+kategory: rekombinant-dna-teknik
prov: 2024-05-15
frÄga: 36
";"rekombinant-dna-teknik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rekombinant-dna-teknik" +"I elektrontransportkedjan förflyttas elektroner mellan olika komponenter. Redogör för tvÄ förutsÀttningar för att förflyttningen ska fungera. (4p) (Max 80 ord.)
";"Redoxpotentialen mÄste vara högre hos den som tar emot elektronen. Tex nÀr FMNH2 lÀmnar över elektronerna till Q. Det fungerar dÄ Q har en högre redoxpotential Àn FMNH2. Det Àr viktigt att pÄpeka att de olika komponenterna mÄste vara tillrÀckligt nÀra varandra ocksÄ för att plocka upp elektronerna.
+Det mÄste ocksÄ finnas en molekyl som tillslut plockar upp elektronerna, denna Àr O2. Syre kommet plocka upp elektronerna och reagera med protoner för att bilda vatten.
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-05-15
frÄga: 27
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Beskriv nukleosomens (Nucleosome core particle) uppbyggnad. Ange vilka komponenter som ingÄr och hur de Àr organiserade. (4p)
";"Nukleosomen bestÄr av en kÀrna (en oktamer) pÄ 8 histoner (2st H2A, 2st H2B, 2st H3, 2st H4). Den har ocksÄ 146 baspar DNA som Àr lindat 1,75 varv runt oktameren. Dessutom ligger histonen H1 (som inte Àr lika konserverad som övriga ovannÀmda histoner) utanpÄ kÀrnan och binder till linker DNA (DNAt mellan nukelosomerna) och stabiliserar nukleosomen. H3 och H4 har Àven N-terminala svansar som ligger runt DNAt som Àr lindat runt oktameren och reglerar DNAts packning till nukleosomkÀrnan.
+ +kategory: kromatin
prov: 2024-05-15
frÄga: 13
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Proteinet pÄ bilden utför transport.
+![[Pasted image 20251129235458.png]]
+A) Ange vilken grupp av transportörer proteinet tillhör och vad som karaktÀriserar denna grupp av transportörer?
+B) I vilket av cellens membran finns transportören?
+C) Vad driver transporten?
+(4p) Max 40 ord.
A) Antiport som Àr en aktiv transportör av 2 olika föreningar som transporteras Ät olika hÄll (en in och en ut) B) I mitokondriets inre membran +C) Den elektrokemiska gradienten av vÀtejoner mellan MMU och matrix.
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-05-15
frÄga: 17
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"En morgon nÀr du var sen blev du tvungen att springa för att hinna med spÄrvagnen. Efter ett tag smÀrtade lÄrmusklerna och kort dÀrefter blev de stumma. Förklara vad som har hÀnt metaboliskt pÄ molekylÀr nivÄ och varför det har intrÀffat. (4p) (Max 100 ord.)
";"Det har skett dÄ man har sprungit, en snabb explosiv aktivitet, sÄ har lite syre blivit upptagit. Detta har lett till att glykolysen som skett i musklerna har skett i anaeroba förhÄllanden. Detta har lett till att pyruvat som Àr slutprodukten i glykolysen, har reagerat med NADH (som behöver slÀppa av elektronerna till syret i elektrontransportkedjan vid aeroba förhÄllanden) som bildats tidigare i processen, katalyserat av laktatdehydrogenas för att bilda laktat, sÄ NAD+ kan Äterbildas. Laktat i sin tur har sÀnkt pH:t i musklerna vilket har lett till smÀrtan. Laktatet kommer sedan transporteras till levern för att omvandlas till glukos.
+ +kategory: glykolysen
prov: 2024-05-15
frÄga: 23
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"Beskriv schematiskt hur nedbrytningen och utsöndringen av heme gÄr till, samt ange i vilka organ/vÀvnader de olika stegen sker. (4p)
";"Erytrocyter bryts ned i mjÀlten. FrÄn erytrocyterna kommer hemoglobin att frislÀppas. Hemoglobinet bryts ned till fria aminosyror och heme. Heme kommer att brytas ned till biliverdin som kommer att omvandlas till bilirubin. Bilirubin Àr okonjugerat dvs fettlöslig och ej vattenlöslig, dÀrför kommer det transporteras till levern med hjÀlp av albumin. I levern kommer bilirubin att konjugera genom att bindas med gluturonsyra vilket kommer att göra den amfipatisk och vattenlöslig. Det konjugerade bilirubinet kommer sedan utsöndras frÄn levern med gallan till tarmarna. DÀr det sedan kan utsöndras genom avföring.
+ +kategory: heme
prov: 2024-05-15
frÄga: 33
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Para ihop nedanstÄende metaboliter med en metabol vÀg dÀr de ingÄr. Varje metabolit fÄr enbart anvÀndas en gÄng. (2p)
+Metaboliter:
+VĂ€gar:
+kategory: glukoneogenes
prov: 2024-05-15
frÄga: 24
";"glukoneogenes";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::glukoneogenes" +"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonâCrick helix. Vilka tvĂ„ pĂ„stĂ„enden Ă€r korrekta? (2p)
+C och D
+ +kategory: nukleotider
prov: 2024-05-15
frÄga: 10
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Initiering av eukaryot DNA-replikation Àr en noggrant reglerad process.
+A) I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin.
+B) I vilken fas av cellcykeln binder Cdc45 och GINS till MCM-helikaset?
+C) Vad heter det proteinkomplex som Àr bundet till replikationsorigin under hela cellcykeln?
+D) Vad gör CMG-helikaset nÀr DNA-replikationen skall initieras?
+(4p) (Max 15 ord.)
A) G-fasen.
+B) S1-fasen.
+C) ORC, origin recognition complex.
+D) SmÀlter DNA-strÀngarna, dvs separerar dem.
kategory: dna-replikation
prov: 2024-05-15
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden stÀmmer för kolesterolets omsÀttning och funktion i kroppen? (2p)
+B och C
+ +kategory: kolesterol
prov: 2024-05-15
frÄga: 34
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Vilken roll har fMet (N-formylmetionin) i initiering av translation? Beskriv kortfattat translationens initieringsprocess dÀr fMet anvÀnds. (4p) (Max 150 ord.)
";"fMet finns enbart i prokaryoter. I eukaryota celler anvÀnds istÀllet Met.
+I prokaryot translation sÄ initieras den genom att IF1 hittar en Shine-Delgarno sekvens, dÀr binder sedan den lila ribosomala enheten in och letar tills ett AUG (startkodon) hittas. Denna startkodon kodar för aminosyran fMet som kommer bindas in dÄ den sitter bundet till en tRNA-molekyl. tRNA:t binds in med hjÀlp av IF2 och sedan kommer den stora ribosomala enheten att binda in med hjÀlp av GTP. AlltsÄ Àr fMet den första aminosyran som binder in, till startkodonet, i prokaryot translation.
kategory: translation
prov: 2024-05-15
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::translation" +"Om âG°Ž för reaktionen A â B Ă€r -40 kJ/mol under standardförhĂ„llanden sÄ⊠(2p)
+VÀlj de tvÄ korrekta alternativen:
+B och C
+ +kategory: termodynamik
prov: 2024-05-15
frÄga: 20
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Allopurinol Àr en sÄ kallad hypoxantinanalog som inhiberar nedbrytning av purin-nukleotider till urat. Vilket enzym hÀmmar denna lÀkemedelssubstans och vid vilken sjukdom anvÀnds allopurinol som lÀkemedel? (2p) (Max 20 ord.)
";"Allopurinol hÀmmar enzymet xantinoxidas.
+Detta anvÀnds vid sjukdomen gikt som beror pÄ ökad uratnivÄ i kroppen.
kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2024-05-15
frÄga: 30
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Vilka Àr det tvÄ viktigaste principerna bakom evolutionen? Beskriv med ett valfritt exempel hur dessa tvÄ principer Àr viktiga för att möjliggöra uppkomsten av nya arter/fenotyper/funktioner. (4p) (Max 150 ord.)
";"Variation: Att det ska finnas ett brett urval av olika gener i en population. Detta stora urvalet leder till att olika individer inom samma art Àr olika bra anpassade. Tex om en individ frÄn en art som i vanliga fall bara klarar varmare omrÄden, fÄr en gen som leder till att den klarar av kyla bÀttre, dÄ kommer denna individ kunna migrera till kallare omrÄden, eller överleva ifall kallare tider kommer. Detta gör att tvÄ individer frÄn samma art kan utvecklas ivÀg frÄn varandra, en i det varmare och en i det kallare.
+Naturligt urval/Survival of the fittest: Den sÀger att den som Àr best anpassad överlever. Samma exempel. Ifall en lÀngre isperiod skulle börja sÄ kommer de som har bÀst kan anpassa sig, tex som att de kan vÀxa extra mycket pÀls för att hÄlla inne vÀrmen, kommer överleva medan de som ej kan anpassa sig kommer dö.
kategory: evolution
prov: 2024-05-15
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Förklara vad ett kinas gör. (2p) (Max 20 ord.)
";"Ett kinas katalyserar en reaktion dÀr en fosfatgrupp sÀtts pÄ ett substrat. Tex hexokinas som sÀtter pÄ fosfat pÄ glukos.
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-05-15
frÄga: 21
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Till vilka aminosyror kan nedanstÄende tvÄ alfa-ketosyror omvandlas i ett steg via transamineringsreaktioner? Ange Àven det fullstÀndiga namnet pÄ enzymet som katalyserar bildningen av respektive aminosyra.
+A) pyruvat
+B) oxalacetat
+(4p) (Max 20 ord.)
A) Pyruvat kan omvandlas till alanin mha enzymet alaninaminotransferas.
+B) Oxalacetat kan omvandlas till aspartat mha enzymet aspartataminotransferas.
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2024-05-15
frÄga: 31
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Pyruvatdehydrogenaskomplexet spelar en central roll i metabolismen och Àr dÀrmed reglerat pÄ flera nivÄer. En typ av reglering av komplexet sker via fosforylering.
+A) Varför Àr det viktigt att komplexet Àr reglerat?
+B) Vad hÀnder med komplexets aktivitet nÀr det fosforyleras?
+C) Redogör för hur energikvoten pÄverkar fosforyleringen av komplexet.
+(4p) (Max 100 ord)
A) PDH-komplexet katalyserar omvandlingen av pyruvat till Acetyl-CoA, detta Àr mellansteget mellan glykolys och citronsyracykeln. Det Àr viktigt det regleras sÄ rÀtt mÀngd energi utvinns. SÄ att vi inte genererar ATP nÀr vi ej behöver, tillexempel glukoneogenesen behövs sÀttas igÄng sÄ vi kan omvandla pyruvat till glukos eller sÄ att det istÀllet lagras i kroppen.
+B) Komplexet kommer inhiberas vid fosforylering.
+C) Ifall energikvoten Àr hög, dvs mycket ATP finns kommer det att kunna hÀmma komplexet dÄ fosforyleringen av komplexet krÀver ATP. DÄ en fosfatgrupp kommer sÀttas pÄ komplexet. Ifall hög mÀngd ADP finns kommer det ej att fosforylera komplexet.
kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2024-05-15
frÄga: 25
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription samverkar flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka tvÄ pÄstÄenden om denna process stÀmmer? (2p)
+A och D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2024-05-15
frÄga: 11
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Nukleotider bygger upp RNA och DNA.
+A) Vilken kemisk grupp finns i 2â-positionen hos ribonukleotider?
+B) I vilken position pÄ sockret sitter kvÀvebasen?
+C) I vilken position pÄ sockret sitter fosfatgruppen?
+D) Vad Àr dGDP förkortning för?
+(4p)
A) Hydroxylgrupp (OH-grupp) +B) PĂ„ 1'-kolet +C) PĂ„ 5'-kolet +D) Deoxyguanosin 5'-difosfat
+ +kategory: nukleotider
prov: 2024-05-15
frÄga: 8
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::nukleotider" +"Du befinner dig i labsalen nĂ€r det plötsligt börjar brinna i en bĂ€gare med etanol. Efter att ha uppmĂ€rksammat de övriga i labbet pĂ„ branden och konstaterat att den Ă€r begrĂ€nsad bestĂ€mmer du dig för att slĂ€cka den. PĂ„ labbet hittar du brandslĂ€ckare för brĂ€nder av klass AâC.
+A) Vad avses med brÀnder klass A, B och C?
+B) Förklara vilken klass av brand som har uppstÄtt.
+(4p) Max 80 ord.
3 av 4: +A= brand i textilier/trÀ +B=brand i vÀtskor/alkoholer +C=brand i gaser
+Det Àr en typ B brand som uppstÄtt dÄ etanol Àr en alkohol.
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2024-05-15
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden stÀmmer för proteiners sekundÀrstruktur? (2p)
+(svar angivet i flervalsformulÀr)
+TotalpoÀng: 2
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-05-15
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Laktosintolerans och galaktosemi: ge ett exempel pÄ vad som Àr gemensamt för dessa tillstÄnd och ett exempel pÄ vad som skiljer dem Ät. (4p) (Max 200 ord.)
";"Gemensamt: BÄda tvÄ sjukdomar beror pÄ brist pÄ funktion eller brist pÄ respektive enzym som bryter ned laktos respektive galaktos.
+Skillnad: Laktosintolerans Àr brist pÄ enzymet laktas som bryter ned laktos till galaktos och glukos, det leder till att kroppen ej bryter ned laktos i GI-kanalen, detta leder till att laktos kommer hamna i tarmarna dÀr det kan jÀsa vilket leder till magsmÀrtor, diarré och gasbildning.
+Galaktosemi beror pÄ bristande funktion eller brist pÄ enzymerna (en av dem Àr GALT) som omvandlar galaktos till glukos. Galaktos kan ta upp av tarmcellerna tillskillnad frÄn laktos. Detta leder till ökad nivÄ av galaktos i plasman, galaktos blir till galaktilol som Àr ett toxiskt Àmne. Detta kan leda till neurologisk skador och i vÀrsta fall död.
+AlltsÄ Àr skillnaden vart de kommer ansamlas och pÄverkan pÄ kroppen.
kategory: kolhydrater
prov: 2024-05-15
frÄga: 7
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kolhydrater" +"Du Ă€r lĂ€kare pĂ„ en vĂ„rdcentral och en patient har frĂ„gor om de prover som du just ordinerat i en âlipidstatusâ. Du tar hjĂ€lp av en ritning du lĂ€rde dig göra nĂ€r du lĂ€ste biokemi under din grundutbildning för att börja svara pĂ„ frĂ„gan.
+A) Rita den principiella strukturen för den molekyl som framför allt anvÀnds för att lagra energi i kroppen.
+B) Vilken sorts lipoprotein skickar levern ut i blodet för att transportera energilagringsmolekylen till resten av kroppens celler? 1 ord rÀcker som svar.
+(4p)
A) Triacylglycerol (TAG).
+B) VLDL.
![[Pasted image 20251129235437.png]]
+(Ritning pÄ TAG-struktur finns pÄ sida 11 i original-PDF.)
+ +kategory: lipider
prov: 2024-05-15
frÄga: 6
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"PÄ bilden visas en tripeptid.
+![[Pasted image 20251129235411.png]]
+A) Ange vilken aminosyra som finns pÄ C-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har.
+B) Ange vilken aminosyra som finns pÄ N-terminalen, vilken grupp aminosyror den tillhör och en egenskap den har.
+(4p) (Max 25 ord.)
A) Asparginsyra, en syra. Kan binda mha elektrostatiska interaktioner dÄ den Àr negativt laddad.
+B) Glycin, en alifatisk aminosyra. OpolÀr.
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-05-15
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"I elektrontransportkedjan pumpas protoner nÀr elektroner förflyttas mellan olika komponenter.
+A) Var i elektrontransportkedjan pumpas protoner?
+B) Vilken Àr drivkraften bakom protonpumpningen?
+Max 50 ord.
A) I komplex I, III och IV
+B) I elektrontransportkedjans komplex flyttas elektroner frÄn komponenter med lÀgre redoxpotential till komponenter med högre. Detta Àr en energimÀssigt gynnsam process och energin kan dÄ utnyttjas för att pumpa protoner frÄn matrix till mellanmembransutrymmet mot gradienten. Energin omvandlas dÄ till elektrokemisk energi.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2022-12-19
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Du jobbar pÄ labb över sommaren och har fÄtt i uppgift att köra affinitetskromatografi med en 6xHis-tag.
+A) Beskriv kortfattat principen för affinitetskromatografi.
+B) Hur kan man eluera proteinet?
+C) Ange en metod som kan anvÀndas för analys av det eluerade proteinet.
+Max 200 ord.
A) Affinitetskromatografi Àr en kromatografimetod som bygger pÄ att separera proteiner baserat pÄ en viss egeskap. Exempelvis kan glykosylerade proteiner separeras ut genom att kulorna i kolonnen har molekyler som binder till sockerenheterna. Man kan Àven, som i detta fall, modifiera DNA-sekvensen för proteinet man Àr ute efter genom att lÀgga till en tag av histidin vilken binder vÀl till nickeljoner pÄ kulorna.
+B) För att fÄ proteinet att lossna frÄn kulorna krÀvs att man eluerar. Det kan ske med hjÀlp av en stark buffert eller saltlösning, ofta en kombination av bÄda.
+C) Gelelektrofores, SDS-PAGE, kan anvÀndas för att analysera proteinets storlek samt hur vÀl proteinreningen lyckats.
+ +kategory: utforska-proteiner
prov: 2022-12-19
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Diffusion Àr en viktig process för att fördela molekyler i gaser och vÀtskor. Vad beror den pÄ och vilken termodynamisk drivkraft finns bakom den?
";"1.5p
+Diffusion beror pÄ att det finns mÄnga fler sÀtt för ett Àmne i en vÀtska eller gas att vara oordnat Àn ordnat, alltsÄ Àr sannolikheten för ett oordnat tillstÄnd större och molekylerna kommer dÄ till följd av sin konstanta rörelse att hamna i ett oordnat tillstÄnd. Den termodynamiska drivkraften bakom diffusion Àr sÄledes termodynamikens andra lag, att ett system tenderar att gÄ mot mer oordnade tillstÄnd, alltsÄ att entropin ökar.
+2.0p
+Brownsk rörelse (stavning?) innebĂ€r att en liten molekyl har större sannolikhet att inte stöta pĂ„ nĂ„got (annan molekyl) pĂ„ ena sidan Ă€n andra. Det leder till att molekyler rör sig mot dĂ€r det Ă€r mindre molekyl-tĂ€tt, och sĂ„ledes sprids Ă€mnet jĂ€mt. Ămnet vill fördela sig, eftersom att ha det ordnat = lĂ„g entropi => ofördelaktigt (om molekylen Ă€r löslig i sin omgiving, om olja i vatten Ă€r det mer fördelaktigt att oljan Ă€r samlad i en stor klump)
+ +kategory: termodynamik
prov: 2022-12-19
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Rangordna nedanstÄende bindningstyper frÄn den svagaste till den starkaste.
+kategory: kemiska-bindingar
prov: 2022-12-19
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kemiska-bindingar" +"Vilka pÄstÄenden om övergÄngstillstÄndet för en enzym-katalyserad reaktion stÀmmer?
+RĂ€tt svar +1. C +2. D
+ +kategory: enzymer
prov: 2022-12-19
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"I aerob katabolism kommer glukos att passera ett flertal steg innan det oxideras fullstÀndigt. I vilken ordning kommer följande enzym i den processen?
+kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-12-19
frÄga: 29
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::integrering-av-metabolismen" +"Hemoglobin och myoglobin innehĂ„ller den prostetiska gruppen heme. Denna innehĂ„ller ett jĂ€rn (FeÂČâș) som ansvarar för inbindningen av syremolekyler. Beskriv varför bindning till syre pĂ„verkar hemoglobinets struktur och hur det i sin tur pĂ„verkar hemoglobinets syreaffinitet.
+Max 70 ord.
JÀrnatomens storlek gör att den inte fÄr plats i mitten av hemegruppen. NÀr syre binder in blir jÀrnets atommoln mindre och kan sÄledes flyttas upp 0,4 à in i hemeplanet. DÄ kommer Àven det proximala histidinet kopplat till jÀrnet att flyttas upp samt den alfahelix den Àr kopplad till. Det pÄverkar strukturen pÄ hemoglobinet dÀr subenheterna totalt kommer vridas upp 15 grader till R-state med ökad affinitet för syre.
+ +kategory: hemoglobin
prov: 2022-12-19
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vilka pÄstÄenden om det eukaryota cellmembranet Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. A +2. C
+ +kategory: cellmembran
prov: 2022-12-19
frÄga: 16
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::cellmembran" +"Ett enzym uppvisar MichaelisâMenten-kinetik. Behöver du kĂ€nna till den totala enzymkoncentrationen för att bestĂ€mma konstanterna (i) Kâ, (ii) Vmax eller (iii) kcat? Motivera ditt svar.
+![[Pasted image 20251128085625.png]]
";"Vmax motsvarar den maximala reaktionshastighet som Ă€r möjlig för en enzymkatalyserad reaktion och uppnĂ„s dĂ„ alla enzym Ă€r bundna i enzym-substratkomplex. Vmax beror alltsĂ„ av enzymkoncentratonen. Kâ motsvarar den substratkoncentration dĂ„ V = Vmax/2, alltsĂ„ nĂ€r hĂ€lften av enzymen har bundit substratet och Ă€r upptagna med katalys.
+Kâ och Vmax kan bestĂ€mmas experimentellt för en reaktion genom att mĂ€ta den initiella reaktionshastigheten för varierande substratkoncentrationer men med samma enzymkoncentration. VĂ€rdena förs in i ett diagram dĂ€r reaktionshastigheten blir en funktion av substratkoncentrationen (se nedan). NĂ€r substratkoncentrationen gĂ„r mot oĂ€ndligheten kommer dĂ„ V gĂ„ mot Vmax och man kan dĂ„ matematiskt bestĂ€mma Vmax utan att kĂ€nna till den exakta enzymkoncentrationen. Kâ kan sedan bestĂ€mmas utifrĂ„n vid vilken substratkoncentration som V = Vmax/2.
+kcat Àr ett mÄtt pÄ hur mÄnga molekyler produkt som bildas per sekund och enzym, turnover number, och rÀknas sÄledes fram ur den maximala reaktionshastigheten dividerat med den totala enzymkoncentrationen. För att bestÀmma kcat krÀvs alltsÄ att kÀnna till den maximala enzymkoncentrationen.
+ +kategory: enzymer
prov: 2022-12-19
frÄga: 22
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till pentosfosfatvÀgen Àr korrekta?
+RĂ€tt svar
";"A och D
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2022-12-19
frÄga: 32
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"A) Vilka tvÄ enzymer hjÀlps Ät att Äteruppbygga en delvis nedbruten glykogenpartikel genom att addera nya glukosenheter till strukturen?
+B) Vilken typ av bindning skapar respektive enzym?
A) En delvis nedbruten glykogenpartikel har redan en primer i form av glykogenin, alltsÄ behöver bara kedjorna elongeras och förgreningar bildas. Glykogensyntas kommer att förlÀnga kedjorna genom att addera glukosenheter medan branching enzyme kommer skapa förgreningar genom att flytta 7 glukosenheter.
+B) Glykogensyntas â alfa 1â4 glykosidbindning
+Branching enzyme â alfa 1â6 glykosidbindning
kategory: glykogen
prov: 2022-12-19
frÄga: 26
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Vilka tvÄ av följande alternativ beskriver funktioner för poly-A-svansen i 3'-Ànden pÄ eukaryot mRNA?
+RĂ€tt svar +1. C +2. D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-12-19
frÄga: 12
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"A) Vilka molekyler av betydelse för energiomvandling bildas i ett varv i citronsyracykeln?
+B) Varför Àr citronsyracykeln inte aktiv i frÄnvaro av syre?
+Max 50 ord.
A) 3 NADH och 1 FADHâ
+B) För att citronsyracykeln ska ske krĂ€vs att det finns mitokondriellt NADâș och FAD. Utan syre avstannar elektrontransportkedjan dĂ„ syre behövs i komplex IV och dĂ€rmed kan inte NADH och FADHâ oxideras vilket Ă€r det enda sĂ€ttet att Ă„terbilda NADâș och FAD i mitokondriens matrix.
+ +kategory: citronsyracykeln
prov: 2022-12-19
frÄga: 27
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Vid initiering av RNA polymeras II-beroende transkription ingÄr flera basala transkriptionsfaktorer. Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. A +2. D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2022-12-19
frÄga: 13
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Proteinet pÄ bilden förflyttas till plasmamembranet hos skelettmuskler som ett svar pÄ insulinsignalering.
+A) Vilken Àr transportören?
+B) Vilken typ av transport sker?
+C) Vad hÀnder med glukos nÀr den kommit in i cellen och varför?
+Max 50 ord.
+![[Pasted image 20251128085555.png]]
A) GLUT-4
+B) Faciliterad diffusion
+C) Den kommer genom enzymet Hexokinas och förbrukning av 1 ATP bilda glukos 6-fosfat. Fosforyleringen gör att bÀrarproteinet inte lÀngre kÀnner igen glukosmolekylen och dÀrmed kan den inte transporteras ut igen utan kommer, beroende pÄ energikvoten, brytas ned i glykolysen eller anvÀndas för uppbyggnad av glykogen.
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2022-12-19
frÄga: 17
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::transport-över-cellmembran" +"Vad har molekylerna NADH, ATP, CoA och FADHâ gemensamt?
+A och D
+ +kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2022-12-19
frÄga: 23
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Vilka av följande pÄstÄenden Àr korrekta avseende reglering av den intracellulÀra kolesterolhalten?
+RĂ€tt svar
";"A och C
+ +kategory: kolesterol
prov: 2022-12-19
frÄga: 33
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Det pyruvat som bildas vid anaerob glykolys behöver metaboliseras vidare.
+A) Vad bildas av pyruvatet?
+B) Vilken Àr orsaken till det?
+C) Vilket enzym katalyserar reaktionen?
+Max 50 ord.
A) Laktat
+B) Cellen behöver Ă„terbilda NADâș i cytoplasman för att inte glykolysen ska avstanna dĂ„ det krĂ€vs i steg 6. Vid anaerob glykolys sker detta genom fermentering dĂ€r pyruvat reduceras till laktat och NADH oxideras till NADâș.
+C) Laktatdehydrogenas
+ +kategory: glykolysen
prov: 2022-12-19
frÄga: 24
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::glykolysen" +"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonâCrick-helix. Vilka tvĂ„ pĂ„stĂ„enden stĂ€mmer?
+RĂ€tt svar +1. A +2. C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2022-12-19
frÄga: 10
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"A) Vilken roll spelar PCNA vid den eukaryota replikationsgaffeln?
+B) Vilken form har denna faktor?
A) PCNA, eller sliding clamp som den ocksÄ kallas, har funktionen att den sitter runt en av DNA-strÀngarna under replikation och hÄller fast DNA-polymeras pÄ strÀngen. Det gör att processiviteten ökar upp till 50 gÄnger jÀmfört med utan PCNA dÄ DNA-polymeras kan syntetisera lÄnga strÀckor DNA utan att ramla av.
+B) Ringformad
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2022-12-19
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"Beskriv vad som karaktÀriserar plasmider med konformationen supercoiled respektive relaxerad cirkulÀr, hur de bildas och hur de kan skiljas Ät med gelelektrofores. Den hÀr frÄgan kan besvaras pÄ svenska eller engelska i tabellform eller i fritext. Max 75 ord.
";"I supercoiled kommer DNAt i plasmiden vara överdrivet tvinnat, sÄ kallat supercoiled med högre linkingnumber Àn normalt. DÀrmed kommer det bildas en linjÀr struktur. I relaxerad cirkulÀr Àr plasmiden istÀllet ringformat. De tvÄ olika konformationerna kommer möta olika stort motstÄnd av gelen under gelelektrofores till följd av att de har olika form och de kan sÄledes separeras baserat pÄ att de kommer fÀrdas olika lÄngt. +![[Pasted image 20251128085752.png]]
+ +kategory: plasmid
prov: 2022-12-19
frÄga: 34
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Beskriv sekundÀrstrukturen hos molekylen som transporterar aminosyror till ribosomen och förklara vilken funktionen Àr för varje del av strukturen. Rita gÀrna. +![[Pasted image 20251128085533.png]]
";"Strukturen som transporterar aminosyror till ribosomen kallas tRNA och byggs upp av RNA. I 2D, sekundÀrstruktur, Àr tRNA klöverformad och stabiliseras av vÀtebindningar mellan komplementÀra baspar i RNA kedjan. Den nedersta loopen, Antikodon loopen, innehÄller ett antikodon pÄ tre baser som Àr komplementÀrt till kodonet pÄ mRNA och dÀrmed aggerar som mellanhand mellan kodon och aminosyra vilket möjliggör för den genetiska koden. De andra tvÄ looparna spelar roll för interaktioner med exempelvis aminoacyl-tRNA syntetaser som kopplar ihop rÀtt aminosyra med rÀtt tRNA. De bidrar alltsÄ till identifiering av det specifika tRNA:t. 5'-Ànden av tRNA kedjan Àr fosforylerad och i 3'-Ànden sitter en CCA-sekvens, sÄ kallad acceptor stem. Till den fria OH-gruppen pÄ 3'-Ànden av adenosin i acceptor stem kopplas aminosyran av aminoacyl-tRNA syntetaser.
+ +kategory: translation
prov: 2022-12-19
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Redogör för hur heme bryts ner och utsöndras. (2p)
";"Heme bryts ner i mjÀlten nÀr röda blodkroppar bryts ner. Först bildas biliverdin som sedan omvandlas till bilirubin. DÄ bilirubin Àr en hydrofob molekyl kommer den att transporteras bunden till blodproteinet albumin via blodet till levern. I levern kommer bilirubinet konjugeras och dÄ bli amfipatiskt för att sedan utsöndras via gallan.
+ +kategory: heme
prov: 2022-12-19
frÄga: 20
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"NÀmn tvÄ aminosyror som genom transaminering kan omvandlas till citronsyracykelintermediÀrer vilket gör dem till glukogena aminosyror. Ange Àven vilken citronsyracykelintermediÀr respektive aminosyra bildar.
";"Glutamat kan omvandlas till alfaketoglutarat
+Aspartat kan omvandlas till oxalacetat
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2022-12-19
frÄga: 30
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"Cancerceller utvecklas frÄn normala celler. Beskriv hur man kan anvÀnda koncept frÄn evolutionen för att förstÄ hur detta gÄr till.
";"2.0p +Evolution beror pÄ variation och naturligt urval. Det sker mutationer ""ofta"", vilket ökar variationen inom en population. MÄnga gÄnger Àr mutationen som uppstÄr sÀmre och försvinner. Ibland Àr en mutation bra och den blir selekterad (survival of the fittest) och lever kvar inom en population (evolution) +Vid cancer sÄ sker likasÄ mutationer, det kan vara mutationer som stör delningsprocessen i en cell (sÄ att den ohÀmmat delar sig) eller mutationer som hÀmmar vÄrt immunsystem (vi kan ej bekÀmpa tumörer, p53). Cancerceller utvecklas alltsÄ frÄn vÄra egna celler (fast de Àr +muterade och orsakar sjukdom). Cancerceller genomgÄr ocksÄ mutationer. +""Vanligt"" Àr mutationer som stimulerar ohÀmmad delning och gör dem mer maligna. Cancerceller har en variation som gör dem ""starka"" och tar dÀrför över i kroppen.
+1.5p +Evolutionen utgÄr frÄn att det finns en genetisk variation och ett naturligt urval dÀr de egenskaper som gynnar överlevnad i den aktuella miljön kommer föras vidare till nÀsta generation i större utstrÀckning. Genetisk variation uppnÄs bland annat genom slumpmÀssiga spontana mutationer i DNA. Mutationer kan dÄ uppkomma i en cell som stÀnger av en tumörsupressorgen vilket dÄ Àr ""gynnsamt"" för den individuella cellen som kan fortsÀtta dela sig. Andra mutationer kan dÄ uppstÄ i en gen som kodar för reparation av DNA vilket möjliggör för ytterligare mutationer som aktiverar oncogener och stÀnger av andra tumörsupressorgener. Genom ett flertal steg dÀr mutationer möjliggör för cellen att dela sig oftare och för fler mutationer att uppstÄ kan sÄledes en cancertumör utvecklas ur en normal cell.
+ +kategory: evolution
prov: 2022-12-19
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka av följande Àr ketonkroppar?
+RĂ€tt svar
";"A och C
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2022-12-19
frÄga: 21
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till nukleotidnedbrytning Àr korrekta?
+RĂ€tt svar +1. B +2. C
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2022-12-19
frÄga: 31
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Vilka faktorer Àr viktiga för regleringen av fosfofruktokinas 2/fruktos 2,6-bisfosfatas?
+RĂ€tt svar +1. A +2. D
+ +kategory: glykolysen
prov: 2022-12-19
frÄga: 25
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"A) Var Äterfinns alfa-amanitin i naturen?
+B) Vilket enzym inhiberar denna substans?
A) I den lömska flugsvampen
+B) Substansen inhiberar RNA-polymeras II
kategory: rna-syntes
prov: 2022-12-19
frÄga: 11
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::rna-syntes" +"A) Vilken kemisk grupp finns i 2â-positionen hos ribonukleotider?
+B) Vad Àr AMP förkortning för?
A) Hydroxylgrupp (OH)
+B) Adenosinmonofosfat
kategory: nukleotider
prov: 2022-12-19
frÄga: 8
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Du arbetar pÄ en vÄrdcentral som specialistlÀkare. En försÀljare frÄn ett lÀkemedelsföretag Àr inbjuden för att presentera en ny medicin som pÄstÄs sÀnka kolesterolnivÄerna i blodet med 30%. Vilka tvÄ 95%:iga konfidensintervall (CI95%) stöder detta pÄstÄende i minst utstrÀckning?
+C och D
+ +kategory: introduktionslaboration
prov: 2022-12-19
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Nyligen har det konstaterats att sjukdomen ALS (amyotrofisk lateral skleros) karaktÀriseras av bildning av amyloider. Hur bildas de?
+Max 75 ord.
Amyloider bildas dÄ ett protein med alfahelixrik struktur övergÄr i en betaflaksrik struktur. Betaflaken kan sedan aggregeras och bilda lÄnga fibrer, sÄ kallade amyloider.
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-12-19
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Kolhydrater finns förutom i fri form Àven bundna till lipider och proteiner. Vilka Àr de tvÄ vanligaste typerna av bindningar mellan kolhydrater och proteiner? (2p)
";"O-link: kolhydraten binder till OH-gruppen i sidokedjan pÄ serin eller treonin i proteinet.
+N-link: kolhydraten binder till aminogruppen i en asparaginrests sidokedja i proteinet.
kategory: kolhydrater
prov: 2022-12-19
frÄga: 7
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"Namnge och rita:
+A) Den principiella strukturen för lipiden som lagrar energi i adipocyter.
+B) Strukturen för den vanligaste membranlipiden.
Se 2022-12-19-0097-TUX för 2/2
+ +kategory: lipider
prov: 2022-12-19
frÄga: 6
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"I metabolismen Àr det vanligt att enzymer regleras av cellens energikvot.
+A) NÀmn tvÄ aminosyror som kan interagera med olika delar hos de molekyler som dÄ fungerar som allosteriska regulatorer.
+B) Förklara vad som gör dessa aminosyror lÀmpliga för uppdraget.
+Max 75 ord.
A) Negativt laddad â lysin
+Som kan bilda vĂ€tebindningar â Asparagin
B) Vid allosterisk reglering av cellens energikvot kommer ATP respektive ADP/AMP binda in till enzymet. Fosfatgrupperna Àr negativt laddade vilket gör att de kan interaggera med positivt laddade sidokedjor som lysin genom jonbindningar. KvÀvebasen adenin som Àr en del av molekylerna kommer innehÄlla kvÀvegrupper som kan bilda vÀtebindningar med en aminosyra som har karbonyl, hydroxyl- eller aminogrupper, som asparagin med bÄde amino- och karbonylgrupp.
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2022-12-19
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vad menas med respirationskontroll? (1p) Max 25 ord.
";"Reglering av cellandningen, dvs bildningen av ATP genom oxidativ fosforylering. Drivs av elektrontransportkedjan och den elektrokemiska gradient som uppstÄr, och regleras av cellens energikvot.
+ +kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2023-05-15
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Du har fÄtt i uppgift att göra en proteinrening med hjÀlp av gelfiltrering samt att analysera resultatet av denna. (2p) Max 200 ord.
+A) Beskriv metoden för gelfiltrering.
+B) Vilken egenskap hos proteinet bygger metoden pÄ?
A) Gelfiltrering Àr en separationsmetod med avseende pÄ storlek. Man preparerar en kolonn med ""beads"", dvs porösa gelékulor. Detta utgör den fasta fasen. Sedan tillsÀtts en lösning med det protein man vill separera ut, detta kallas för den mobila fasen. NÀr den mobila fasen hÀlls till kolonnen kommer den att rinna igenom och elueras under kolonnen. Stora proteiner kommer att ta vÀgen förbi kulorna och dÀrmed komma ut först. De smÄ proteinerna kommer istÀllet att gÄ igenom de porösa kulorna. Detta tar lÀngre tid och de kommer dÀrför komma ut sist. Resultatet blir en separation med avseende pÄ storlek dÀr störst gÄr först.
+B) Separation med avseende pÄ storlek, dÀr störst gÄr först.
kategory: utforska-proteiner
prov: 2023-05-15
frÄga: 5
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"A) Redogör kort för vikten av jÀmviktskonstanten för biokemiska reaktioner.
+B) Hur Àr jÀmviktskonstanten definierad?
+(2p)
A) JÀmviktskonstanten K anger förhÄllandet mellan substrat/reaktant och produkt.
+Om K = 1 betyder det att systemet Àr i jÀmvikt, mÀngden reaktant Àr lika stor som mÀngden produkt.
+Om K > 1 finns mer produkt Àn reaktant.
+Om K < 1 finns mer reaktant Àn produkt.
+Detta kan visa Ät vilket hÄll en reaktion Àr förskjuten, och visar förhÄllandet mellan olika Àmnen i ett system. I cellen Àr ofta flera reaktioner kopplade eller sker som en kedjereaktion. Det innebÀr att det som Àr produkt i en reaktion gÄr vidare och utgör reaktant i en annan reaktion. Detta dynamiska samspel gör att jÀmviktskonstanten hela tiden kommer att förÀndras och gÄ Ät olika hÄll. Det Àr bra, vi vill inte ha jÀmvikt (K = 1) i cellerna eftersom det dÄ inte finns nÄgra gradienter eller nÄgon reaktionsbenÀgenhet, vilket skulle innebÀra att alla livsviktiga processer avstannar och vi skulle dö.
+B) K = [produkt]/[reaktant]
kategory: termodynamik
prov: 2023-05-15
frÄga: 18
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::termodynamik" +"Rita aminosyran serin, R = CHâOH, i S-konfiguration vid:
+A) pH 2
+B) pH 7
+C) pH 12
+(2p)
1.5 av 2
+Svar (text + ritning pÄ separat papper)
+A) Vid lĂ„gt pH finns mycket fria Hâș, aminogruppen kommer att vilja motverka pH-sĂ€nkningen och ta upp en Hâș och fĂ„r sĂ„ledes en positiv laddning.
+B) Vid neutralt pH kommer aminosyran vara en zwitterjon, dvs ha bÄde en positiv och en negativ laddning men ingen nettoladdning.
+C) Vid högt pH kommer karboxylgruppen vilja motverka detta genom att avge Hâș, dĂ€rav kommer denna att fĂ„ en negativ laddning.
![[Pasted image 20251129235001.png]]
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2023-05-15
frÄga: 1
";"frĂ„n-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::frĂ„n-aminosyror-till-proteiner" +"Ett enzym uppvisar MichaelisâMenten-kinetik.
+A) Hur kan man i ett V mot [S]-diagram avlĂ€sa de tvĂ„ konstanterna Kâ och Vmax?
+B) Förklara vad som hĂ€nder med Kâ respektive Vmax om man tillsĂ€tter en kompetitiv hĂ€mmare.
+(2p)
A) Om ett enzym uppvisar MichaelisâMenten-kinetik kommer vi i ett sĂ„dant diagram se en hyperbol kurva dĂ€r reaktionshastigheten ökar och gĂ„r mot den maximala reaktionshastigheten med ökningen av substratets koncentration. Varje reaktion har ett Vmax, det vill sĂ€ga den maximala hastighet en reaktion kan nĂ„ dĂ„ samtliga enzym Ă€r bundna till substratet. NĂ€r kurvan planar ut Ă€r V nĂ€ra Vmax och kommer mycket lĂ„ngsamt fortsĂ€tta gĂ„ mot Vmax med en ökande substratkoncentration. Kâ Ă€r den substratkoncentration för vilken reaktionshastigheten uppnĂ„r 1/2 Vmax. Kâ Ă€r alltsĂ„ den punkt pĂ„ kurvan dĂ€r V nĂ„r halva Vmax.
+B) En kompetitiv inhibitor kommer att binda till enzymets aktiva sĂ€te och hindra det tĂ€nkta substratet frĂ„n att binda in. Det uppstĂ„r alltsĂ„ konkurrens om att binda in till de enzym som finns. Detta innebĂ€r att enzymets affinitet för substratet minskar och det betyder att vi vid nĂ€rvaro av inhibitorn kommer att fĂ„ ett lĂ€gre Kâ-vĂ€rde Ă€n utan. Om substratet hinner binda enzymet innan inhibitorn gör det finns det inget som hindrar att den tĂ€nkta produkten bildas. Vmax kommer alltsĂ„ inte att förĂ€ndras, det kommer bara krĂ€vas en högre substratkoncentration för att lyckas konkurrera ut inhibitorn.
kategory: enzymer
prov: 2023-05-15
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"FrÄn vilka alfa-ketosyror kan aminosyrorna nedan bildas med hjÀlp av tvÄ kliniskt viktiga enzymer tillhörande gruppen aminotransferaser? Ange ocksÄ frÄn vilken metabol vÀg respektive alfa-ketosyra hÀmtas. (2p)
+A) Alanin
+B) Aspartat
A) Pyruvat â Alanin. Sker med hjĂ€lp av ALAT (alaninaminotransferas). Alfaketosyran Ă€r pyruvat och hĂ€mtas frĂ„n glykolysen.
+B) Oxaloacetat â Aspartat. Sker med hjĂ€lp av ASAT (aspartataminotransferas). Alfaketosyran Ă€r oxaloacetat och hĂ€mtas frĂ„n citronsyracykeln.
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2023-05-15
frÄga: 29
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"NÀmn de allosteriska regulatorerna för hemoglobin och ange om de höjer eller sÀnker hemoglobinets syreaffinitet. (2p) Max 25 ord.
";"1.5 av 2:
+COâ: bildar kolsyra & karbamatjoner, sĂ€nker pH.
+Hâș: interagerar med sidokedjor, uppstĂ„r jonbindningar.
+2,3-BPG: binder subenheterna, förhindrar konformationsÀndring.
+Samtliga stabiliserar T-state, sÀnker affiniteten för syre.
kategory: hemoglobin
prov: 2023-05-15
frÄga: 4
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"![[Pasted image 20251129235023.png]] +Proteinet pÄ bilden utför transport.
+A) Vilken klass av transportörer tillhör proteinet?
+B) Var i cellen finns det?
+C) Vilken Àr drivkraften för transporten?
+(2p) Max 30 ord.
A) En antiport.
+B) I mitokondriens inre membran.
+C) Energikvoten. Dvs fördelningen mellan ATP och ADP innanför respektive utanför mitokondriens inre membran.
kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2023-05-15
frÄga: 16
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Du Àr lite sen till bussen och behöver springa den sista biten för att inte missa den. NÀr du slÄr dig ned Àr du varm och andas hÀftigt. Det gör ocksÄ lite ont i lÄrmusklerna.
+A) Vilka metabola vÀgar aktiverades nÀr du började springa och varför?
+B) Förklara med hjÀlp av termodynamik varför du har blivit varm.
+(Max 120 ord) (3p)
2 av 3:
+A) NÀr jag började springa förbrukades energi. Glykolysen omvandlade blodglukos till pyruvat för att skapa mer ATP via citronsyracykeln, ETK och oxidativ fosforylering. Glykogen lagrat i musklerna bröts ner för att frigöra energi dÀr.
+B) NÀr ett arbete utförs kommer alltid lite av energin att gÄ till spillo och bli till kinetisk energi/vÀrme. Tack vare att alla processer i kroppen Àr uppdelade i mÄnga men mindre steg kan vi ta tillvara pÄ en större del av den tillgÀngliga energin, vi fÄr alltsÄ en större verkningsgrad Àn t.ex. en förbrÀnningsmotor. VÄr verkningsgrad Àr ca 50%, det innebÀr att hÀlften av den energi jag förbrukade nÀr jag sprang frigjordes i form av vÀrme och det var dÀrför jag blev varm.
kategory: glykolysen
prov: 2023-05-15
frÄga: 22
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"I vilka molekyler, som slutligen utsöndras med urinen, hamnar merparten av de kvÀveatomer som ingÄr i nedanstÄende tvÄ nukleosider nÀr dessa bryts ner? Ange en molekyl för respektive nukleosid. (1p)
+A) Inosin
+B) Cytidin
A) Urat.
+B) Urea.
kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2023-05-15
frÄga: 32
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Din kompis har bestÀmt sig för att utesluta fett ur sin diet med mÄlet att minska sina fettförrÄd. Du som har studerat metabolism ser en svaghet i strategin. Redogör för den svagheten pÄ molekylÀr nivÄ. (Max 75 ord) (2p)
";"AI: +Utan fett i kosten minskar tillgÄngen pÄ essentiella fettsyror och framför allt pÄ oxaloacetat, som krÀvs för att acetyl-CoA ska kunna gÄ in i citronsyracykeln. Brist pÄ kolhydrater och fett gör att oxaloacetat anvÀnds för glukoneogenes, vilket hindrar fullstÀndig fettoxidation. FettförbrÀnningen bromsas alltsÄ snarare Àn ökar, och ketonkroppar kan bildas.
+ +kategory: lipider
prov: 2023-05-15
frÄga: 26
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om kromatin stÀmmer bÀst? (1p)
+B och C
+ +kategory: kromatin
prov: 2023-05-15
frÄga: 12
";"kromatin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kromatin" +"Rangordna nedanstÄende komponenter i andningskedjan frÄn lÀgst till högst redoxpotential. (1p)
+Komponenter:
+- Coenzym Q
+- CuB
+- Cytokrom C
+- NADH
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2023-05-15
frÄga: 27
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Vilken roll spelar sigma-faktorn vid prokaryot transkription? (2p)
";"Sigmafaktorn Àr en av de 6 subenheter som ingÄr i det prokaryota polymeraset. Sigmafaktorns uppgift Àr att hjÀlpa polymeraset att snabbare hitta fram till rÀtt promotor. Polymeraset med sigmafaktorn Äker lÀngs med DNA till dess att rÀtt promotor hittas. Sigmafaktorns effekt Àr att polymeraset binder lösare till ospecifikt DNA, vilket gör att det kan glida lÀngs DNA utan att fastna pÄ fel stÀlle. Utan sigmafaktorn hade polymeraset bundit mycket starkare till ospecifikt DNA, vilket hade försvÄrat processen dÄ det hade haft problem med att glida lÀngs DNA utan att fastna pÄ fel stÀlle. NÀr sigmafaktorn vÀl hittat och bundit till rÀtt promotor kan transkriptionen börja. DÄ kommer sigmafaktorn att falla av, eftersom vi nu vill att polymeraset ska sitta fast vid DNA för att kunna utföra transkriptionen korrekt.
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2023-05-15
frÄga: 13
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"Var hittas ett GPI-ankare och vad har det för funktion? (2p)
";"Ett GPI-ankare Àr ett perifert membranprotein. Det sitter förankrat till cellmembranet via fosfatgrupper och sockerstrukturer. GPI-ankaret kan mobiliseras vÀldigt snabbt genom att klippas loss med hjÀlp av lipaser.
+Vid en synaps i t.ex. en muskel kommer transmittorsubstansen acetylkolin pÄ en impuls frisÀttas och leda till muskelkontraktion. För att kontraktionen ska upphöra mÄste acetylkolin plockas bort frÄn muskelcellens receptorer, och det sker via acetylkolinesteras. Acetylkolinesteras sitter bundet till axonterminalen via ett GPI-ankare, vilket gör att det dÄ snabbt kan frigöras och avsluta muskelkontraktionen.
kategory: cellmembran
prov: 2023-05-15
frÄga: 17
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till glykogenmetabolism Àr korrekta? (1p)
+C och D
+ +kategory: glykogen
prov: 2023-05-15
frÄga: 23
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Vilken typ av bilirubin Àr förhöjt vid hemolytisk sjukdom? (1p)
";"Det okonjugerade bilirubinet. Bilirubin Àr en hydrofob molekyl. I normala fall kommer bilirubin i levern att konjugeras med tvÄ glukuronsyra som gör att molekylen blir vattenlöslig och kan utsöndras med gallsyran. Om denna konjugering inte sker kan bilirubin inte utsöndras, och dÀrför Àr det denna variant vi kommer att se förhöjda halter av vid sjukdom.
+ +kategory: heme
prov: 2023-05-15
frÄga: 33
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende enzymer Äterfinns i citronsyracykeln? (1p)
+A och D
+ +kategory: citronsyracykeln
prov: 2023-05-15
frÄga: 24
";"citronsyracykeln";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::citronsyracykeln" +"Vilka tvÄ alternativ Àr korrekta vad gÀller 5' cap hos eukaryot mRNA? (1p)
+C och D
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2023-05-15
frÄga: 10
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::rna-syntes" +"Den vanligaste formen (konformationen) som DNA antar kallas B-DNA eller en WatsonâCrick-helix. Vilka tvĂ„ pĂ„stĂ„enden stĂ€mmer?
+B och C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2023-05-15
frÄga: 9
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Du ska labba! Beskriv fyra saker som du behöver göra innan du börjar experimentera. (2p) Max 50 ord.
";"Förbereda mig genom att lÀsa igenom labb-handledningen sÄ att jag vet vad jag ska göra.
+LÀmna ytterklÀder och vÀska och ta pÄ mig labbrock.
+TvÀtta av bÀnken med minst 75% etanol.
+Vid behov, ta pÄ mig handskar.
kategory: introduktionslaboration
prov: 2023-05-15
frÄga: 34
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"Beskriv strukturen och funktionen av aminoacyl-tRNA syntetas översiktligt samt förklara vad som sker i aminoacyl-tRNA syntetas om fel aminosyra binder till tRNA. (2p) Max 150 ord.
";"Aminoacyl-tRNA syntetas Àr ett enzym som katalyserar inbindning av en aminosyra till sin motsvarande tRNA-molekyl för att kunna nyttjas i translationen och kopplas ihop med andra aminosyror. Aminoacyl-tRNA syntetas har tvÄ olika delar som Àr avgörande för funktionen. Det finns ett active site, dit aminosyran binder för att sedan kunna lÀnkas till en OH-grupp pÄ tRNA-molekylens CCA-svans. Sedan finns ocksÄ ett editing site. Enzymet kommer att kÀnna av om kopplingen mellan aminosyran och tRNA blev rÀtt eller inte. Om det blev fel kommer editing siten direkt att spjÀlka loss aminosyran frÄn tRNA för att via active site kunna sÀtta dit en ny. Det finns en god flexibilitet hos enzymet som gör att dessa tvÄ olika delar enkelt kan samarbeta för att snabbt ÄtgÀrda ett eventuellt fel.
+ +kategory: translation
prov: 2023-05-15
frÄga: 14
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende behöver du kÀnna till för att berÀkna omsÀttningstalet för ett enzym? (1p)
+B och C
+ +kategory: enzymer
prov: 2023-05-15
frÄga: 20
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Varför Àr tillgÄng av NADPH essentiellt för ett fungerande glutationsystem? (1p) Max 50 ord.
";"Glutation Ă€r en antioxidant som reducerar reaktiva syreföreningar, ex vĂ€teperoxid till vatten. För att reaktionen ska kunna ske igen mĂ„ste glutation reduceras tillbaka till sin ursprungsform. Det Ă€r NADPH som fungerar som reduktionsmedel och oxideras till NADPâș. Utan NADPH förblir glutation oxiderat och kan inte reducera fler farliga syreradikaler.
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2023-05-15
frÄga: 30
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Coronavirus Àndrades mycket under pandemin, frÄn en ganska dödlig variant som var lagom smittsam till en variant som Àr relativt ofarlig men mycket smittsam. Beskriv hur man kan anvÀnda koncept frÄn evolutionen för att förstÄ hur detta gÄr till. (2p)
";"1 av 2:
+Med tiden har celler, organismer och hela populationer förÀndrats efter rÄdande omstÀndigheter. Miljön pÄverkar och leder till att egenskaper som Àr gynnsamma för en organisms överlevnad i den aktuella miljön kommer att bevaras medan egenskaper som inte Àr gynnsamma kommer att selekteras bort hos kommande generationer.
+Coronaviruset genomgick en sÄdan förÀndring. Till en början var viruset mindre smittsamt men hade en högre dödlighet hos de smittade. MÀnniskor kom fram med sÀtt att skydda sig mot viruset och metoder för att bli frisk om man blivit smittad. Viruset mötte motstÄnd som hotade dess fortsatta utveckling och överlevnad. Omgivningen fick alltsÄ viruset att utveckla nya egenskaper som var mer gynnsamma för att kunna fortsÀtta utvecklas och leva vidare. Det var i detta fall att bli mindre dödligt men desto mer smittsamt.
+Omgivningens selektionstryck kommer alltsÄ leda till en förÀndring hos organismen dÀr de mest fördelaktiga egenskaperna för dess överlevnad kommer att bevaras och utvecklas vidare.
kategory: evolution
prov: 2023-05-15
frÄga: 15
";"evolution";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::evolution" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden stÀmmer för ATP? (1p)
+C och D
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2023-05-15
frÄga: 21
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Beskriv översiktligt kolesterolets omsÀttning i kroppen: var det kommer ifrÄn, tvÄ viktiga funktioner och hur det kan utsöndras. (2p)
";"Kolesterol kan antingen bildas i kroppen eller intas via födan. För en person som vĂ€ger ca 70 kg och har en vĂ€sterlĂ€ndsk diet fĂ„r man i sig ca 500â700 mikrogram kolesterol via födan varje dygn och ca 50% av detta tas upp i kroppen. Syntes av kolesterol kommer att ske Ă€ndĂ„, men i vilken utstrĂ€ckning varierar beroende pĂ„ kostsammansĂ€ttningen.
+Kolesterol Àr en viktig komponent i vÄra cellmembran dÀr det pÄverkar membranets fluiditet och skyddar membranet frÄn att fluiditeten ska bli för hög eller lÄg vid temperaturförÀndringar i kroppen.
+Kolesterol utgör ocksÄ grundstrukturen i syntesen av katekolaminer i binjuren, exempelvis testosteron, testosteron och progesteron.
+NÀr kolesterol bryts ner kommer det att utsöndras gallan.
kategory: kolesterol
prov: 2023-05-15
frÄga: 31
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden om ketonkroppar Àr korrekta? (1p)
+C och D
+ +kategory: betaoxidation
prov: 2023-05-15
frÄga: 25
";"betaoxidation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::betaoxidation" +"Enzymet flap endonuclease 1 (FEN1) Àr viktigt vid eukaryot DNA-replikation. Vad gör detta enzym? (2p)
";"FEN1 Àr verksamt vid lagging strand under Okazaki fragment maturation.
+Eftersom lagging strand syntetiseras i flera sekvenser finns det flera primers med RNA inne i den nysyntetiserade strÀngen. I fÀrdigt DNA vill vi inte ha nÄgot RNA kvar, detta mÄste pÄ nÄgot sÀtt plockas bort.
+NÀr polymeraset syntetiserar ett fragment kommer det slutligen krocka in i RNA-primern som utgjorde starten för det föregÄende fragmentet. NÀr polymeraset och primern krockar kommer primern puttas bort och hÀnga som en liten svans frÄn DNA-strÀngen. DÄ Àr det FEN1 som med sin endonukleasaktivitet klipper bort primern sÄ att enbart DNA ÄterstÄr i den nya strÀngen.
kategory: dna-replikation
prov: 2023-05-15
frÄga: 11
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"De olika kolatomerna i ribos och deoxyribos numreras som 1', 2', 3', 4' och 5'. (2p)
+A) Vad skiljer ribos frÄn deoxyribos?
+B) Till vilken position Àr basen kopplad?
A) Ribos har en OH-grupp kopplad till bÄde 2Ž och 3Ž position. Deoxyribos har ocksÄ en OH-grupp vid 3Ž position, men enbart ett vÀte i 2Ž position.
+B) KvÀvebasen Àr kopplad till pentosens 1Ž position.
kategory: nukleotider
prov: 2023-05-15
frÄga: 8
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende anvÀnds som substrat för beta-galaktosidas vid blÄvit screening? (1p)
+B och D
+ +kategory: plasmid
prov: 2023-05-15
frÄga: 35
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"Para ihop aminosyrorna med en bindningstyp vardera som deras R-grupper kan delta i nÀr pH = 7. (1p)
+Aminosyror:
+- Cystein
+- Glutamat
+- Treonin
+- Tryptofan
Bindningstyper:
+- Jonbindning
+- Kovalent bindning
+- van der Waals interaktion
+- VĂ€tebindning
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2023-05-15
frÄga: 3
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Membranlipider Àr amfipatiska. Vad betyder amfipati och varför Àr det en nödvÀndig egenskap för membranlipider? (2p) Max 75 ord.
";"En molekyl som Àr amfipatisk har bÄde en hydrofob och en hydrofil del. BÄde fosfolipiderna och kolesterol Àr amfipatiska molekyler. Egenskapen gör att membranlipiderna kan orientera sig sÄ att det bildas ett dubbellager med samtliga molekylers hydrofoba delar riktade in mot varandra och membranets mitt medan dess hydrofila delar riktas mot cytoplasman respektive extracellulÀrmatrix. Amfipati Àr alltsÄ en nödvÀndig egenskap för att kunna bilda ett cellmembran som kan interagera med omgivningen och utgöra en barriÀrfunktion.
+ +kategory: cellmembran
prov: 2023-05-15
frÄga: 7
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"A) Vad kallas den kovalenta bindningen som binder ihop tvÄ monosackarider (till exempel i en di- eller trisackarid)?
+B) Ange tvÄ skÀl till varför tre hexoser kan resultera i mÄnga fler olika trisackarider Àn antalet olika tripeptider tre aminosyror kan resultera i.
+(2p) Max 100 ord.
1 av 2:
+A) Glykosidbindning.
+B) Det finns 20 proteinogena aminosyror. Dessa kan förekomma i L- och D-form efter hur de bryter ljus. I kroppen finns bara aminosyror av L-form, det innebÀr att det i kroppen endast finns 20 olika aminosyror att vÀlja mellan i skapandet av en tripeptid. Antalet möjliga kombinationer Àr begrÀnsat.
+Det finns mÄnga olika monosackarider. Dessa kan likt aminosyrorna ocksÄ förekomma i olika former, sÄ kallade stereoisomerer. Skillnaden Àr att det finns vÀldigt mÄnga fler monosackarider och fler isomerer av dessa som kan förekomma i kroppen. Det gör att det finns en större möjlig variation vid bildandet av en trisackarid.
kategory: kolhydrater
prov: 2023-05-15
frÄga: 6
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolhydrater" +"I pyruvatdehydrogenaskomplexet överförs en av reaktionsintermediÀrerna frÄn en subenhet till en annan och till det anvÀnds sidogruppen av en aminosyra kopplad med en kovalent bindning till en prostetisk grupp. (2p) Max 30 ord.
+A) Vilken aminosyra Àr lÀmplig för uppdraget och varför?
+B) Förklara kortfattat syftet med överföringen.
A) Serin. Ăr en alkohol, har OH-grupp som kan bilda vĂ€tebindning till kvĂ€veatomer hos lipoamidarmen.
+B) Acetylgrupp överförs av lipoamidarmen frÄn E1 till E2 dÀr den blir acetyl-CoA.
kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2023-05-15
frÄga: 2
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vid reduktion av syre bildas smÄ mÀngder reaktiva syreföreningar. Ange tvÄ enzymer som oskadliggör dessa. (2p) Max 10 ord.
";"kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-12-20
frÄga: 28
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Redogör för hur bakterier/anpassning av cellmembranets fluiditet kan ske via fettsyrornas egenskaper. (4p)
";"Fettsyror i cellmembran Àr amfipatiska, och har alltsÄ en polÀr del (huvud) och en opolÀr del (svans). Den opolÀra delen bestÄr av acylgrupper, som binder till varandra via VdW-krafter, vilket inte Àr sÄ starka bindningar och börjar dÀrför lossna vid vÀrmetillförsel (Àven om det inte Àr sÄ hög temperatur).
+Fluiditeten i cellmembran ökar nÀr temperaturen ökar, eftersom fettsyrorna börjar att röra pÄ sig av vÀrmeenergin. För att cellmembranet inte ska bli alltför genomslÀppligt sÄ fungerar kolesterol som en buffert som minskar pÄ rörelsen hos fettsyrorna.
+Och tvÀrtom gÀller det att nÀr temperaturen sjunker sÄ minskar fettsyrornas rörelseenergi, och de börjar att binda hÄrdare till varandra. För att cellmembranet inte ska klumpa ihop sig, och bli helt ogenomslÀppligt sÄ fungerar kolesterolet Àven hÀr som en buffert som sitter mellan fettsyrorna och sÀnker möjligheten för ihopklumpning av fettsyrorna.
kategory: cellmembran
prov: 2024-12-20
frÄga: 5
";"cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::cellmembran" +"Chymotrypsin Àr ett enzym som anvÀnder kovalent katalys, vilken lÀmnar en kovalent bunden polypeptid till ett serin i enzymet efter att peptidbindningen har spjÀlkats. Redogör för den kemiska mekanism med vilken enzymet regenereras. (4p)
";"Brevid serinet finns histidin, som en del av den katalytiska triaden (med bredvid menas endast i den katalytiska triaden, eftersom i primÀrstrukturen ligger serin och histidin inte brevid varandra). NÀr en vattenmolekyl kommer in i den katalytiska klyftan sÄ kommer histidinet att ta upp ett vÀte frÄn vattenmolekylen, vilket aktiverar syremolekylen i vattnet. Syremolekylen utför en nukleofil attack pÄ bindningen mellan serin och polypeptiden, och syret frÄn vattnet binder till polypeptiden istÀllet för serin. Detta gör att peptiden och OH-gruppen frÄn vattnet lÀmnar den katalytiska klyftan, och att histidin donerar sitt vÀte som den tog frÄn vattnet till serinet sÄ att serin ÄtergÄr till att ha en OH-grupp i sin sidokedja sÄ att enzymet regenereras till sin ursprungsform.
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-12-20
frÄga: 18
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Förklara vad som menas med att en molekyl Àr resonansstabiliserad och vad det innebÀr för molekylen. Illustrera med ett valfritt exempel. (4p) Max 30 ord. Illustrationen görs pÄ ett separat papper.
";"""MellanlÀge"" mellan enkelbindning och dubbelbindning, sÄ styrkan pÄ en resonansstabiliserad bindning Àr mellan enkelbindning och dubbelbindning. Atomer delar pÄ elektronerna, sÄ molekylen kan stabiliseras och finnas i flera konfigurationer.
+Ritning: ATP med streckade bindningar mellan PâO som visar resonans (sid 8).
+![[Pasted image 20251129235730.png]]
+ +kategory: kemiska-bindingar
prov: 2024-12-20
frÄga: 1
";"kemiska-bindingar";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kemiska-bindingar" +"Ett enzym uppvisar Michaelis-Menten kinetik, vilket gör det möjligt att bestÀmma dess Km-vÀrde. Km kan man anvÀnda för att förstÄ: (2p)
+C och D
+ +kategory: enzymer
prov: 2024-12-20
frÄga: 19
";"enzymer";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::enzymer" +"Beskriv hur triacylglycerol i fettceller bryts ner till fria fettsyror. (4p)
";"Adrenalin eller glukagon inducerar intracellulÀra reaktioner via 7TM, vilket omvandlar ATP till cAMP. cAMP aktiverar proteinkinas A, som i sin tur aktiverar perilipin. Perilipin omarrangerar TAG sÄ att ATGL kan klyva den första fettsyran (TAG blir DAG). Proteinkinas A aktiverar HS lipas som spjÀlkar den andra fettsyran (DAG till MAG). MAG lipas spjÀlkar den tredje fettsyran, sÄ att det bara blir kvar glycerol.
+ +kategory: lipider
prov: 2024-12-20
frÄga: 29
";"lipider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::lipider" +"Du ska rena ett protein med gelfiltrering. Proteinet innehÄller ocksÄ en his-tagg. (4p) Max 200 ord.
+A) Beskriv egenskaper hos proteinet och kolonnen som möjliggör rening med gelfiltrering.
+B) Beskriv vad en his-tag Àr och hur den kan anvÀndas för rening och detektion.
A) Gelfiltrening bestÄr av en fast fas med porösa kulor i en kolonn, och en mobil fas med en buffert och proteinet som ska renas. SmÄ molekyler kommer att fastna i hÄligheterna i kulorna, medan stora proteiner kommer att komma ut först. Reningsmetoden Àr alltsÄ baserad pÄ proteiners storlek.
+B) His-tagg Àr en sekvens av 6 histidin-aminosyror efter varandra. His-tagg binder starkt till nickel-joner och man kan dÀrför anvÀnda den egenskapen vid rening av proteinet. Man anvÀnder dÄ affinitetskromatografi, och renar proteinet baserat pÄ selektivitet alltsÄ en specifik egenskap. Proteinet kan sedan elueras med Imidazol, som konkurrerar ut His-taggen.
kategory: utforska-proteiner
prov: 2024-12-20
frÄga: 4
";"utforska-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::utforska-proteiner" +"Para ihop respektive molekyl med en typ av transport den kan genomgÄ. Varje alternativ fÄr enbart anvÀndas en gÄng. (2p)
+Transporttyper:
+kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-12-20
frÄga: 16
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"Vilka tvÄ av nedanstÄende pÄstÄenden stÀmmer för glukoneogenes? (2p)
+C och D
+ +kategory: glukoneogenes
prov: 2024-12-20
frÄga: 22
";"glukoneogenes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glukoneogenes" +"NÀmn en vanlig sjukdom som Àr relaterad till nedbrytning av nukleotider, samt ange vilken av de tvÄ huvudtyperna av nukleotider som har en koppling till denna sjukdom. (2p) Max 10 ord.
";"Gikt, och puriner har en koppling till sjukdomen.
+ +kategory: nukleotidnedbrytning
prov: 2024-12-20
frÄga: 32
";"nukleotidnedbrytning";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotidnedbrytning" +"Redogör för tvÄ sÀtt som metabolismen Àndras vid trÀning och hur Àndringarna leder till förbÀttrad prestation. (4p) Max 120 ord.
";"Laktat i muskeltyp IIb tas upp av hjÀrtat och av muskeltyp I, vilket gör att mÀngden laktat minskar i muskeltyp IIb sÄ att anaerob metabolism kan fortgÄ lÀngre. HjÀrtats konkurrens om glukos minskar Àven dÄ.
+Laktat tas Àven upp av levern, och omvandlas till pyruvat, och sedan till glukos som gÄr ut till blodet och tas upp av muskeltyp IIb och anvÀnds i glykolysen. Detta kallas för Coricykeln. BÄda dessa metabola vÀgar leder till förbÀttrad prestation, eftersom kroppen orkar hÄlla pÄ under lÀngre tid.
kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2024-12-20
frÄga: 26
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::integrering-av-metabolismen" +"Vilka tvĂ„ pĂ„stĂ„enden om B-DNA (WatsonâCrick helix) Ă€r korrekta? (2p)
+C och D
+ +kategory: nukleotider
prov: 2024-12-20
frÄga: 12
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om plasmidkloning Àr korrekta? (2p)
+C och D
+ +kategory: plasmid
prov: 2024-12-20
frÄga: 36
";"plasmid";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::plasmid" +"I elektrontransportkedjan förekommer steg dÀr elektrondonatorn och elektronacceptorn inte Àr bÀrare av lika mÄnga elektroner. Redogör för vad som hÀnder vid ett sÄdant steg. (4p) Max 100 ord.
";"Detta hÀnder i komplex III i elektrontransportkedjan nÀr coenzym Q ska donera 2 elektroner till cytokrom C som endast kan ta upp en elektron.
+Q-cykeln:
+QHâ kommer till Q Cytokrom C oxidoreduktas (komplex III):
+1 elektron tas upp av cytokrom C och ges till cytokrom C (elektronen transporteras till komplex IV)
+1 elektron tas upp av Q som blir Qâ»
+En annan QHâ kommer in till komplex III
+1 elektron tas upp av cytokrom C1 och ges till cytokrom C
+1 elektron tas upp av Qâ» blir till QHâ (2 Hâș tas upp frĂ„n matrix)
kategory: elektrontransportkedjan
prov: 2024-12-20
frÄga: 27
";"elektrontransportkedjan";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::elektrontransportkedjan" +"Describe the main features of the genetic code and explain their biological significance. (4p) Answer in English.
";"The genetic code is in humans stored in DNA (23 chromosome pairs). It stems from our mother and father. The DNA contains 4 different base-pairs. Adenin, Tymin, Cytosin och Guanin.
+The genetic code is not read one base-pair at a time, but rather in groups of three (i.e codons). For example AUG, ATT.
+The genetic code is also degenarative, leading to different codons being able to code for the same aminoacid. This leads to a protective function against mutations, since a mutation in a codon can lead to the same amino acid still being coded for example. The gentic code codes for all the proteins in an organism. The DNA can be transcribed into mRNA which can be translated into proteins
+ +kategory: translation
prov: 2024-12-20
frÄga: 13
";"translation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::translation" +"Gibbs fria energi möjliggör att man kan förutsÀga om en kemisk reaktion kan ske spontant. Ange vilka termer som ingÄr i formeln som beskriver förÀndringar i Gibbs fria energi. Förklara Àven hur ökad respektive minskad temperatur pÄverkar förÀndringen av Gibbs fria energi. (4p)
";"Gibbs fria energi = deltaG +Entalpi = deltaH +Temperatur = T +Entropi = deltaS
+En ökad temperatur kommer ha inverkan pÄ entropin, vilket kommer leda till att deltaG kommer bli mer negativ/gÄ mot ett lÀgre vÀrde. Den kemiska reaktionen i frÄga kommer dÄ förkjutas mot ett lÀge dÀr den kan ske spontant (kan ske spontant om delta G Àr <0)
+En minskad temperatur kommer ocksÄ ha en inverkan pÄ entropin, fast i detta fall kommer deltaG istÀlett gÄ mot ett högre vÀrde. Den kemiska reaktionen i frÄga kommer dÄ krÀva mer energi för att Àga rum.
+Temperaturen pÄverkar entropin eftersom detta Àr ett diret mÄtt pÄ molekylers/atomernas rörelseenergi.
+ +kategory: termodynamik
prov: 2024-12-20
frÄga: 17
";"termodynamik";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::termodynamik" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden relaterade till glykogenmetabolism Àr korrekta? (2p)
+C och D
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-12-20
frÄga: 23
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykogen" +"Var i cellen sker pentosfosfatvÀgen, och vilken biomolekyl, som kan anvÀndas vid reduktiv biosyntes, kan bildas i denna vÀg? (2p) Max 10 ord.
";"PentosfosfatvÀgen sker i cytosolen, och bildar NADPH.
+ +kategory: pentosfosfatvÀgen
prov: 2024-12-20
frÄga: 33
";"pentosfosfatvÀgen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::pentosfosfatvÀgen" +"Vilka av följande faktorer stimulerar glykogenolys i en skelettmuskelcell? (2p)
+A och C
+ +kategory: glykogen
prov: 2024-12-20
frÄga: 24
";"glykogen";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::glykogen" +"Vilken Ă€r den biologiska betydelsen av den 5â-cap som Ă„terfinns pĂ„ mRNA i eukaryota celler? (4p)
";"SÄ fort mRNA:et börjar komma ut frÄn RNA polymeras II, sÄ sÀtts det pÄ en guaninmolekyl pÄ 5'-Àndan via en 5'-5' bindning. Detta gör att mRNA-sekvensen inte bryts ner och att transkriptionen kan fortgÄ. NÀr transkriptionen Àr fÀrdig och mRNA-sekvensen har fÄtt sin poly(A)-svans pÄ sin 3Ž-Ànda och ska translateras sÄ krÀvs det att bÄde 5Žcap och poly(A) finns pÄ mRNA:et för att det ska kÀnnas igen av ribosomen och translateras. 5Ž-capen hÀmmar alltsÄ nedbrytning av mRNA, och möjliggör intiering av translation (tillsammas med poly(A)-svansen).
+ +kategory: rna-syntes
prov: 2024-12-20
frÄga: 10
";"rna-syntes";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::rna-syntes" +"Histonmodifieringar spelar en viktig roll i kromatinets funktion. Vilken effekt har acetylering av histoner pÄ kromatinstrukturen, och varför Àr detta viktigt för genuttryck? (4p)
";"I nukleosomen finns bland annat dubbla uppsÀttningar av H3 och H4, och dessa 4 histoner har svansar av positivt laddade aminosyror (t.ex lysin och arginin) vid sin N-terminal. Dessa aminosyror binder till fosfatgrupperna pÄ DNA:et ryggrad, eftersom fosfatgrupperna Àr negativt laddade. NÀr svansarna blir acetylerade sÄ neutraliseras de positiva laddningarna, och svansarna binder inte lika hÄrt till fosfatgrupperna. Detta möjliggör för enzymer att komma Ät DNA:et, eftersom den inte Àr sÄ hÄrt bunden till histonerna och möjliggör reglering av genuttryck (antingen mer eller mindre transkription beroende pÄ gen och vilket enzym det handlar om).
+ +kategory: dna-replikation
prov: 2024-12-20
frÄga: 9
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::dna-replikation" +"PÄ vilka tvÄ sÀtt regleras kolesterolsyntesens hastighet? (2p)
+B och C
+ +kategory: kolesterol
prov: 2024-12-20
frÄga: 34
";"kolesterol";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kolesterol" +"Hur kan man identifiera viktiga aminosyror i ett protein nÀr man bara har sekvensinformation frÄn mÄnga olika organismer att tillgÄ? (4p)
";"Sekvensanalys innebÀr att man kan identifiera viktiga aminosyror genom att jÀmföra sekvenser frÄn flera olika organismer och hitta likheter mellan organismerna. Viktiga aminosyror, t.ex den katalytiska triaden i t.ex chymotrypsin tenderar att bevaras i organismer dÀrför att det naturliga urvalet bevarar sekvenser som Àr gynnsamma för artens anpassning och överlevnad.
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-12-20
frÄga: 14
";"frÄn-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::frÄn-aminosyror-till-proteiner" +"Vilka tvÄ av följande pÄstÄenden stÀmmer för ATP? (2p)
+A och C
+ +kategory: introduktion-till-metabolismen
prov: 2024-12-20
frÄga: 20
";"introduktion-till-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktion-till-metabolismen" +"Syntes av heme beror pÄ kroppens jÀrninnehÄll. Beskriv hur hemesyntesen regleras. (4p)
";"I första steget av hemesyntesen anvÀnds enzymet ALA-syntas, och det Àr translationen av detta enzym som regleras.
+Det finns ett jÀrn-bindande protein som binder till mRNA:et som kodar för ALA-syntas vid frÄnvaro av jÀrn. NÀr det finns jÀrn sÄ binder jÀrnet till jÀrn-bindande proteinet, och fÄr det att lossna frÄn mRNA:et. DÄ kan mRNA:et translateras och ALA-syntas bildas. JÀrn sÀtts in i heme som sista steg vid syntesen, sÄ det hade varit onödigt om alla syntes-steg skedde trots att det inte finns nÄgot jÀrn.
kategory: heme
prov: 2024-12-20
frÄga: 30
";"heme";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::heme" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om jonkanaler Àr korrekta? (2p)
+A och D
+ +kategory: transport-över-cellmembran
prov: 2024-12-20
frÄga: 15
";"transport-över-cellmembran";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::transport-över-cellmembran" +"A) Förklara vad som menas med allosterisk reglering.
+B) Ge ett exempel pÄ ett enzym i glykolysen som regleras allosteriskt och redogör för hur enzymets aktivitet Àndras av regleringen.
+(4p) Max 50 ord.
A) NÀr en molekyl binder till ett annat stÀlle pÄ enzymet Àn pÄ det aktiva sÀtet och Àndrar enzymets form, vilket Àndrar dess aktivitet.
+B) Fosfofruktokinas I stimuleras vid allosterisk reglering av AMP och fruktos-2,6-bisfofat. Den hÀmmas vid allosterisk reglering av ATP och citrat.
kategory: glykolysen
prov: 2024-12-20
frÄga: 21
";"glykolysen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::glykolysen" +"NÀmn en sÄ kallad alfa-ketosyra, som via transaminering kan omvandlas till en aminosyra. Ange Àven vilken aminosyra som bildas frÄn alfa-ketosyran, vad enzymet som katalyserar reaktionen heter, samt frÄn vilken metabol vÀg alfa-ketosyran kan hÀmtas. (4p) Max 25 ord.
";"Oxaloacetat (alfaketosyra) transamineras vid deaminering av glutamat (aminosyra), och bilda aspartat (aminosyra som bildas) och alfa-ketoglutarat (alfa-ketosyran som bildas)
+Enzym: aspartataminotransferas (AST)
+Alfa-ketosyran frÄn citronsyracykeln
kategory: aminosyrametabolism
prov: 2024-12-20
frÄga: 31
";"aminosyrametabolism";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::aminosyrametabolism" +"I vilken ordning kommer glukos att stöta pÄ nedanstÄende enzymer under sin vÀg i katabolismen? (2p)
+kategory: integrering-av-metabolismen
prov: 2024-12-20
frÄga: 25
";"integrering-av-metabolismen";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::integrering-av-metabolismen" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om lac-operonet stÀmmer? (2p)
+A och C
+ +kategory: kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter
prov: 2024-12-20
frÄga: 11
";"kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::kontroll-av-genuttryck-i-prokaryoter" +"DNA-replikation Àr en noggrant reglerad process. I vilken fas av cellcykeln binder MCM-helikaset till replikationsorigin, och vilken funktion har detta komplex under replikationen? (4p)
";"MCM-helikaset binder till replikationsorigin under G1-fasen nÀr den lockas dit av ORC, och laddas av Cdc6 och Cdt1. Detta Àr möjligt under G1-fasen eftersom CDK-nivÄerna Àr lÄga.
+Under S-fasen höjs CDK-nivÄerna vilket lockar dit Gins och Cdc45, som binder till det laddade MCM-helikaset och skapar ett komplett CMG-helikas som kan börja öppna upp dubbelstrÀngen. Replikationen sker under S-fasen, och det möjliggörs alltsÄ av de höga nivÄerna av CDK, vilket sÀkerstÀller att replikationen endast sker en gÄng under cellcykeln. Helikaset Àr ett motorprotein som glider lÀngs med DNA-ryggraden av fosfatgrupper och bryter vÀtebindningarna mellan kvÀvebaserna genom hydrolys av ATP.
kategory: dna-replikation
prov: 2024-12-20
frÄga: 8
";"dna-replikation";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::dna-replikation" +"Du jĂ€mför ny kolesterolsĂ€nkande tablett mot standardbehandling. Efter tre mĂ„nader görs t-test: p = 0,02, 95% KI för skillnaden 0,5â1,7 mmol/L.
+A) Formulera nollhypotes och alternativhypotes.
+B) Vilka slutsatser kan dras baserat pÄ p-vÀrdet och konfidensintervallet? (4p)
A) Nollhypotes: Det finns ingen skilland mellan blodtryckssÀnkningen om standradbehandling eller den nya tabletten anvÀnds
+Alternativ hypotes: Det finns en skilland mellan blodtryckssÀnkningen om standradbehandling eller den nya tabletten anvÀnds
+B) Testet visar statistisk signifikans, eftersom p-vÀrdet Àr lÀgre Àn 0,05 och konfidensintervallet inte innehÄller siffran noll. Nollhypotesen kan dÀrför förkastas.
kategory: introduktionslaboration
prov: 2024-12-20
frÄga: 35
";"introduktionslaboration";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::introduktionslaboration" +"A) Define cooperativity in the context of hemoglobin and myoglobin.
+B) Give an example where cooperativity is beneficial and explain how it is beneficial. (4p) Max 100 words. Answer in English.
A) Coopertivity means that once one hemegroup in hemoglobin binds to one oxygen molecule, it makes it easier to other oxygen molecules to bind in to the other hemegroups in the same hemoglobin molecule. Even when one oxygen molecule gets released from heme, it fascilitates for other oxygen molecules to get released.
+B) In hemoglobin there are 4 hememolecules, and each one of them can bind to one oxygen. In the lungs, the partial pressure of oxygen is high, which encourage hemoglobin to bind to oxygen. Coopevtivity here is benificial because it makes the oxygen transport in the body effective.
kategory: hemoglobin
prov: 2024-12-20
frÄga: 3
";"hemoglobin";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::hemoglobin" +"Vilka tvÄ pÄstÄenden om nukleotider Àr korrekta? (2p)
+A och C
+ +kategory: nukleotider
prov: 2024-12-20
frÄga: 7
";"nukleotider";"Biokemi::Johan D - TentafrÄgor::nukleotider" +"Förklara kortfattat likheter och skillnader mellan glukos, glukopyranos och N-acetylglukosamin pÄ strukturell/molekylÀr nivÄ. (4p)
";"3 av 4 poÀng:
+LinjÀr glukos blir cirkulÀr genom att aldehydgruppen pÄ kol 1 binder till kol 5. Glukopyranos bildas genom att en aldehydgrupp pÄ en molekyl binder till en hydroxylgrupp pÄ en annan molekyl. Likheten Àr alltsÄ att bÄda Àr cirkulÀra, men att antalet molekyler Àr olika.
+N-acetylglukosamin Àr en glukosmolekyl, som Àr bunden till en acetylamingrupp. Acetylamingruppen Àr bunden till glukoset via sitt kvÀve. Likheten Àr alltsÄ att glukos och N-acetylglukosamin bÄda innehÄller glukos, men att N-acetylglukosamin Àven innehÄller en acetylamingrupp.
kategory: kolhydrater
prov: 2024-12-20
frÄga: 6
";"kolhydrater";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::kolhydrater" +"En aminosyra har en sidogrupp bestĂ„ende av en aminogrupp och en kedja med fyra CHâ-grupper.
+A) Vilken Àr aminosyran?
+B) Ange tvÄ egenskaper aminosyran har.
+C) Rita upp aminosyran vid pH = 2.
+(4p) Max 30 ord. Uppgift C pÄ separat papper.
A) Lysin
+B) Basisk, kan ta upp en Hâș vid lĂ„gt pH. Fungerar i vissa enzymkomplex som en arm som flyttar prostetisk grupp mellan enzymer, t.ex lipoamiden i pyruvatdehydrogenaskomplexet.
Ritning: Lysin vid pH 2, fullstÀndigt protonerad (sid 12). +![[Pasted image 20251129235808.png]]
+ +kategory: frÄn-aminosyror-till-proteiner
prov: 2024-12-20
frÄga: 2
";"frĂ„n-aminosyror-till-proteiner";"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::frĂ„n-aminosyror-till-proteiner" diff --git a/wip/extract-provfrĂ„ga.py b/wip/extract-provfrĂ„ga.py index 9451847..34d21c8 100644 --- a/wip/extract-provfrĂ„ga.py +++ b/wip/extract-provfrĂ„ga.py @@ -145,10 +145,15 @@ def main(root: Path, out: Path, mode: str = "anki"): # second column contains the rendered answer followed by metadata HTML details = answer_html + "\n\n" + meta_html - rows.append((question_html, details, category)) + # construct Anki deck name: use category if present, otherwise fallback to 'FĂRELĂSNING' + deck_suffix = category if category else "FĂRELĂSNING" + deck_name = f"Biokemi::Johan D - TentafrĂ„gor::{deck_suffix}" + # For Anki export, include deck as first column + rows.append((question_html, details, category, deck_name)) # write CSV with semicolon delimiter out.parent.mkdir(parents=True, exist_ok=True) with out.open("w", encoding="utf-8", newline="") as f: + f.write("#deck column 4\n") writer = csv.writer(f, delimiter=";", quoting=csv.QUOTE_ALL) # If exporting for Excel, add a header row matching the columns if mode == "excel":